文章标题:Multi-omics Mendelian randomization integrating GWAS, eQTL and pQTL data revealed GSTM4 as a potential drug target for migraine
中文标题:整合 GWAS、eQTL 和 pQTL 数据的多组学孟德尔随机化揭示了 GSTM4 是偏头痛的潜在药物靶点
发表期刊:Journal of Headache And Pain
发表时间:2024年07月
影响因子:7.3/Q1
研究背景
研究方法
研究结果
1.遗传工具变异的选择
利用eQTLGen联盟的cis-eQTL,鉴定2701个可成药基因。通过UKB-PPP数据验证,筛选出750个。按标准,发现分析确定3073个cis-eQTL为IV.
2.基因表达和偏头痛之间发现阶段的 MR 分析
在FinnGen队列中,双样本MR分析偏头痛患者,44,616例病例和367,565例对照。14个基因显著相关,包括GSTM4等。未发现异质性或多效性,三种方法一致,Steiger过滤确认基因表达与疾病关联。
3.复制期14个基因与偏头痛的MR分析
对12个基因进行MR分析,结果显示PROCR、GSTM4、SLC4A1与偏头痛风险降低相关,TNFRSF10A与风险增加相关。敏感性分析无异质性,Steiger滤波验证,除GSTM4外,其他基因因方向不一致被排除。
4.GSTM4 基因表达与偏头痛之间的 SMR 和 HEIDI 检测
为消除多效性和连锁不平衡影响,SMR和HEIDI测试确认GSTM4 cis-eQTL结果一致,通过HEIDI(p>0.05)和SMR(p<0.05)测试,位点和效应图如下图所示。
5.GSTM4 蛋白水平与偏头痛的 MR 和亚组分析
利用UKB-PPP的GSTM4顺式-pQTL数据,MR分析确认GSTM4与偏头痛显著关联,循环GSTM4增加与偏头痛风险降低相关(OR=0.91)。敏感性分析无异质性或多效性,反向MR未发现偏头痛影响GSTM4,Steiger滤波确保效应方向性。亚组分析显示GSTM4与MA、MO风险降低有关。
GSTM4基因在cis-eQTL和cis-pQTL MR分析中显示负效应,其表达增加与偏头痛风险降低相关。GSTM4激动剂或为降低风险新方法。共定位分析PPH4=0.86,排除连锁不平衡影响。
7.SMR 和 HEIDI 检测验证了 GSTM4 顺式-pQTL
GSTM4 cis-pQTL通过SMR(P<0.05)和HEIDI(p>0.05)测试,结合证据,GSTM4有望成为偏头痛治疗靶点。
8.MVMR 分析发现 GSTM4 与偏头痛独立相关
GSTM4与偏头痛的9个危险因素中的焦虑显著相关(p=0.002)。MVMR分析显示GSTM4与偏头痛独立相关(p=0.001),揭示其潜在治疗靶点价值。
9.GSTM4 在不同组织中的表达
10.LDSC分析
通过LDSC分析,GSTM4与偏头痛呈显著负遗传相关性(rg=-0.1977,p=0.0145)。限制遗传协方差截距为零后,相关性更显著(rg=-0.4228,p=0.0004),增强统计功效。
11.PheWAS
利用PheWAS Portal和PheWeb数据库进行表型组范围MR分析,未发现GSTM4与其他表型显著关联(P<5E-08)。这增强了研究结果的有效性,表明GSTM4治疗副作用风险低。
12.候选药物的预测
为评估GSTM4药物靶标潜力,通过Enrichr DSigDB数据库筛选药物,发现维生素E、水杨酸钠、肼屈嗪和Tesaglitazar与GSTM4相关,为其潜在药物。
文章小结
本研究通过多组学孟德尔随机化方法,整合GWAS、eQTL和pQTL数据分析,发现GSTM4基因与偏头痛风险显著负相关,表明其可能是偏头痛治疗的潜在药物靶点。研究创新性地应用多种统计方法,包括SMR、HEIDI和共定位分析,验证了GSTM4的因果效应,并通过PheWAS分析排除了显著副作用,为偏头痛治疗提供了新方向。对这种思路感兴趣的老师,欢迎联系小编!