MET 14号外显子跳跃突变NSCLC分子特征

学术   2024-11-28 18:00   北京  
整理:肿瘤资讯
来源:肿瘤资讯

MET 14号外显子跳跃突变(METex14+)是NSCLC一种相对罕见的驱动基因改变。然而,METex14+患者具有很高的异质性,对不同治疗方案反应各异。因此,本研究旨在探索METex14+ NSCLC的异质性,以促进利用其分子谱和异质性指导最佳治疗。相关结果已于2024年10月发表于Lung Cancer杂志(IF=4.5),本文对此进行简要解读和分享,希望能为医务工作者提供新的科研和临床参考,造福更多肺癌患者。

背景

MET 14号外显子跳跃突变(METex14+)是非小细胞肺癌(NSCLC)中一个独特的亚群,占非鳞NSCLC的2 - 4%。在流行病学上,世界范围内METex14+ NSCLC的发生频率相似,北美为2.5%,欧洲为2.0%,亚洲为1.7%。就其病理生理影响而言,METex14+通过产生Casitas B-Lineage淋巴瘤原癌基因E3(CBL)蛋白结合位点Y1003,从而损害MET蛋白降解并导致MET通路异常激活。既往研究报道METex14+ NSCLC患者往往比其他驱动基因突变的NSCLC患者年龄更大(通常在65岁左右),且多为女性。虽然更常见于肺腺癌,但METex14+也可见于鳞癌和有吸烟史的患者,这与许多其他可靶向的驱动基因不同。
 
目前,FDA已批准了多种酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)靶向METex14+。然而,METex14+ NSCLC患者对TKIs的反应并不一致。此外,一些METex14+ NSCLC患者对免疫治疗(IO)反应良好,而另一些患者的获益有限。本研究旨在组织学背景下描述METex14+ NSCLC的异质性,以促进利用其分子谱和异质性指导最佳治疗。

结果

在28,739例NSCLC标本中有711例(2.5%)通过RNA测序检出METex14+;老年患者(中位年龄:77岁,p < 0.0001)和女性患者(56%, q < 0.001;表1)检出率相对更高。非鳞癌(66.7% vs 62.7%)和腺鳞癌(3.4% vs 0.9%)检出METex14+的频率也更高(表2)。

表1、入组患者基线特征

表2、对比不同组织学类型和临床特征的METex14+检出率

在639/711例(89.9%)患者中检出MET的共突变。正如预期的那样,METex14+通常与其他驱动基因突变互斥。POT1突变在METex14+肿瘤中富集,与组织学无关。与METex14-非鳞癌相比,METex14+非鳞癌中BRCA2(3.64 vs 1.47%)突变富集,而NF1(4.58 vs 8.92%)、KRAS(2.75 vs 37.04%)、ARID1A(2.54 vs 6.04%)和APC(0.63 vs 3.04%)突变(图1A)检出率降低。同样,与METex14-鳞癌相比,METex14+鳞癌中KMT2D(2.74 vs 18.22%)突变检出率降低,CASP8(5.26 vs 0.71%)富集。与METex14-肿瘤相比,MDM2、HMGA2和CDK4扩增在METex14+肿瘤中富集,且与组织学类型无关(图1B)。然而,LGR5(7.26 vs 0.69%)、WIF1(6.5 vs 0.81%)、LRIG3(3.97 vs 0.00 %)和MET(3.46 vs 0.91%)扩增仅在METex14+ 非鳞癌中富集。

图1、对比不同组织学类型和METex14状态NSCLC中共突变(A)和扩增(B)检出率

METex14+肿瘤中TMB-H和TP53突变发生率较低,与组织学类型无关。KEAP1(2.1 vs 14.7%)和STK11(0.8 vs 17.1%)突变仅在METex14+非鳞癌中减少(图2A)。TP53突变在METex14+非鳞癌中富集(45.9% vs 17.3%),表明基于METex14+状态的TP53突变与组织学有明显关联。METex14+肿瘤具有较高的PD-L1+发生率,与组织学无关(图2A和2B)。使用T细胞炎症评分描述研究队列的炎症状态,仅在METex14+非鳞癌中观察到较高百分比的炎症肿瘤(图2C)。

HAVCR2、CD86、CD80、CTLA4和PDCD1LG2在METex14+肿瘤中独立表达上调,而CD274(1.56倍)、IDO1(1.46倍)、LAG3(1.15倍)、IFNG(1.51倍)和PDCD1(1.39倍)仅在METex14+非鳞癌中表达上调(图3A)。免疫细胞方面,M1巨噬细胞、M2巨噬细胞和Tregs的平均TME估计值在METex14+肿瘤中增加,与组织学无关(图3B)。B细胞(1.07倍)和CD8 T细胞(1.43倍)仅在METex14+非鳞癌中富集,树突状细胞仅在METex14+鳞癌中减少(0.32倍)。

图3、对比不同组织学类型和METex14状态NSCLC中免疫检查点相关基因表达(A)和免疫细胞成分(B)

METex14-和METex14+ NSCLC患者中位随访时间均为28个月。与METex14-相比,METex14+患者的中位OS更长(22.9 vs 18.6个月, HR = 0.914, p = 0.04;图4A)。接受MET TKI治疗的METex14+患者有生存改善的趋势,中位OS为28.1个月,而未接受MET TKI治疗的患者为21.0个月,但差异无统计学意义(HR = 0.819, p = 0.11)。然而,本队列中只有16.2%的METex14+患者(n = 148)接受了MET TKI治疗。接受IO治疗的METex14+ NSCLC患者的生存期略有改善,中位OS为27.5个月,而未接受IO治疗的患者为21.8个月(HR = 0.803, p = 0.03),只有27.1%的METex14+患者(n = 247)接受了某种形式的IO治疗。
 
与METex14+鳞癌相比,METex14+非鳞癌与生存率提高相关(中位OS 27.7 vs 8.9个月, HR = 0.493, p < 0.0001;图4B)。与METex14-鳞癌相比,METex14-非鳞癌与生存期的适度改善相关(中位22.0 vs 16.2个月, HR = 0.803, p < 0.0001;图4C)。

图4、对比不同组织学类型和METex14状态NSCLC患者的OS生存曲线

结论

METex14+突变是NSCLC中一种异质性亚群。本研究结果显示,与METex14+鳞癌相比,METex14+非鳞癌预后更好。在选择治疗策略时,应考虑不同组织学类型NSCLC患者中独特的基因组和转录组特征。

本文主要参Marks JA, Gandhi N, Halmos B, et al. Molecular profiling METex14+ non-small cell lung cancer (NSCLC): Impact of histology. Lung Cancer. 2024;196:107935. doi:10.1016/j.lungcan.2024.107935。

审批编号CN-148153
过期日期2024.12.25

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