文章标题：Genome-wide association study meta-analysis of suicide death and suicidal behavior
中文标题：自杀死亡和自杀行为的全基因组关联研究荟萃分析
发表期刊：Mol Psychiatry
发表时间：2023年02月
影响因子：9.6/Q1
研究背景
研究方法
研究结果
1队列特点
2.全基因组关联（SNP 水平和基因水平关联）
扩展SD GWAS荟萃分析使用3765例病例和6572个对照，发现NLGN1中一基因座达全基因组显著性，与SD风险相关，且为SD特异性遗传风险位点。NLGN1编码神经元细胞表面蛋白，参与突触形成和重塑。研究还复制了rs116955121与自杀意念和企图的关联。在五个队列的SB荟萃分析中，未发现达全基因组显著性的变异，但通过基于基因的关联分析确定ROBO2和ZNF28与SB相关，且为SB特异性。
3.MAGMA 基因集分析
MAGMA基因集富集分析显示，MHC Ib类受体活性通路在与SD相关变体中富集（p=1.82×10⁻⁷，校正p=2.82×10⁻³），由19号染色体LILRB1（p=0.003）和1号染色体CD160（p=0.07）基因关联驱动。免疫相关途径如自然杀伤细胞细胞因子产生等存在提示富集。
在92个PRS中，22个和41个分别与队列1和队列2的SD状态相关，其中21个常见。抑郁、焦虑等PRS与SD正相关，吸烟、教育程度等与SD负相关。队列2还揭示了双相情感障碍、PTSD等特征与SD的负相关，这些特征大多曾报道与自杀倾向有遗传相关性。
SD和SA的h2SNP分别为5.02%和5.45%，调节MDD后SD的h2SNP降低。SD和MDD遗传相关性为0.51，SA和MDD为0.73，SB和MDD为0.56，条件反射后相关性降低。SB与SA、疼痛等特征遗传相关，SD与疼痛和教育程度相关。调节后，多数相关性不显著。
6.基于广义摘要数据的孟德尔随机化 （GSMR）
双向GSMR分析显示，SA和SD的遗传风险与MDD的遗传风险存在双向因果关系。具体而言，SA中MDD基因座的SNP效应大小与MDD中的SA基因座存在显著双向因果关系（pGSMR分别为1.63×10⁻⁶³和2.65×10⁻⁹）。此外，SD中MDD基因座的SNP效应大小与MDD中的SD基因座也存在显著双向因果关系（pGSMR分别为8.2×10⁻⁵和0.05）。
文章小结
本研究通过大规模GWAS元分析及SMR方法，深入探究自杀死亡（SD）和自杀行为（SA）的遗传基础。分析发现NLGN1基因中的一个位点与SD显著相关，且为SD特异性风险位点。此外，ROBO2和ZNF28基因与SA相关。研究还揭示了SD、SA与抑郁症等精神疾病的遗传相关性，以及双向因果关系，为理解自杀行为的遗传机制提供了重要见解，为未来预防和干预措施的研发奠定了基础。对这种思路感兴趣的老师，欢迎联系小编！
