背景
急性呼吸道感染（ARI）是临床实践中最常见的传染病之一，并且是全球5岁以下儿童死亡的主要原因之一。病毒和非典型病原体是ARI的主要致病因素。其中，甲型流感病毒（IAV）、乙型流感病毒（IBV）、呼吸道合胞病毒（RSV）、人类鼻病毒（HRV）和腺病毒（ADV）是最常见的病毒病原体。除了病毒，肺炎支原体（Mp）也是影响儿童的主要非典型病原体。由于这些病原体传播迅速且广泛，ARI有可能引发大规模疫情，对全球公共健康构成重大威胁。另外，COVID-19、流感及其他呼吸道传染病的同时发生及相互影响可能给临床诊断和治疗带来挑战。这种情况也增加了流行病管理的复杂性，扩大了鉴别诊断难度。因此，及时了解呼吸道病原体流行病学变化及ARI的病原体谱系对于指导未来防控策略至关重要。
主要研究内容
该研究旨在阐明COVID-19大流行后ARI的动态变化，并为未来不同季节ARI的防控提供重要见解。该研究招募了2022年8月至2023年12月期间在上海交通大学医学院附属仁济医院宁波医院（宁波市杭州湾医院）就诊并出现急性呼吸道感染相关症状（鼻部症状、呼吸道症状、体温> 37.5℃）的疑似急性呼吸道感染患者，并收集患者鼻咽样本。应用多重实时荧光PCR平台和圣湘生物呼吸道感染病原体诊断试剂对样本中的IAV、IBV、RSV、HRV、ADV、Mp和SARS-CoV-2 等7种病原体进行检测。根据临床症状、白细胞计数和炎症标志物检测结果诊断呼吸系统疾病。
关键结果
1. COVID-19大流行后呼吸道病原体流行病学特征
该研究招募了11124例疑似急性呼吸道感染患者，其中7410人(66.6%)为门诊或急诊就诊患者，3714人(33.4%)为住院患者。0-18岁患者2558人(23%)；19-59岁6718人(60.4%)；60岁以上1848人(16.6%)。男性占53.5%(5951/11，124)。
1）呼吸道病原体总体阳性检出率高达56.9%，甲型流感病毒为主要流行病原体
COVID-19大流行后，呼吸道病原体的总体阳性检出率（PR）为56.9%(6334/11，124)。IAV为主要的流行病原体(52.1%，4216/8088)，其次是Mp(21.2%，547/2578)和SARS-CoV-2(11.6%，991/8546)。
2023年各病原体的总体阳性检出率
2）不同病原体流行时间存在差异
22年8月-23年12月间7种病原体流行时间随时间变化存在波动。
甲型流感病毒（IAV）在春季和冬季流行：2023年，IAV引发了两次疫情。年初IAV的阳性检出率逐渐上升，3月达到峰值52.0%（105/202），之后逐月下降。第二次疫情发生于年底，12月时阳性检出率最高达到72.2%（2926/4051）。
新型冠状病毒（SARS-CoV-2）：SARS-CoV-2的流行在2023年2月略有下降，但随后出现复苏，在5月阳性检出率达到56.3%（381/677）的峰值，之后逐渐下降。
肺炎支原体（Mp）秋冬季流行：Mp于2022年9月开始流行（35.2%，19/54），并持续至23年1月（41.7%，15/36）。在IAV疫情期间，Mp的阳性检出率在2月迅速下降，之后逐渐上升。
呼吸道合胞病毒（RSV）：RSV在2023年4月和8月出现了两个小高峰，阳性检出率分别为22.4%（47/210）和17.6%（45/256）。
人类鼻病毒（HRV）：HRV在前八个月的流行率较低，最后四个月逐渐增加。
腺病毒（ADV）和乙型流感病毒（IBV）在2023年的流行率维持在较低水平。
2022年8月至2023年12月7种呼吸道病原体流行病学趋势
N：每月疑似急性呼吸道感染的人数。PR：病原体的总体阳性检出率。*: 2022年，COVID-19疑似患者被排除在该研究之外。
3）不同年龄人群病原体流行模式存在差异
≥60岁老年人群：SARS-CoV-2(29.4%，364/1237)和IAV(15.7%，128/817)的流行率较高，其他病原体的流行率均低于3%；
19-59岁人群：IAV(66.3%，3342/5038)为主要病原体，其余病原体流行率均低于10%；
0-18岁人群：Mp(36.0%，524/1472)和IAV(35.3%，788/2233)是主要病原体。HRV(14.5%，214/1472)、RSV(12.8%，189/1472)和SARS-CoV-2(11.0%，120/1086)的流行率均超过10%。
