背
景
Er 血型系统最近被证明是由 PIEZO1 基因定义的。该系统包括高流行率抗原 Era、Er3、ERSA 和 ERAMA,以及低流行率抗原 Erb。Era/Erb 是对立的,由 ERB 等位基因 [c.7180G>A p. (Gly2394Ser)] 定义。无义突变 c.5289C>G p. (Tyr1763) 与预测的 Er null 表型相关,而错义突变 c.7174G>A p. (Glu2392Lys) 导致 Era 和 Erb 表达的丧失。
方
案
研究人员对四个 Er (a−) 个体进行了全基因组测序(WGS)和Sanger测序,并使用 AlphaFold2 创建的 Piezo1 预测 3D 结构可视化了预测蛋白质变化的位置和结构差异。
结
果
表1 本研究先证者的血型血清学检测表型结果。
表2 本研究先证者的血型基因检测结果。
图1 已知和新突变的Piezo1-AlphaFold2结构建模 (A-B)
(A)通过将Piezo1单体的AlphaFold 3-D模型与小鼠同源三聚体结构(PDB:6B3R)对齐而创建的Piezo1同源三聚体模型。三个亚基相互作用的核心区域用黑色圆圈标记。
(B) 一个亚基的帽盖区域的特写视图,显示了Era/Erb(红色)、Er3(蓝色)、ERSA(橙色)和ERAMA(粉红色)的已知Piezo1氨基酸位置。
图1 已知和新突变的Piezo1-AlphaFold2结构建模 (C-G)
(C-F)包含Era/Erb和Er3抗原的环结构特写。
(G) 使用 AlphaFold2 预测的局部距离差异测试(pLDDT)对帽区的每个残基置信度估计。
结
论
本研究鉴定出了三种新的 PIEZO1 等位基因,包括一个预测的 Er null 和两个错义突变。结构模型表明,错义突变可能会改变 Era/Erb 表位的表达。
参
文
考
献
Lane WJ, Vege S, Mah HH, Ochoa-Garay G, Lomas-Francis C, Westhoff CM. Three novel Er blood group system alleles and insights from protein modeling. Transfusion. Published online July 25, 2024. doi:10.1111/trf.17965
感谢浙江省人民医院输血科来稿!
公众号|输血人
本期编译|杜垚强,陈秉宇
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