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结
果
作者使用实时定量PCR(qPCR)来研究ZAT5在4 DPA(开花后的天数)发育种子中以及7、10和13 DPA后种皮中的表达(图1A)。在这4个时间点均检测到ZAT5转录本。ZAT5的表达水平在7-10 DPA之间达到最高水平。为了检测ZAT5的组织特异性表达,在发育中的种子外皮表皮细胞以及在10至13 DPA阶段从种皮表皮细胞释放的粘液中检测到了强GUS信号(图1B-1E)。进一步将GUS信号定位在10和13 DAP发育种子的部分。结果显示两个阶段的合点区种皮、种皮表皮细胞、胚和外胚乳中均存在清晰的信号(图1F,1G)。为更精细确定ZAT5的表达,作者进行了原位杂交测定。ZAT5在7至10 DPA时在种皮表皮细胞中强烈表达,在13 DPA时表达更多。在10至13 DPA时,还在胚和外胚乳中检测到ZAT5转录本(图1H),表明ZAT5在发育中的种子中广泛表达。
(A) qPCR分析。(B-G) 在ProZAT5:GUS转基因拟南芥组织不同阶段的GUS活性组织化学分析。(H) 原位杂交。
ZAT5属于C2H2型锌指蛋白(ZFP)家族的C1-2i亚类,该家族是植物中最大的TF家族之一。亚细胞定位结果显示ZAT5-GFP融合信号主要在细胞核中被观察到,表明ZAT5是核蛋白(图S4)。为了确定ZAT5是否影响种皮粘液形成,作者获得了的两个独立纯合突变等位基因(SAIL_13_H11和SALK_048250),二者的ZAT5编码区均包含T-DNA插入,并将这两个纯合系命名为zat5-1和zat5-2。利用RT-PCR来鉴定突变体,三对引物均未获得扩增(图2B),因此,zat5-1和zat5-2是无效突变体。
使用钌红(RR)染色检测zat5-1和zat5-2突变体的种子粘液表型。当种子在水中不摇动的情况下染色时,突变体和野生型(WT)没有明显差异。然而,在水中以200 rpm摇动种子2小时后,zat5-1和zat5-2种子粘液的染色晕圈与WT相比更薄,体积也显著减小(图2C,2D)。通过用ProZAT5:ZAT5构建体转化zat5可以改善粘液变薄这一表型,表明粘液缺陷可能是由ZAT5突变引起的。作者进一步将zat5突变体(母本)和WT(父本)杂交以产生F1种子,观察其表现与zat5突变体的粘液表型相似。为进一步研究zat5粘液缺陷是否是由种皮分化异常引起的,使用扫描电子显微镜观察种皮表面,zat5与WT种皮的形态没有观察到明显的差异(图S6)。
图S4. ZAT5在烟草细胞中的亚细胞定位。
作者接着用高效液相色谱(HPLC)测定发现,zat5突变体和WT种子粘液具有相似的单糖组成,并且用水或EDTA溶解的材料中存在的总糖没有显着差异(表1)。这些结果表明ZAT5对种子产生粘液多糖的量和组成没有明显影响。
3.zat5粘液中果胶甲酯化和PME活性发生改变
4.ZAT5下调PME5、HMS/PME6、PME12和PME16
(A) PME基因在野生型和转基因植株的7~10 DPA种皮中的相对表达量。(B) 双荧光素酶实验中使用的载体。(C) 相对LUC/REN比值。
5.ZAT5在体内和体外识别TGATCA元件
通过染色质免疫沉淀(ChIP)实验以确定ZAT5是否在体内直接调控PME基因。在PME基因启动子上设计了5对引物,使其能够被ChIP-qPCR检测到(图5H)。结果显示PME启动子中的所有片段均显著富集MYC抗体(图5I-5L),表明ZAT5在植物中是与这些序列结合的。结合PME基因的表达在zat5突变体中上调,但在过表达ZAT5的植物中下调(图4A)。作者合理推测PME5、HMS/PME6、PME12和PME16的表达通过ZAT5与其启动子中的TGATCA元件的结合而受到抑制。
图5. ZAT5直接靶向PME5、HMS/PME6、PME12和PME16。
