在与癌症和慢性感染作斗争时,身体里的免疫系统主力军——T细胞,有时会变得“筋疲力尽”,战斗力大打折扣,这种状态就叫做T细胞耗竭(TEX)。
TEX 细胞可不是一成不变的,它们会根据“疲惫”程度,分成不同的亚型:“先锋队”(TEXprog),“主力军”(TEXeff)和 “躺平族”(TEXterm)。其中,“先锋队” TEXprog 细胞是关键,它们数量多,战斗力强,而且还能“自我复制”,补充“主力军”。更重要的是,这些亚型之间的转化,是由一种叫做表观遗传学的机制控制的,可以理解为在不改变基因序列的情况下,通过修饰基因的“开关”,来调控基因的表达。
最近发表在《Science》期刊上的一篇文章详发现,细胞代谢和表观遗传学之间存在着密切的联系。细胞代谢需要燃烧不同的“燃料”(比如葡萄糖、醋酸盐)来产生能量,而其中一些“燃烧产物” 乙酰辅酶A 可以用来修饰基因的开关,从而影响细胞的命运。 也就是说,可通过调节 T 细胞的 “饮食代谢”,来增强它们的战斗力,增强打击癌症和慢性感染的能力。
•ACSS2(利用醋酸盐来生产乙酰辅酶A)在TEX细胞中表达显著降低,尤其是在更加耗竭的TEXterm亚群:从小鼠和人肿瘤中分离的CD8+ 肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)中,与功能性 TEFF 细胞相比,功能失调的 TEX 细胞(尤其是 TEXterm 亚群)中的 Acss2 表达显著降低。用抗PD-1抗体治疗后,ACSS2的表达在功能性CD8+ T细胞(TEXprog和活性细胞)中选择性增加。
•ACLY(利用柠檬酸盐来生产乙酰辅酶A)表达则在TEX和TEFF细胞中相对稳定:在小鼠和人类TILs中,Acly的表达在所有三种CD8+ T细胞状态下都相对稳定,甚至在功能失调的TEX/TEXterm细胞中比功能性TEFF/TEXprog细胞略高。
•ACSS2 努力维持着 TEXprog 细胞的数量和功能,从而增强了T细胞的抗肿瘤能力:敲除Acss2基因会严重削弱 P14+ CD8+ T 细胞的抗肿瘤功能,导致其无法有效抑制 B16-GP33 肿瘤的生长,还会导致 P14+ CD8+ T 细胞更容易分化成 TEXterm 细胞。
•而 ACLY 的缺失反而增强了 TEXprog 细胞的形成和效应功能,从而促进了T细胞的抗肿瘤和抗病毒免疫反应:敲除Acly基因竟然增强了 P14+ CD8+ T 细胞的抗肿瘤功能,有效地抑制了 B16-GP33 肿瘤的生长,促进了 P14+ CD8+ T 细胞分化成 TEXprog 细胞 , 同时这些细胞的细胞因子(IFNγ 和 TNF)生成能力也显著提高。
•T细胞从TEFF分化为TEX细胞,逐渐抛弃醋酸盐,转而拥抱葡萄糖作为生产乙酰辅酶A的主要原料:与TEFF细胞相比,TEX细胞中由醋酸盐合成的乙酰辅酶A的比例显著降低,而由葡萄糖衍生的柠檬酸合成的乙酰辅酶A的比例则没有明显变化,TEX细胞内在地限制了其来自醋酸盐的胞质乙酰辅酶A库,但没有限制来自葡萄糖的乙酰辅酶A库。即使TEX细胞可以通过葡萄糖合成更多的乙酰辅酶A,但它们却无法有效地维持细胞核内的乙酰辅酶A水平,导致组蛋白乙酰化水平下降。
•ACSS2和ACLY分别与不同的组蛋白乙酰转移酶(HAT)合作, 决定了醋酸盐和葡萄糖分别用于哪些特定基因的组蛋白乙酰化修饰,从而影响TEX细胞的分化命运:ACSS2与p300 HAT相互作用,主要利用醋酸盐介导的乙酰辅酶A对与TEXprog细胞分化相关的基因位点进行组蛋白乙酰化修饰,从而促进TEXprog细胞的形成。ACLY则与KAT2A HAT相互作用,主要利用葡萄糖介导的乙酰辅酶A对与TEXterm细胞分化相关的基因位点进行组蛋白乙酰化修饰,从而促进TEXterm细胞的形成 。
