探索抗HIV治疗与肠道微生物之间的相互作用

文摘   2024-08-18 22:10   越南  

撰文:paperplaneIN


反正我感染后肠胃一直很差。不管了晚上小烧烤整起,今朝有酒今朝醉~😊




一、背景

研究背景

在艾滋病毒感染者中,肠道和口腔微生物群的组成发生了显著变化。虽然抗逆转录病毒治疗 (ART) 对恢复感染者的免疫功能至关重要,但一些研究表明,某些抗逆转录病毒药物(特别是整合酶抑制剂,INSTI)与体重增加有关。本研究探讨了不同 ART 方案下感染者口腔和肠道微生物群的差异,以及这些差异与身体质量指数 (BMI) 的关系。研究发现,与健康对照者相比,感染者的口腔和肠道微生物丰富度较低,且接受 INSTI 治疗的个体的微生物群特征与体重增加有关。总体而言,研究揭示了不同 ART 方案对微生物组的显著影响,特别是在 INSTI 组中,这对理解感染者的代谢和免疫功能具有重要意义。

图 1. 健康组和艾滋病毒感染者在肠道和口腔微生物群中的多样性和组成变化

二、研究方法

研究背景

研究设计:这是瑞典斯德哥尔摩卡罗琳斯卡大学医院进行的开放标签、非随机临床试验的一部分,旨在评估 mRNA BNT162b2 疫苗的安全性和临床效果。

研究对象:研究从90名艾滋病毒感染者(PLWH)和90名健康对照者(HC)中采集粪便和口腔样本。参与者提供了书面知情同意书,并排除了在接种疫苗前三个月内接受过抗生素治疗的个体。

样本收集与处理:样本在 RNA/DNA 保护液中采集,使用 DNA 提取试剂盒提取 DNA,并在 Illumina MiSeq 平台上进行 16S rRNA 测序。

数据收集与测量:研究通过流式细胞术和定量 PCR 测量 CD4+、CD8+ T 细胞计数和 HIV 载量,临床数据如 ART 方案和 BMI 从临床记录表和医疗记录中检索。

序列分析:研究对测序数据进行了质量检查和修剪,使用 Qiime2 进行分类分析,并通过 R 包进行可视化,估计样本的多样性和丰富度,采用线性判别分析效应大小(LEfSe)方法识别组间显著差异的微生物群。

统计分析:使用 PERMANOVA 计算不同因素对 beta 多样性的影响,使用 Spearman 相关性分析评估微生物群与 BMI 等因素之间的关联。

伦理审批:该研究获得了瑞典伦理审查局的批准,并遵循《赫尔辛基宣言》的指导方针进行。

图2.艾滋病毒感染者 肠道和口腔微生物群的差异,进一步根据 BMI 分为两组

三、结论

研究背景

研究结果显示,艾滋病毒感染者的肠道和口腔微生物群的多样性明显低于健康对照者 ,尤其是细菌的丰富度较少。与健康对照者相比,感染者的肠道样本中富含致病菌如克雷伯氏菌和大肠杆菌,而健康对照者则有更多有益菌如双歧杆菌。在口腔样本中,感染者的假红杆菌和 Bulleidia 较为丰富,而 HC 的细毛菌较为丰富。

此外,研究发现不同 ART 方案对微生物群有显著影响,例如接受整合酶抑制剂 (INSTI) 治疗的感染者肠道富含双歧杆菌,口腔中韦荣球菌丰富。而接受非核苷酸逆转录酶抑制剂 (NNRTI) 治疗的感染者肠道中富含戈登杆菌和巨球菌,口腔中富含梭杆菌。高 BMI 的感染者 肠道中也富含双歧杆菌和琥珀酸弧菌。

研究表明,抗逆转录病毒治疗对感染者的微生物组产生了显著影响,特别是 INSTI 方案与体重增加相关的微生物群变化有关。

菌群简介



双歧杆菌:有益菌。双歧杆菌是常见的益生菌,广泛存在于健康人的肠道中,有助于消化和免疫调节。

韦荣球菌:中性菌。韦荣球菌(Veillonella)是一种厌氧菌,通常存在于口腔和肠道中,其作用因环境不同而异,目前尚不明确其在人体健康中的具体益害性。

戈登杆菌:中性菌。戈登杆菌(Gordonibacter)是肠道中的常驻菌,具体作用尚不完全明确,既没有明确的益生特性,也没有明显的致病特性。

巨球菌:有害菌。巨球菌(Megasphaera)在某些情况下与疾病有关,尤其是在肠道菌群失调的情况下,可能对健康有害。

梭杆菌:有害菌。梭杆菌(Fusobacterium)是一种常见的口腔病原菌,与牙龈炎和其他口腔感染相关,也可能在其他感染中发挥作用。

琥珀酸弧菌:中性菌。琥珀酸弧菌(Succinivibrio)是肠道中的厌氧菌,具体功能仍在研究中,尚无明确的益害定论。

四、注释

研究背景

整合酶抑制剂 (INSTI) - 一类抗 HIV 药物,作用机制是阻断 HIV 病毒将其遗传物质整合到人体细胞中的过程。


非核苷酸逆转录酶抑制剂 (NNRTI) - 一类抗 HIV 药物,通过阻止 HIV 病毒的逆转录酶功能来防止病毒复制。


CD4/CD8 比率 - 一种衡量免疫系统健康状态的指标,主要通过比较 CD4 和 CD8 免疫细胞的数量得出。


BMI(身体质量指数) - 身体质量指数,用于衡量体重与身高的比例,常用于评估肥胖程度。

文章标题:Exploring the interplay between antiretroviral therapy and the gut-oral microbiome axis in people living with HIV

作者:Aswathy Narayanan, Oscar Kieri, Jan Vesterbacka, Lokeshwaran Manoharan, Puran Chen, Mahin Ghorbani, Hans-Gustaf Ljunggren, Margaret Sällberg Chen, Soo Aleman, Anders Sönnerborg, Shilpa Ray & Piotr Nowak 

DOI : 10.1038/s41598-024-68479-4

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