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文摘
值得关注的胃癌分类——胃腺癌的综合分子特征
文摘
2024-05-28 20:22
广东
译者的话:
本文为自学译文,敬请
批判性阅读
。本文删减较多,如有需要,请阅读文末参考文献。
推荐补充阅读:
EBV相关亚型和MSI亚型胃早癌的临床病理特征
EBV感染与浅表性胃肿瘤
特殊病例:CDH1突变家族遗传性弥漫性胃癌
文献整译——胃癌及癌前病变的认识
有关HGDC的非靶向活检与组织病理学
原位印戒细胞癌的组织病理学(文献简译)
收藏:基于不同背景条件的胃肿瘤多样性
胃癌是癌症死亡的主要原因,但其分子和临床特征的分析由于组织学和病因的异质性而变得复杂。绝大多数胃癌为腺癌,根据
Lauren
分类可进一步分为肠型和弥漫性两种。
WHO
提出的另一种分类方法是将胃癌分为乳头状癌、管状腺癌、黏液
(
胶状
)
癌和低黏附性癌。这些分类系统几乎没有临床用途,因此开发能够指导患者治疗的强大分类方法是当务之急。
大多数胃癌与感染因子有关,包括幽门螺杆菌和
EB
病毒
(EBV)
。胃癌的组织学亚型分布以及幽门螺杆菌和
EBV
相关胃癌的频率在全球范围内有所不同。少数胃癌病例与
E-
钙黏蛋白
(CDH1)
或错配修复基因
(Lynch
综合征
)
的种系突变有关,而散发性错配修复缺陷胃癌在
CpG
岛甲基化表型
(CIMP)
的背景下具有
MLH1
的表观遗传沉默。使用基因表达或
DNA
测序对胃癌进行了分子谱分析,但尚未形成明确的生物学分类方案。通过癌症基因组图谱
(TCGA)
进行的这项研究的目的是建立一个健全的胃癌分子分类,并确定不同类型胃癌的失调途径和候选驱动因素。
对
295
例原发性胃腺癌进行了全面的分子评估,包括基于阵列的体细胞拷贝数分析、全外显子组测序、基于阵列的
DNA
甲基化分析、信使
RNA
测序、
microRNA (miRNA)
测序和反相蛋白阵列
(RPPA)
,并进行对所有肿瘤
DNA
进行微卫星不稳定性
(MSI)
检测,并对
107
对肿瘤
/
生殖系进行低通量全基因组测序。
基于对所有分子平台的分析结果,作者创建了一个决策树,将
295
个胃癌样本分为四个亚型
(
图
1a, b)
,使用的方法更容易应用于临床诊疗中的胃癌肿瘤。
肿瘤首先以
EBV
阳性
(9%)
分类,然后以
MSI
高状态
(
以下简称
MSI)
分类
(22%)
,其余肿瘤根据非整倍体的程度分为基因组稳定
(20%)
或表现出染色体不稳定性
(CIN
;
50%)
。
图
1
胃癌分子亚型。
a
,胃癌病例按突变率分为
EB
病毒
(EBV)
阳性
(
红色
)
、微卫星不稳定
(MSI
,蓝色
)
、基因组稳定
(GS
,绿色
)
和染色体不稳定
(CIN
,浅紫色
)
亚型。从
227
个肿瘤的临床和分子数据描述了所有六个平台。
b
,一个流程图概述了肿瘤是如何被划分为分子亚型的。
c
,不同亚型之间的临床和组织学特征的差异,亚型的颜色如
a, b
所示。初次诊断时患者年龄的图显示了中位数,第
25
和第
75
百分位值,以及在
1.5
倍四分位数范围内的最高值和最低值。
该研究将胃癌分子分类为四种亚型:
(1)Epstein-Barr
病毒阳性肿瘤,表现为复发性
PIK3CA
突变,极端
DNA
超甲基化,
JAK2
,
CD274(
也称为
PD-L1)
和
PDCD1LG2(
也称为
PD-L2)
扩增;
(2
)
微卫星不稳定肿瘤,突变率升高,包括编码可靶向致癌信号蛋白的基因突变;
(3
)
基因组稳定肿瘤,富含
RHOA
的弥漫性组织学变异和突变或涉及
RHOA
家族
GTPase
激活蛋白的融合;
(4
)
染色体不稳定肿瘤,表现出明显的非整倍体和受体酪氨酸激酶的局灶扩增。
图
2
胃癌的综合分子描述。
a
,在按分子亚型组织的样本中显示了选择基因的突变、拷贝数变化和易位。在此数据集或
COSMIC
存储库中反复出现的突变用颜色来区分。更改频率表示为所有情况的百分比。
b
,
RTK/RAS
和
RTK/PI(3)K
信号通路在分子亚型中的变化。红色表示预测激活;蓝色表示预测失活。
c
,热图显示,与非恶性胃黏膜相比,四种亚型的
NCI-PID
通路均显著升高
(
红色
)
或降低
(
蓝色
)
。
该项对胃癌分子和基因组基础的研究,描述了一种分子分类
(
图
3)
,定义了胃癌的四种主要基因组亚型:
EBV
感染的肿瘤;
MSI
肿瘤;基因组稳定肿瘤及染色体不稳定的肿瘤。这种分类可以作为组织病理学的有价值的辅助手段。重要的是,这些分子亚型显示出明显的基因组特征,为在不同胃癌患者群体的临床试验中评估靶向药物提供了指导。通过对
MSI
和
EBV
的现有检测,以及使用新兴的基因组分析来查询突变和扩增的重点基因集,本研究开发的分类系统可以应用于新发胃癌病例。希望这些结果将促进临床试验的发展,在确定的患者群体中探索治疗方法,最终提高这种致命疾病的生存率。
图
3
胃癌亚型的主要特征。
这张示意图列出了与胃癌的四种分子亚型相关的一些显著特征。从胃不同区域获得的肿瘤中分子亚型的分布由插入的图表表示。
参考文献:
http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkzNjAzMTEwNQ==&mid=2247487073&idx=1&sn=ff1bd1d95bf21b2a2efec4b94973faa8
ling波微步
这位小仙女🧚♀️有点懒,更新随心所欲~~号内是整理的学习笔记,需要者请自取哈~~
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