今天koi为大家分享一篇选题足够亮眼的孟德尔随机化，庞大的数据集和多种分析手段保证了可靠性，思路简单清晰，严谨可靠，想发孟德尔的老师千万不要错过！请速速联系小编哦！
文章标题：Integrating genetics and metabolomics from multi-ethnic and multi-fluid data reveals putative mechanisms for age-related macular degeneration
中文标题：整合来自多种族和多体液数据的遗传学和代谢组学揭示了年龄相关性黄斑变性的推定机制
发表期刊：Cell Reports Medicine
发表时间：2023年06月
影响因子：11.7/Q1
研究背景
年龄相关性黄斑变性（AMD）是导致老年人失明的主要原因，本研究通过整合遗传学和代谢组学数据，探索代谢物与AMD之间的共享遗传成分，以增进对其发病机制的理解。
研究方法
本研究对多达28,000名参与者的多种族遗传和代谢组数据进行了代谢物全基因组关联研究（mGWASs），并运用双向孟德尔随机化分析，识别血浆代谢物与晚期AMD之间的108个潜在因果关系，这些代谢物富集在甘油磷脂代谢、溶血磷脂酰甘油、三酰甘油和长链多不饱和脂肪酸途径中。通过贝叶斯遗传共定位分析和定制的代谢组全基因组关联方法，优先考虑潜在的因果AMD相关代谢物。
研究结果
1.mGWAS
mGWASs在NHS、NHSII和HPFS中未见基因组膨胀，lambda 0.99-1.03，LD评分截距0.977-1.01。346种代谢物中，123种基于SNP遗传力显著，70.2%至少有一个显著mQTL。血浆数据荟萃分析26,340名参与者，识别13,065个mQTL；尿液荟萃分析2,072名参与者，识别1,443个mQTL。
2.mQTL 的多祖先和多流体验证
NHS、NHSII和HPFS血浆mQTL在CLSA、METSIM和HCHS/SOL中得到良好复制。HCHS/SOL中307个mQTL中111个显著，效应量一致性高（Pearson 0.86）。血浆与尿液mQTL相关性低（Pearson 0.45）。
3.代谢物与晚期 AMD 之间的推定因果关系
使用mQTL和AMD GWAS数据进行双样本MR分析，发现143种血浆代谢物MR估计值一致。19种代谢物与晚期AMD风险相关，108种血浆代谢物与AMD显著关联。尿液数据中仅5种代谢物与AMD相关，显示尿液样本量小或真实关联少。
4.代谢物和晚期 AMD 之间共有的共同因果变异
贝叶斯共定位分析发现114种代谢物和晚期AMD共享潜在因果变异，主要集中在APOE、ABCA1、LIPC和CETP基因附近，79%的代谢物与脂质途径相关，强调脂质代谢物在AMD风险中的关键作用。
5.MWAS
研究人员开发了MWAS管道，发现155种血浆代谢物与晚期AMD风险相关（FDR校正p<0.05），其中96种在MR分析中也相关，效应量方向一致。尿液代谢物与AMD关联极少。
文章小结
本研究通过整合遗传学和代谢组学数据，揭示了与年龄相关性黄斑变性（AMD）相关的血浆代谢物，特别是脂质代谢途径的关键作用。采用mGWAS和Mendelian randomization分析，识别出108个与晚期AMD有潜在因果关系的代谢物，强调了血浆代谢物在AMD风险中的重要性，并为未来的预防和治疗策略提供了新见解。对这种思路感兴趣的老师，欢迎联系小编！
