6.0/Q1,吉大团队运用多组学+孟德尔+铁死亡揭示铁死亡在2型糖尿病发病机制及其并发症中的分子网络

文摘   2025-01-05 18:00   陕西  

文章标题:Uncovering the molecular networks of ferroptosis inthe pathogenesis of type 2 diabetes and itscomplications: a multi-omics investigation

中文标题:揭示铁死亡在2型糖尿病发病机制及其并发症中的分子网络:一项多组学研究 

发表期刊Molecular Medicine

发表时间2024年11月

影响因子6.0/Q1     

 

研究背景
糖尿病是一种多因素疾病,铁死亡在糖尿病及其并发症中发挥重要作用。本研究试图通过多组学从多个角度揭示铁死亡在上述疾病中的作用。
研究思路
首先对2型糖尿病(T2D)及其并发症进行遗传相关分析(方法:连锁不平衡评分(LDSC)和高清晰度似然方法(HDL))。铁死亡相关基因(FRGs)表达的数据来自基因表达和蛋白丰度研究的荟萃分析。采用发现队列、复制队列和成像基因组学队列对T2D及其并发症进行孟德尔随机化分析和交叉验证。此外,对T2D进行了共定位分析,并对并发症进行了组织特异性单细胞RNA测序研究。
研究结果
1.遗传相关分析
T2D与并发症的遗传相关性结果高度一致且显著相关。在分析DKD(糖尿病肾病)、DCM(糖尿病性心肌病)和NAFLD(非酒精性脂肪肝)时,数据集对之间没有显著的相关性。
2.初步分析和定位
在对T2D风险的综合分析中,排除了发现队列或复制队列中具有显著多效性的FRGs,最后,14个FRGs的表达水平在同一关联方向上一致且显著,共定位分析PP.H4 >.8。
遗传预测的6个基因(CDKN1A、ENO3、FURIN、RARRES2、TYRO3和YTHDC2)的高水平表达与T2D风险呈正相关。8个基因(ARNTL、CAMKK2、CTSB、FADS2、KDM5A、MEG3、SREBF1和STAT3)的高水平表达与T2D风险呈负相关。这14个FRGs被纳入T2D的三个关键相关并发症的进一步分析
3.二次分析和组织特异性验证
在DKD的二次分析中,三个FRGs得到了发现队列、复制队列和成像基因组学的完全支持。高表达水平的CDKN1A与DKD风险呈正相关。高表达水平的CAMKK2和KDM5A与DKD风险降低相关。在DCM的分析中,CTSB是唯一得到发现队列、复制队列和成像基因组学完全支持的基因。而高水平的CTSB与DCM风险呈正相关。对于NAFLD,遗传预测的较高水平的ARNTL和SREBF1与NAFLD风险降低相关,并且在三个队列中相互证实。
肾小管也常发生铁死亡和其他形式的细胞死亡。Ctsb主要富集于心内膜细胞和成纤维细胞中,这是大多数细胞死亡和纤维化发生的地方。同时,巨噬细胞中的富集水平也高于其他细胞类型(图6C)。如图7C所示,对于NAFLD,ARNTL和SREBF1主要富集在肝细胞中。而由肝脂肪变性和脂质过氧化引起的铁死亡可导致单纯性NAFLD发展为非酒精性脂肪性肝炎(NASH)。

 

文章小结
这种共病研究结合多组学、孟德尔随机化以及国自然热点的思路正式审稿人的最爱,非常值得借鉴,今天为大家分享的文章纯公共数据挖掘+统计分析,就发到了一区!如果你也想在临床方向发高分文章,不妨试试这个省钱省事又省力的思路吧!

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