背
景
蛋白质作为细胞过程的主要执行者,其功能状态往往通过转录组分析间接反映。然而,在多种癌症中,mRNA表达水平与蛋白质表达水平之间的相关性并不完全一致。磷酸化蛋白质组学提供了一个独特的视角,能够全面观察到活跃的信号传导途径,而这些在转录组学研究中往往是不可见的。在急性髓系白血病(AML)的研究中,尽管基因组和转录组已经被广泛研究,但对蛋白质组和磷酸化蛋白质组的深入研究相对较少,却已经展现出了重要的研究价值和潜力。
方
法
结
果
图1. AML的蛋白质组学特征。
图2. AML蛋白质组学全局分析。
图3.IDH1/2突变与KDM4A/B/C组蛋白去甲基酶的丰度增加有关。
图4.突变的NPMc蛋白与几种核输入蛋白丰度的增加(以及与物理相互作用)相关。
图5.CD180和MRC1/CD206在AML细胞上表达,而在正常CD34细胞上不表达。
图6. AML细胞的磷酸化蛋白质组学图谱。
图7 与特定突变相关的AML样本的磷酸化蛋白质组学分析。
结
论
本研究基于LAML TCGA数据集,精选了44例具有代表性的AML患者样本和6例健康骨髓样本,构建了一个全面的深度蛋白质组和磷酸化蛋白质组数据库。该数据库含有丰富的蛋白质组学信息,涵盖了转录后调控的蛋白质表达水平、AML免疫治疗潜在靶点的细胞表面标志物,以及与AML发病机制密切相关的信号通路磷酸化修饰变化。这些信息为急性髓系白血病的进一步研究提供了重要的数据支持和参考依据。
参
文
考
献
Kramer MH, Zhang Q, Sprung R, et al. Proteomic and phosphoproteomic landscapes of acute myeloid leukemia. Blood. 2022;140(13):1533-1548. doi:10.1182/blood.2022016033
感谢浙江省人民医院输血科来稿!
公众号|输血人
本期编译|方奕霖,王震
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