6.1/Q1，江苏大学团队通过GEO公共数据库结合体内外实验验证探究miR-122/NEGR1轴在结直肠癌肝转移中的作用机制

文摘 2024-12-15 18:44 陕西

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文章标题：miR-122/NEGR1 axis contributes colorectal cancer liver metastasis by PI3K/AKT pathway and macrophage modulation

中文标题：miR-122/NEGR1轴通过PI3K/AKT通路和巨噬细胞调节参与结直肠癌肝转移

发表期刊：Journal of Translational Medicine

发表时间：2024年11月

影响因子：6.1/Q1

研究背景

结直肠癌是胃肠道系统最常见的癌症之一，也是第三常见的恶性肿瘤，严重影响人们的生活和健康。目前尚无有效准确的临床指标用于早期预测结直肠癌肝转移和有效的晚期结直肠癌转移治疗治疗晚期结直肠癌转移的靶点。神经元生长调节剂1（NEGR1）是IgLON细胞粘附分子家族的成员，是一种对细胞间粘附至关重要的膜结合蛋白。尽管有一些关于NEGR1在癌症中的初步发现，但其在结直肠癌肝转移中作用的详细分子机制仍不清楚。

研究思路

确定预测和治疗 CRLM 的新靶点。生物信息学分析强调 miR-122/NEGR1 轴在 CRLM 中至关重要。体外检测（集落形成、伤口愈合、Transwell）探讨了该轴对 CRC 细胞增殖、侵袭和迁移的影响。双荧光素酶报告基因检测和 RNA 下拉证实了 miR-122/NEGR1 相互作用。在体内，使用 CRLM 模型小鼠研究轴对肿瘤转移和巨噬细胞极化的影响。免疫荧光（IF）、定量实时 PCR （qRT-PCR）、酶联免疫吸附测定（ELISA）和蛋白质印迹（WB）分析了巨噬细胞极化标志物和细胞因子/蛋白质/RNA 表达。

研究内容

1、结肠癌肝转移（LM）和原发性肿瘤（PT） mRNA和miRNAs的表达差异

为了研究结直肠癌LM和PT中mRNA 和miRNA的表达差异，作者从GEO数据库中选择了2个mRNA数据集（GSE103340, GSE81558）和3个miRNA数据集（GSE35834, GSE72199， GSE81581）进行分析。以|log2FC|> 1和p < 0.05作为筛选标准选择上述数据集中的差异mRNA和差异miRNAs。

2、NEGR1下游通路的计算机预测及其对肿瘤免疫微环境的影响

为了进一步研究 NEGR1的下游通路，作者使用 DAVID数据库对差异基因进行了KEGG富集和GO 富集分析。结果显示，差异基因的KEGG富集主要与补体途径相关。

3、MiR - 122和NEGR1在结直肠癌、邻近组织和肝转移中的表达

为了研究miR-122和NEGR1在结直肠癌中的表达，作者收集结直肠癌肝转移患者的原发结直肠癌癌旁组织和肝转移灶，进行qRTPCR和ELISA检测。结果显示 NEGR1与结直肠癌肝转移相关，是潜在的治疗靶点。

文章小结

小伙伴们看完这篇是不是感觉受益匪浅。该研究思路从宏观的疾病负担分析出发，通过生物信息学筛选和体外实验验证，再到体内模型的验证，最后评估临床治疗潜力，形成了一个从基础到临床的完整研究链条，最终证明了miR-122/NEGR1轴通过PI3K/AKT信号通路和M2型巨噬细胞极化推动CRC的进展和肝转移，是CRLM治疗的潜在靶点。今天为大家分享的文章纯公共数据挖掘+统计分析，就发到了一区！如果你也想在临床方向发高分文章，不妨试试这个省钱省事又省力的思路吧！

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