关注我们 | 发现更多精彩内容
蛋白质是一类含有空间结构的高分子化合物。二硫键的存在会影响电泳的分辨率,因此一般需要使用还原剂打开蛋白质中或蛋白质亚基间的二硫键。二硫键问题对碱性蛋白尤为突出,因为在碱性环境中,二硫键形成速度更快。在进行肽段分析前,也通常需要先加入二硫苏糖醇(DTT)或三(2-甲酰乙基)磷盐酸盐(TCEP)等还原剂,打开二硫键。为了阻止还原后的自由巯基再次形成二硫键,我们经常使用烷基化试剂将巯基封闭,常用的烷基化试剂有碘乙酰胺(IAM,iodoacetamide)、氯乙酰氨(ClAM,chloroacetamide)、碘乙酸和N-乙基马来酰亚胺等。本文主要介绍氯乙酰氨。
1. 基本信息
中文名称:氯乙酰胺
英文名称:2-Chloroacetamide
别名:2-氯代乙酰胺、氯乙酸酰胺等
化学式:C2H4ClNO
分子量:93.5123
CAS号:79-07-2
2. 物理性质
外观:白色针状结晶
熔点:116~121℃(不同来源数据略有差异)
沸点:225℃(分解)或256°C at 760 mmHg
密度:0.84(或1.268g/cm3,不同条件下密度可能有所不同)
闪点:108.6°C或170℃(不同来源数据)
溶解性:能溶于10倍体积的水和乙醇,微溶于乙醚。
3. 化学性质
氯乙酰胺是一种与硫醇反应的烷化试剂,用于封闭还原型半胱氨酸残基,以便进行蛋白质表征和肽图分析。与碘乙酰胺类似,氯乙酰胺修饰会导致还原型半胱氨酸硫醇发生共价加成,添加一个氨甲酰甲基基团(57.07 Da),从而防止二硫键的形成。然而,与碘乙酰胺相比,氯乙酰胺在溶液中的反应活性较低且更稳定,这使其对半胱氨酸的修饰更具特异性,减少了对其他氨基酸的非目标标记和副反应。
注意:氯乙酰胺具有轻微的光敏性。应在使用前立即配制溶液,并在烷基化过程中尽量减少对光的暴露。尽管半胱氨酸修饰是主要的烷基化反应,但使用过量的氯乙酰胺或缓冲液pH值不正确可能导致胺类(赖氨酸、N-端)、硫醚类(甲硫氨酸)、咪唑类(组氨酸)和羧酸类(天冬氨酸、谷氨酸)发生烷基化。
4. 一般步骤
(1)将5-100 μg蛋白质样品溶解于100 μL 100mmol/L的碳酸氢铵(pH 8.0)或100mmol/L的三乙胺碳酸氢盐(pH 8.5)缓冲液中。
(2)加入1μL 500mmol/L的中性TCEP溶液,使TCEP的最终浓度为5mmol/L,并在37°C下孵育样品30分钟。
(3)在使用前立即将一管氯乙酰胺(2mg)溶解于107μL 100mmol/L的碳酸氢铵(pH 8.0)或100mmol/L的三乙胺碳酸氢盐(pH 8.5)缓冲液中,以制备200mmol/L的氯乙酰胺储备溶液。
(4)向样品中加入11μL 200mmol/L的氯乙酰胺,使氯乙酰胺的最终浓度为20mmol/L,并在避光条件下于室温孵育30分钟。
使用一步法进行巯基的封闭方案:蛋白样品准备好后,将TCEP和氯乙酰胺同时加入样品中,在避光条件下于室温孵育30分钟即可。(物料的量,时间,温度等需要根据不同样品进行摸索)
5.安全性
毒性:氯乙酰胺吞食有毒,与皮肤接触可能致敏,并有损害生育能力的危险。
防护措施:在生产和使用过程中,应穿戴适当的防护服和手套,避免吸入粉尘和接触皮肤。若发生事故或感不适,应立即就医。
综上所述,氯乙酰胺是一种具有多种用途的化学物质,在有机合成、医药中间体以及农业等领域都有广泛应用。然而,由于其具有毒性,在使用过程中需要严格遵守安全操作规程,确保人员和环境的安全。
以上为本次的分享,希望对大家有所帮助。以上内容均为个人观点,仅供大家参考。
END
⭐⭐⭐如果觉得上述内容对你有所帮助,请收藏并关注公众号。
历史文章:
Adv Exp Med Biol(IF 2.1):铁蛋白的自组装:结构、生物功能及其在纳米技术中的潜在应用
链霉亲和素磁性微球(磁珠)的使用:游离模式和预包被模式的比较
叶酸结合蛋白(叶酸受体)的配体结合与构象结构之间的复杂相互作用:生物学视角