哈佛医学院:First-in-class去泛素蛋白酶靶向嵌合体(DUBTAC)激活cGAS

2024-08-19 22:57   上海  


cGAS-STING通路影响着肿瘤细胞的各个阶段,包括细胞癌变到转移。激活cGAS被认为是潜在可靠的治疗癌症的策略。近日,哈佛医学院的Wenyi We报道了使用First-in-class DUBTAC激活cGAS(doi: 10.1002/anie. 202415168),推进了DUBTAC技术的发展。



背景


与蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC)通过降解致病蛋白相反,去泛素蛋白酶靶向嵌合体(DUBTAC)通过去泛素化酶稳定目标蛋白质,使原有功能恢复来治疗疾病。目前使用DUBTAC技术稳定的目标蛋白非常有限,并且去泛素化酶小分子配体目前只有EN523。


配体初步筛选


EN523的结构可以分为三个模块,左边杂芳环,中间环,右侧共价弹头。对这三个部分的变化来优化与OTUB1结合情况。通过质谱检测结果可以看到MS5105与OTUB1有更高的结合率,化合物2略优于EN523,其他分子的结果比EN523差。



配体系统对比


首先考察了对MS5105和EN523稀释不同的比例在1小时与OTUB1的结合情况。MS5105(100:1)与EN523(250:1)具有相近的结合效果,说明了MS5105结合更有效。结合速率实验表明了并且MS5105结合速度也更快。



稳定性实验测试了MS5105和EN523在0.01 M HCl甲醇溶液中的变化情况。EN523在96小时后分解了50%以上,而MS5105并未观察到明显的分解。另外MS5105还显著提高了水溶性(MS5105为31.4 mg/mL,EN523为0.8 mg/mL),这可能是由于在共价弹头中引入了极性⼆甲氨基基团导致的。



对于OTUB1 C23S突变体,MS5105可以有效结合,而对其他半胱氨酸残基(C91)没有结合作用。而EN523对OTUB1 C23S突变体没有结合作用。另外MS5105不影响OTUB1将四泛素底物转化为变成单泛素,表明MS5105不抑制 OTUB1的去泛素化酶活性。总的来说,MS5105作为OTUB1的共价配体,具有更优异的活性,稳定性和水溶性。



参考EN523的连接策略,通过酸或者酰胺连接5-甲基噻吩基团,设计出两个系列的化合物(Q系列和G系列)。在CFBE41o-4.7 ΔF508-CFTR细胞的测试中发现MS6178比NJH-2-057的效果提升10倍。这充分证明了MS5105配体的优势。




首创cGAS DUBTAC的发现


cGAS拮抗剂G140与G108较为相似,因此可以参考G108的共晶结构,并且其活性是目前报导最高的。基于G140设计出了4个系列化合物。通过对增加cGAS蛋白水平的测试,发现H8 (MS7829)和Z8(MS8588)是最有效的。



对MS7829和MS8588进一步测试发现,其对cGAS的稳定呈浓度依赖,并且在3小时内呈时间依赖。MS7829和MS8588不影响cGAS的 mRNA水平,排除了这些化合物可能通过调节转录来影响cGAS蛋白水平。



总结


目前DUBTAC可选择的配体有限,极大限制了该领域的发展。作者基于已有的配体进行优化,得到了效果更好的配体MS5105,并且基于此配体开发出了首创cGAS DUBTAC,并且MS7829和MS8588对cGAS呈浓度,时间依赖并且不影响cGAS mRNA 水平,为癌症治疗提供了新思路。


参考文献doi: 10.1002/anie.202415168


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