祝大家新年快乐 万事胜意 心想事成!
生信站,持续更新临床生信文献与思路解读,今天分享的文章亮点是网络药理学+新型系统生物学实验管道揭示了罗汉松脂酚在前列腺癌中的抗转移潜力,
感兴趣的老师可以点点关注
文章标题:Novel systems biology experimental pipeline reveals matairesinol's antimetastatic potential in prostate cancer: an integrated approach of network pharmacology, bioinformatics, and experimental validation
中文标题:新型系统生物学实验管道揭示了罗汉松脂酚在前列腺癌中的抗转移潜力:网络药理学,生物信息学和实验验证的综合方法
发表期刊:Brief Bioinform
发表时间:2024年7月
影响因子:6.8
研究背景
研究方法
MAT靶点从Swiss Target Prediction、Pharmapper和Superpred数据库中检索,mPC靶点从GeneCards和DisGeNet数据库中鉴定。交叉分析揭示了MAT针对mPC的27个潜在治疗靶点(PTM-mPC)。基于交集基因构建PPI网络,通过CytoHubba插件进一步确定了11个枢纽基因——EGFR, AKT1, ERBB2, MET, IGF1, CASP3, HSP90AA1, HIF1A, MMP2, HGF, MMP9。
利用DAVID,分析了27个共同靶点的KEGG通路。构建了一个“化合物-靶标-通路(C-T-P)”网络来可视化MAT、其靶标和相关通路。前列腺癌与8个基因密切相关,突出了MAT与癌症相关信号级联反应之间的潜在关联。
文章小结
本研究结合了网药、分子对接、分子动力学模拟以及细胞实验研究了天然化合物罗汉松脂酚在前列腺癌中的潜在抗转移作用。(对文章数据库和分析方法感兴趣或需要生信分析服务的老师,欢迎关注小星一起交流)