博医学JCO中文版丨急性淋巴细胞白血病结果的基因组决定因素
健康
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2025-01-09 16:58
北京
摘要
尽管儿童急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia, ALL)的治愈率超过90%,但ALL仍然是儿童癌症死亡的主要原因。一半的复发发生在最初被归类为标准风险(standard-risk, SR)疾病的儿童中。为了确定SR ALL儿童复发的基因组决定因素,我们对儿童肿瘤学组试验中SR儿童(n=1,381)或具有良好细胞遗传学特征的高危B-ALL儿童(n=115)的诊断和缓解样本进行了基因组和转录组测序。我们采用病例对照研究设计,分析了439例复发患者和1,057例至少5年完全缓解的患者。基因组亚型与复发相关,在大约50%的PAX5变异ALL病例中发生复发(优势比[odds ratio, OR],3.31[95% CI,2.17-5.03];P=3.18×10-8)。在高超二倍体ALL中,10号染色体的增加伴有7号染色体的二体性与良好预后相关(OR,0.27[95% CI,0.17-0.42];P=8.02×10-10;圣犹大儿童研究医院验证队列:OR,0.22[95% CI,0.05-0.80];P=0.009),10号和17号染色体的二体性伴有6号染色体的增加与复发相关(OR,7.16[95% CI,2.63-21.51];P=2.19×10-5;验证队列:OR,21.32[95% CI,3.62-119.30];P=0.0004)。基因组变异与复发相关,且具有亚型依赖性,包括ETV6::RUNX1 ALL中的INO80变异、高超二倍体ALL中的IKZF1和CREBBP变异以及BCR::ABL1样ALL中的FHIT变异。基因组变异还与微小残留病的存在相关,包括高超二倍体ALL中的NRAS和CREBBP。基因亚型、非整倍体模式和继发性基因组变异决定了儿童ALL的复发风险。需要进行全面的基因组分析才能实现最佳风险分层。
DOI:10.1200/JCO.23.02238
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本期目录:
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