简述慢性乙型肝炎患者中HBV DNA和RNA的关系

文摘   2024-11-28 11:50   湖南  





前基因组HBV RNA是cccDNA的转录产物,不能被NA直接抑制。血清HBV RNA在未治疗和接受NA治疗的患者中均能很好地反映肝内HBV RNA。超过75%的无法检测到HBV DNA的NA抑制患者在治疗2年后仍可检测到可量化的血清HBV RNA。与肝硬化患者相比,肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者的HBV DNA(2.4 log vs. 0.0 log IU/ml)和HBV RNA(3.1 log vs. 2.0 log copies/ml)水平明显较高。这些强调HBV RNA作为病毒标志物的潜在重要性,表明尽管NA完全抑制HBV DNA,但cccDNA转录活性持续存在。


虽然在HBV RNA被推荐为HBV治疗终点的一个组成部分之前,还需要解决一些问题。(首先,商业化的标准化检测必须在诊所可用。其次,必须消除可检测HBV DNA的混杂效应。第三,需要解决无法检测到的HBV RNA是否会在停止治疗后改善疾病缓解的可持续性。)尽管如此,迄今为止发表的数据表明,如果在持续抗病毒治疗中除了HBV DNA外,还完全抑制HBV RNA可以进一步降低HCC的风险,那么在有限的HBV治愈药物可用之前,它可能成为一个新的治疗目标。


随着对HBV RNA的深入研究以及对其临床应用价值的探索,慢乙肝患者中HBV DNA和RNA的关系一直是相关工作者关注的问题。2024年8月发表在国际期刊Liver International上的一篇文章做了相关研究。


该研究应用数字PCR技术对HBV基因组3个区域的HBV RNA和HBV DNA进行定量分析。结果表明,HBV RNA水平与HBV DNA水平密切相关(图1A),慢性感染者血清中HBV RNA水平在Core区高于S区和X区(p<.0001),而HBV DNA水平显示出相反的梯度(p<.001)(图1B)。这与RNA酶H在3′ → 5′方向上降解RNA相吻合,而RNA酶H的降解与DNA合成平行。这也与先前报道的病毒颗粒中存在HBV RNA的3 '截短体一致。总HBV核酸(DNA + RNA)水平未显示任何梯度。


图1 (A)Core区、S区和X区HBV DNA和RNA血清浓度的相关性。(B)针对Core、S和X的数字PCR测量的HBV DNA和RNA水平的逆梯度。DNA和RNA的比率Core/S和S/X以及相应的p值


Core区定量核酸平均80%为DNA,Core区DNA/RNA比值与病毒载量和基因型有关。研究还表明,pgRNA在约75%的病毒颗粒中完全逆转录为负链DNA,而其余25%的病毒颗粒中同时含有RNA和DNA。在接受或未接受抗病毒治疗的患者中观察到RNA水平的差异取决于靶区域。DNA与RNA的比例也取决于靶区域。DNA和RNA水平之间的比值在X区域最大,在S区域居中,在核心区域较低。此外,HBV RNA梯度随着时间的推移保持稳定,并与HBV基因型相关。


随着时间的推移,HBV RNA模式仍然存在(图2)。核心DNA和核心RNA的比值反映了逆转录病毒(DNA)或RNA在核苷酸2367- 2448的核心PCR区域以外进行的病毒颗粒的比例。该比值与血清中HBV DNA水平相关(r= 0.15,p= 0.001),并且D基因型高于非D基因型(p= 0.006)。基因型之间的序列差异可能会影响RNase H的酶活性或改变pgRNA的二级结构,从而间接影响逆转录速率或RNase H活性。


图2 HBV RNA梯度随着时间的推移保持稳定,并与HBV基因型相关


小结

血清中HBV RNA在很大程度上反映了逆转录不完全和RNase H降解,HBV颗粒中的基因组不完全是DNA或RNA,可能同时包含两种核酸。RNA和DNA水平呈反向梯度,并且这些梯度的模式在个体患者中随时间保持稳定。无论靶区如何,DNA比例都占主导地位:X区96%,S区92%,Core区80%。类似的研究表明,在未经治疗的CHB患者中,HBV pgRNA已被证明以低于HBV DNA约1-2个对数循环。慢性感染者血清中HBV RNA水平在Core区最高。因此,HBV RNA检测试剂的靶区设计在Core区无疑是好的选择,高灵敏的HBV RNA检测试剂具有更高的应用价值。


参考文献

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撰写 | 马兴焕 

校稿 编审 | 韩剑锋 缪为民 刘娟

编辑 | 谭易秋子


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