7.3/Q1,震惊!西安交通大学团队发现偏头痛的克星,GSTM4基因揭秘!

文摘   2025-01-03 18:25   陕西  
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文章标题:Multi-omics Mendelian randomization integrating GWAS, eQTL and pQTL data revealed GSTM4 as a potential drug target for migraine

中文标题:整合 GWAS、eQTL 和 pQTL 数据的多组学孟德尔随机化揭示了 GSTM4 是偏头痛的潜在药物靶点

发表期刊:Journal of Headache And Pain

发表时间:2024年07月

影响因子:7.3/Q1

研究背景

偏头痛作为一种复杂的神经系统疾病,给患者和社会带来了沉重的负担。尽管已有一些治疗方法,但现有药物的疗效有限,因此寻找能够改善偏头痛预后药物治疗靶点显得尤为重要。

研究方法

本研究采用孟德随机化(MR)基于汇总数据的MR(SMR)分析方法,利用来自FinnGen队列和英国生物银行的统计数据,通过eQTLGen和UKB-PPP获取遗传工具,验证基因表达和蛋白质水平上的药物靶点。研究还包括贝叶斯共定位HEIDILDSC、双向MR多变量MR、异质性测试、水平多效性测试和Steiger过滤等分析,以及药物预测分析和表型广泛关联研究(PheWAS),以评估药物靶点在未来临床应用中的可能性。

研究结果

1.遗传工具变异的选择

利用eQTLGen联盟的cis-eQTL,鉴定2701个可成药基因。通过UKB-PPP数据验证,筛选出750个。按标准,发现分析确定3073个cis-eQTL为IV.

2.基因表达和偏头痛之间发现阶段的 MR 分析

在FinnGen队列中,双样本MR分析偏头痛患者,44,616例病例和367,565例对照。14个基因显著相关,包括GSTM4等。未发现异质性或多效性,三种方法一致,Steiger过滤确认基因表达与疾病关联。

3.复制期14个基因与偏头痛的MR分析

对12个基因进行MR分析,结果显示PROCR、GSTM4、SLC4A1与偏头痛风险降低相关,TNFRSF10A与风险增加相关。敏感性分析无异质性,Steiger滤波验证,除GSTM4外,其他基因因方向不一致被排除。

4.GSTM4 基因表达与偏头痛之间的 SMR 和 HEIDI 检测

为消除多效性和连锁不平衡影响,SMR和HEIDI测试确认GSTM4 cis-eQTL结果一致,通过HEIDI(p>0.05)和SMR(p<0.05)测试,位点和效应图如下图所示。

5.GSTM4 蛋白水平与偏头痛的 MR 和亚组分析

利用UKB-PPP的GSTM4顺式-pQTL数据,MR分析确认GSTM4与偏头痛显著关联,循环GSTM4增加与偏头痛风险降低相关(OR=0.91)。敏感性分析无异质性或多效性,反向MR未发现偏头痛影响GSTM4,Steiger滤波确保效应方向性。亚组分析显示GSTM4与MA、MO风险降低有关。

6.GSTM4 cis-pQTL 与偏头痛的共定位分析

GSTM4基因在cis-eQTL和cis-pQTL MR分析中显示负效应,其表达增加与偏头痛风险降低相关。GSTM4激动剂或为降低风险新方法。共定位分析PPH4=0.86,排除连锁不平衡影响。

7.SMR 和 HEIDI 检测验证了 GSTM4 顺式-pQTL

GSTM4 cis-pQTL通过SMR(P<0.05)和HEIDI(p>0.05)测试,结合证据,GSTM4有望成为偏头痛治疗靶点。

8.MVMR 分析发现 GSTM4 与偏头痛独立相关

GSTM4与偏头痛的9个危险因素中的焦虑显著相关(p=0.002)。MVMR分析显示GSTM4与偏头痛独立相关(p=0.001),揭示其潜在治疗靶点价值。

9.GSTM4 在不同组织中的表达

通过 Human Protein Atlas 确定了 GSTM4 在人体组织和大脑区域表达的差异。结果显示,GSTM4 主要在小肠和脉络丛中表达。

10.LDSC分析

通过LDSC分析,GSTM4与偏头痛呈显著负遗传相关性(rg=-0.1977,p=0.0145)。限制遗传协方差截距为零后,相关性更显著(rg=-0.4228,p=0.0004),增强统计功效。

11.PheWAS

利用PheWAS Portal和PheWeb数据库进行表型组范围MR分析,未发现GSTM4与其他表型显著关联(P<5E-08)。这增强了研究结果的有效性,表明GSTM4治疗副作用风险低。

12.候选药物的预测

为评估GSTM4药物靶标潜力,通过Enrichr DSigDB数据库筛选药物,发现维生素E、水杨酸钠、肼屈嗪和Tesaglitazar与GSTM4相关,为其潜在药物。

文章小结

本研究通过多组学德尔随机化方法,整合GWAS、eQTL和pQTL数据分析,发现GSTM4基因偏头痛风险显著负相关表明其可能是偏头痛治疗的潜在药物靶点。研究创新性地应用多种统计方法,包括SMR、HEIDI共定位分析,验证了GSTM4的因果效应,并通过PheWAS分析排除了显著副作用,为偏头痛治疗提供了新方向。对这种思路感兴趣的老师,欢迎联系小编!

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