2023年各病原体在不同年龄组（0-18，19-59和≥60）的阳性检出率
将0-18岁年龄组进一步细分为三个子组
12-18岁青少年：与19-59岁组较为相似，IAV（64.0%）为主要病原体，但Mp的流行率相对较高（38.2%，26/68）。
6-11岁儿童：Mp为主要病原体(53.6%，267/498)，其次是IAV（27.9%，162/581）、SARS-CoV-2(19.0%，30/158)和HRV（13.7%，68/498）。
0-5岁幼儿中：Mp(21.4%，194/906)、RSV(18.9%，171/906)、SARS-CoV-2（18.3%，21/115）、HRV（15.3%，139/906）和IAV（14.9%，144/964）均较为流行。
2023年各病原体在不同年龄子组（0-5，6-11和12-18岁）的阳性检出率
2. 与COVID-19大流行期间相比，甲型流感病毒流行率显著上升
在COVID-19大流行期间，该院IAV流行率为4.6%，其所在浙江省IAV流行率为4.56%，中国南方其他地区的IAV流行率也相对较低，从0.049%到17.5%不等。然而，COVID-19大流行后，该院IAV流行率显著上升，达到了52.1%。而其他病原体，包括BV、ADV、HRV、Mp 和RSV，显示出与2022年相似的流行率。
COVID-19大流行期间中国部分地区呼吸道病原体的流行病学数据
3. 甲型流感病毒和肺炎支原体为2023年ARI患者的主要病因
该研究重点对6334名ARI患者进行分析，研究发现，IAV和Mp为2023年ARI的主要病因（如下表所示），分别占76.5%(4216/5513)和43.5%(547/1257)。
不同年龄段ARI患者病因存在差异
≥60岁老年患者：SARS-CoV-2是重要病因，占比82.5%（364/441）（P < 0.001）；
19-59岁患者：甲型流感病毒是重要病因（88.6%，3342/3772），其次是Mp（25.6%，45/176）；
0-18岁患者：Mp、IAV和HRV是重要病因(P < 0.05)，分别占49.4%(487/985)、48.6%(746/1535)和21.7%(214/985)。另外IAV和IBV在5岁以上的儿童中是重要病因（P < 0.001），而Mp和RSV在5岁以下的儿童中是重要病因（P < 0.001）。SARS-CoV-2在12至18岁的儿童中更具致病性（P < 0.001）。
4. ARI患者共感染特征——Mp是ARI患者最常见的共感染病原体
ARI患者存在共感染情况，包括2种、3种、甚至4种病原体同时导致的感染，其中2种病原体的共感染占主导地位，占10.9%（179/1638），平均共感染率为3.9%（244/6334）。
不同年龄段共感染率存在差异，其中0-18岁患者最高，为12.3%（202/1638）（P < 0.05），19-59岁最低，仅为0.9%（36/4157）。
Mp是ARI病例中最常见的共感染病原体，占共感染的31.0%（195/635），其次是IAV（26.1%，166/635）和HRV（23.3%，148/635）。而SARS-CoV-2的共感染率最低，仅为1.0%（6/635）。
急性呼吸道感染患者多种病原体的混合感染率
重点回顾
疫情后病原体整体阳性检出率增加至56.9%，高于疫情前的水平。
IAV、SARS-CoV-2和Mp的流行率在不同季节出现显著波动。IAV在春季和冬季表现为主要病原体，Mp在秋冬季节较为流行，而SARS-CoV-2在夏季有显著上升。
IAV的流行率在疫情后显著上升至52.1%，而其他病原体的流行率与2022年相比保持相对稳定。
不同年龄组的病原体流行病学差异显著。在0-18岁的人群中，Mp（36.0%）和IAV（35.3%）是主要病原体。中年和年轻成人对IAV（66.3%）表现出更高的易感性，而老年人群对SARS-CoV-2（29.4%）则更为敏感。
Mp是最常见的共同感染病原体，占所有共同感染的31.0%。
撰写 | 师朵芝
校稿 编审 | 单一鸣
编辑 | 谭易秋子
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