•ACSS2 和 p300 强强联手,为 TEXprog 细胞的形成保驾护航:在 TEFF 细胞中,ACSS2 与 p300 存在特异性共定位和相互作用。ACSS2 定位于细胞核,为 p300 提供充足的乙酰辅酶A,使其能够高效地催化组蛋白乙酰化。而敲除 Ep300 基因后,ACSS2 介导的组蛋白乙酰化和 TEXprog 细胞形成都受到了阻碍。这表明 ACSS2 和 p300 的协同作用对于 TEXprog 细胞的形成至关重要。通过精密的合作,将来自醋酸盐的乙酰辅酶A“定向输送”到 TEXprog 细胞分化相关基因位点的组蛋白上,从而促进 TEXprog 细胞的形成。
•ACLY 和 KAT2A 则另辟蹊径,为 TEXterm 细胞的形成添砖加瓦:随着 T 细胞的持续激活和耗竭,ACSS2 的表达逐渐下降,而 ACLY 则“挺身而出”,与 KAT2A 合作,将来自葡萄糖的乙酰辅酶 A 用于 TEXterm 细胞分化相关基因位点的组蛋白乙酰化修饰,促进 TEXterm 细胞的形成。尽管 ACLY 和 KAT2A 能够促进 TEXterm 细胞的形成,但它们却无法维持与 ACSS2 和 p300 相同水平的整体组蛋白乙酰化水平,导致 TEXterm 细胞的整体组蛋白乙酰化水平低于 TEXprog 细胞。这也许解释了为什么 TEXterm 细胞的功能较弱。
•提升“战斗力”:核ACSS2过表达可以增强TILs中TEXprog细胞的形成和细胞因子生成,从而增强抗肿瘤免疫反应,并与ICB协同作用,发挥“1+1>2”的功效:在 B16-GP33 肿瘤模型中,过表达核定位的 ACSS2 (ACSS2NLS) 的 P14+ T 细胞 (ACSS2NLS TILs) 显示出 TEXprog 细胞形成增加,以及细胞因子 (IFNγ 和 TNF) 生成增加;同时,ACSS2NLS TILs 不仅能够有效地控制肿瘤生长,还能与抗 PD-L1 ICB 治疗协同作用,进一步增强抗肿瘤效果 。
•抑制“猪队友”:ACLY抑制剂可上调ACSS2的表达,促进TEXprog细胞的形成,并与ICB协同作用,有效抑制肿瘤生长:ACLY 抑制剂 BMS-303141 可以显著上调激活的 CD8+ T 细胞中 ACSS2 的表达,并在体外耗竭培养中促进 TEXprog 细胞的形成;在 MC38 肿瘤模型中,BMS-303141 治疗可以适度增加体内 TEXprog 细胞的形成,更重要的是,BMS-303141 与抗 PD-L1 ICB 治疗联用可以显著增强 TILs 的积累,并有效抑制肿瘤生长 。这再次证明了抑制 ACLY 可以增强抗肿瘤免疫反应,并与 ICB 治疗产生协同作用。
总结,营养物质代谢通过调控组蛋白乙酰化,影响CD8+ T细胞的耗竭分化。ACSS2和ACLY这两种酶分别利用乙酸盐和柠檬酸盐合成乙酰辅酶A,并与不同的组蛋白乙酰转移酶(HATs)合作,决定了T细胞的命运: ACSS2促进效应性T细胞(TEFF)和耗竭性前体细胞(TEXprog)的形成,而ACLY则促进终末期耗竭细胞(TEXterm)的形成。通过操纵ACSS2和ACLY的活性,可以重新编程耗竭的T细胞,增强抗肿瘤免疫反应,为癌症免疫治疗提供新的策略。
参考文献:Shixin Ma et al.,Nutrient-driven histone code determines exhausted CD8+ T cell fates.Science0,eadj3020DOI:10.1126/science.adj3020