文章标题：Novel Protein Biomarkers and Therapeutic Targets for Type 1 Diabetes and Its Complications: Insights from Summary-Data-Based Mendelian Randomization and Colocalization Analysis
中文标题：1 型糖尿病及其并发症的新型蛋白质生物标志物和治疗靶点：来自基于摘要数据的孟德尔随机化和共定位分析的见解
发表期刊：Pharmaceuticals
发表时间：2024年06月
影响因子：4.3/Q1
研究背景
研究方法
研究结果
1.SMR 分析和 HEIDI 测试结果
研究发现91个和80个血浆蛋白与T1D因果关系，涉及多种并发症。关键蛋白靶标包括CTRB1、DKK3等，与T1D风险增减相关。
2.共定位分析
共定位分析确认9种关键蛋白与T1D因果关联，PPH4 > 0.7视为强证据。5个风险靶点和4个保护靶点被确定，MANSC4等为一级目标。
3.T1D 患者和健康个体中鉴定蛋白的表达
热图显示9个蛋白质靶标的表达模式，红色和蓝色网格分别代表上调和下调基因。T1D组中，风险靶标MST1、WARS1和MAPK13表达上升，而保护靶标CTRB1、DKK3和MANSC4表达下降。MANSC4在T1D组中显著降低（p = 0.0047），提示其与T1D发病和进展相关。
4.已确定的蛋白质靶点与当前 T1D 药物的关联
探索T1D治疗现状，利用DrugBank和STRING数据库，发现11种T1D药物和20个治疗靶点，揭示了CTRB1、IL7R等与现有药物靶点的相互作用。
5.T1D 核心治疗靶点的 MR 表型组范围关联研究
通过MR表型组范围研究，发现MANSC4与降低糖尿病风险相关，而CTRB1、SIGLEC5和MST1无额外适应症或不良反应，表明这些蛋白靶点安全可靠。
文章小结
本研究提取了来自35,559名冰岛人和54,219名英国参与者的4907种和2923种血浆蛋白的汇总数据，利用基因组关联研究（GWAS）统计分析T1D及其并发症。采用基于汇总数据的孟德尔随机化（SMR）分析评估血浆蛋白与T1D相关结果的因果关系，并通过共定位分析探讨共享遗传变异。此外，构建蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络，结合转录组分析，进一步阐明蛋白靶点的表达模式及其相互作用。对这种思路感兴趣的老师，欢迎联系小编！