作者创制了PME5、HMS/PME6、PME12和PME16的T-DNA插入突变体。RT-qPCR鉴定出pme6是一种敲除突变体。对在水中摇动的种子进行RR染色显示,所有pme突变体似乎都具有较薄的粘液表型。测量了去粘液种子和种子粘液的体积表明,去粘液种子的相对体积没有显著差异,而pme突变体的AM层体积相对于WT有所减少(图6)。为了进一步观察突变体的粘液表型,我们将pme突变体(母本)和WT(父本)杂交以产生F1种子。F1种子和pme突变体的RR粘液表型相似(图6)。因此,每个pme突变体与WT的杂交表明pme粘液表型是种皮缺陷的结果。与WT相比,在pme5-1、pme6、pme12-1和pme16突变体中,粘液的HG DM显著增加,并且7至10 DPA种皮中的PME活性降低(图3A,3B)。与WT相比,JIM5和JIM7免疫标记pme种子的强度分别在射线结构之间和外粘液外缘之间的区域增加,而CCRC-M38的标记强度沿着AM层的射线结构略有下降(图7),并且ELISA定量结果与免疫荧光结果一致。总的来说,这些果胶甲酯化酶参与种子粘液果胶去甲酯化。
作者创制一系列双突变体(zat5-1 pme5-1、zat5-1 pme6、zat5-1 pme12-1和zat5-1 pme16),并观察了它们种子粘液的表型(图6)。这些双突变体中的粘液圈厚度与WT无显著差异。因此,zat5-1突变体中的PME5、HMS/PME6、PME12和PME16各自的突变弥补了zat5粘液缺陷。总之,遗传证据表明,ZAT5通过直接抑制PME5、HMS/PME6、PME12和PME16的表达来调节果胶去甲基酯化。
图6. 遗传分析表明ZAT5调控PME5、6、12和16。
图7. 用JIM5、JIM7、CCRC-M38单克隆抗体对pme5、pme6、pme12和pme16种子进行免疫标记。
qPCR和双荧光素酶活性数据显示ZAT5可能间接抑制PME58的表达,结合先前的研究表明BLH2和BLH4冗余地激活PME58表达以调控果胶去甲基酯化,促使作者探究ZAT5与BLH2/4之间的关系。ZAT5的表达在blh2、blh4和blh2 blh4中显著增加。与WT相比,zat5突变体中BLH2和BLH4的表达增加(图8A)。因此,ZAT5和BLH2/4可能会抑制彼此的转录或阻止彼此正常发挥作用。
体外下拉实验(pull-down)表明,ZAT5和BLH2存在物理相互作用(图8B)。体内免疫共沉淀(Co-IP)再次表明,ZAT5与BLH2和BLH4发生物理相互作用(图8C,8D)。
为了确定ZAT5和BLH2/4之间的相互作用是否影响了ZAT5与PME5、PME6、PME12和PME16的结合能力,作者进行了EMSA检测。ZAT5可以识别标记PME5、6、12、16的TGATCA基序的探针,BLH2则不能(图8E-8H)。通过添加GST-BLH2融合蛋白的剂量确实减少了ZAT5与这些探针的结合(图8E-8H)。同样,BLH2与PME58的结合通过增加ZAT5的数量而被抑制(图8I)。这些结果表明,ZAT5和BLH2/4相互抑制对方的活性,且呈剂量依赖型的。
为了进一步了解ZAT5和BLH2/4在调节果胶DM过程中的关系,作者将zat5-1与blh2 blh4杂交,得到zat5-1 blh2 blh4三重突变体(图9)。zat5-1和blh2 blh4突变体种子的粘液层较WT明显减少,而zat5-1 blh2 blh4的种子粘液层与zat5-1相似,但较WT薄,较blh2 blh4厚(图9C,9D)。此外,与WT相比,zat5-1 blh2 blh4三突变体的PME活性降低,HG DM增加。ZAT5突变可以部分恢复blh2 blh4突变体的表型缺陷。
该研究表明,ZAT5和BLH2/4通过同一途径相互拮抗调控种子黏液中的果胶DM。
(A) 野生型与突变体种子的粘液表型。(B) AM层相对粘液厚度。(C) 突变体与WT相比的相对PME活性。(D) 野生型和突变体粘液中释放的甲醇含量。
总
结
期刊:The Plant Cell
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