9.4/Q1,探索肌肉衰老新疗法:药物基因组学与孟德尔随机化技术结合 ——来自四川大学华西医院的最新研究

文摘   2024-12-16 18:01   陕西  
今天koi为大家分享一篇选题足够亮眼的孟德尔随机化,庞大的数据集和多种分析手段保证了可靠性,思路简单清晰,严谨可靠,想发孟德尔的老师千万不要错过!请速速联系小编哦!

文章标题:Systematic druggable genome-wide Mendelian randomization identifies therapeutic targets for sarcopenia

中文标题:系统性的可成药全基因组孟德尔随机化确定了肌肉减少症的治疗靶点

发表期刊:Journal of Cachexia Sarcopenia And Muscle

发表时间:2024年04月

影响因子:9.4/Q1

研究背景

随着人口老龄化,肌肉减少症(sarcopenia)成为重要健康问题,但目前缺乏有效药物治疗。本研究旨在通过整合药物基因组数据基因表达量位点和全基因组关联分析数据,利用孟德尔随机化方法识别肌肉减少症的潜在治疗靶点。

研究方法

本研究采用孟德尔随机化(MR)方法,结合人类血液和骨骼肌组织顺式表达量位点(cis-eQTL/顺式蛋白质量位点cis-pQTL)数据,分析药物靶标基因与肌肉减少症之间的潜在因果关系。通过敏感性分析和贝叶斯共定位验证因果关系,并使用表型全基因组MR(Phe-MR)方法评估识别药物靶标的副作用或额外适应症,进一步在数据库中研究目标基因的可药物性和临床开发能力。

研究结果

1.成药基因组

整合DGIdb和Finan研究,精选2532个经过验证的可成药基因,为深入研究肌肉减少症治疗靶点打下基础。

2.肌肉减少症相关性状的候选成药基因

研究人员筛选了2532个潜在可成药基因,并结合血液与骨骼肌eQTL/pQTL数据,识别出与肌肉减少症相关的419个顺式-eQTL和426个SNPs,为孟德尔随机化分析提供了遗传工具。

3.肌肉减少症相关候选可成药基因的 Phe-MR 分析

研究人员对英国生物库中784种疾病进行Phe-MR分析,发现HP和HLA-DRA基因与脂代谢紊乱相关,而MFGE8、MAP 3K3、COL15A1和AURKA基因无显著关联,提示这些药物靶点可能安全。

4.识别靶基因的可操作药物

血管钙化与糖尿病严重事件相关,GWAS基因评分显示SMC和成纤维细胞在钙化中起主要作用,SMCs向成骨细胞转化是关键过程。

文章小结

本本研究通过整合药物基因组数据孟德尔随机化方法,成功识别了与肌肉减少症潜在因果关系的17个可成药基因。其中,MAP 3K3、MFGE8、COL15A1、HP和HLA-DRA作为治疗靶点显示出前景,锌补充剂和胶原酶可能成为新的治疗策略。研究为肌肉减少症的药物治疗提供了新的分子靶点和药物再利用的科学依据。对这种思路感兴趣的老师,欢迎联系小编!

多组学与孟德尔随机
多组学与孟德尔随机,专注与分享多组学与孟德尔随机化的最新生信文献和思路。提供专业的生信分析服务:思路设计,生信分析,文献复现,科室科研培训,数据库搭建,助力您的科研之路!
 最新文章