文章标题：Mitochondrial related genome-wide Mendelian randomization identifies putatively causal genes for multiple cancer types
中文标题：线粒体相关全基因组孟德尔随机化确定了多种癌症类型的推定致病基因
发表期刊：Ebiomedicine
发表时间：2023年02月
影响因子：9.7/Q1
研究背景
研究方法
研究结果
1.线粒体全基因组顺式 eQTL 和癌症结局的 MR 分析
SMR分析血液SNPs，乳腺癌7信号，前列腺癌4信号，胃癌1信号。FDPS降低34%风险，NSUN4增加5%风险。共定位分析排除LD混杂，因果基因表达变化OR计算。NSUN4增与两癌风险相关。
2.线粒体全基因组顺式-mQTL 和癌症结局的 MR 分析
Bonferroni校正和HEIDI测试线粒体基因甲基化与癌症关联。乳腺癌14位点15信号，前列腺癌10位点11信号，胃癌1位点1信号，肺癌3位点4信号，黑色素瘤1位点2信号。NSUN4甲基化与乳腺癌风险相关，NUDT5甲基化与前列腺癌风险负相关。VARS2甲基化与肺癌风险正相关。SMR分析线粒体基因甲基化与表达。
3.已识别遗传变异的表型范围扫描
GWASATLAS和PhenoScanner数据库排除癌症多效性。曼哈顿图展示遗传变异与疾病关系。NSUN4与乳腺癌和前列腺癌稳健相关。FDPS表达相关SNPs与代谢性状相关。NUDT5甲基化相关SNPs与内分泌性状相关。VARs2甲基化SNPs与多性状相关。需研究排除多效性。
4.线粒体功能障碍和癌症的双向 MR 分析
GWAS适用于mtDNA拷贝数变异。探索线粒功能障碍与癌症因果。mtDNA拷贝数与特定癌症关系特异。双向MR分析显示癌症类型特异性。
文章小结
本研究通过Mendelian Randomization (MR) 方法，利用GWAS数据集，揭示了线粒体功能障碍与多种癌症之间的潜在因果关系。研究发现mtDNA拷贝数变异与特定癌症类型如宫颈癌、卵巢癌及头颈癌存在因果关联。创新性在于首次系统性地应用MR方法探讨线粒体功能障碍在癌症发展中的作用，为癌症的预防和治疗提供了新的分子靶点。对这种思路感兴趣的老师，欢迎联系小编！
