引言:基因检测可发现NSCLC中可操作靶点和预后标志物,实现精准诊疗并改善患者预后。NSCLC基因检测通常是基于组织标本进行的。然而,由于各种原因,晚期NSCLC经常难以获取足够的组织标本用于病理分析和基因检测。因此,有必要探索在晚期NSCLC中基于外周血检测可操作变异的可行性。为此,来自香港大学李嘉诚医学院的研究者获取了72对匹配的NSCLC患者外周血和肿瘤组织,验证外周血全面基因组分析的准确性和一致性,相关结果已在2024年ELCC大会上公布,本文对此进行简要解读和分享,希望能为医务工作者提供新的科研和临床参考,造福更多肺癌患者。
背景
全面的基因组分析(CGP)有助于帮助非小细胞肺癌(NSCLC)患者发现可操作靶点和预后标志物,实现精准诊疗并改善患者预后。既往NSCLC基因检测通常是基于肿瘤组织标本。然而,由于各种原因,NSCLC经常难以获取足够的组织标本用于病理分析和基因检测,尤其是在复发性和晚期NSCLC中。此外,肿瘤组织CGP漫长的结果反馈周期可能会影响及时的治疗决策。液体活检可以在样本量和周转时间方面弥补组织标本的不足。然而,由于循环肿瘤DNA(ctDNA)样本不足,液体活检在检测可操作变异方面也存在一定的局限性,本研究旨在探索ctDNA在晚期NSCLC中基于外周血NGS-CGP检测可操作变异的可行性,并验证其准确性和与组织标本的一致性。
研究方法
从2021年7月开始,本研究与香港正在进行的晚期NSCLC多中心前瞻性精准肿瘤计划研究共同招募患者。使用FDA批准的Foundation One CDx和Foundation One Liquid CDx进行CGP检测分析。通过阳性一致性百分比(PPA)评估液体活检结果的准确性。用Pearson相关法计算组织和液体活检检测得到的肿瘤突变负荷(TMB)相关性。
结果
对72例外周血和组织CGP匹配的患者进行了分析。全队列患者中位年龄为69岁。71%的患者外周血ctDNA样本的肿瘤分数(TF)评分<10%。ctDNA TMB和肿瘤组织TMB的平均值分别为5.5 muts/Mb和6.1 muts/Mb。47%(n=35)的患者携带ESCAT I级可操作突变。报告的可操作突变包括:ALK融合(n=1)、BRAF V600E(n=2)、EGFR L858R(n=17)、EGFR19号外显子缺失(n=13)、KRAS G12C(n=1)和MET 14号外显子剪切位点突变(n=1)(图1)。本研究中配对队列可操作变异的PPA为71%(图2)。然而,液体活检和肿瘤组织TMB之间的相关系数为0.56,PPA为60%(图3)。
图1、本研究中可操作变异瀑布图
结论
本研究证实了在无法进行肿瘤组织活检时,使用外周血ctDNA检测临床可操作变异的潜力。然而,基于ctDNA分析的TMB数据准确性不足。
本文主要参考Elaine Ko, et al. Actionable mutations in matched liquid and tissue biopsy next-generation sequencing. 2024 ELCC Abstract #45P; Annals of Oncology (2024) 9 (suppl_3): 1-53. 10.1016/esmoop/esmoop102569。
声明:本文由阿斯利康提供支持,仅供医疗卫生专业人士参考
审批编号:CN-1411983 过期日期2025-1-29
排版编辑:肿瘤资讯-liguo.zhu