文章标题:Dissecting shared genetic architecture between obesity and multiple sclerosis
中文标题:剖析肥胖和多发性硬化症之间的共同遗传结构
发表期刊:Ebiomedicine
发表时间:2023年07月
影响因子:9.7/Q1
研究背景
研究方法
研究结果
1.肥胖与 MS 之间遗传相关性的估计
2.识别 BMI 和 MS 的基因组风险区域
3.BMI 和 MS 之间因果关系的证据
5.BMI 和 MS 中的细胞水平 SNP 遗传力富集
利用LDSC-SEG富集的四种组织的scRNA-seq数据评估BMI和MS的细胞类型表达特异性。在肺数据集中,多种细胞类型显著富集。脾脏中NK_FCGR3Apos显著富集,而脑和PBMC组织中的细胞未共富集。
6.鉴定 BMI 和 MS 的共享功能基因
通过SMR分析GWAS和eQTL数据,确定12个共享风险基因,其中GGNBP2在BMI和MS间共享,通过HEIDI测试,为两者间遗传共享变异之一。
7.GGNBP2 的差异表达
评估肥胖或MS患者和对照受试者组织中GGNBP2的mRNA表达。肥胖个体脂肪组织中GGNBP2表达显著增加(P<0.05),MS患者外周血核细胞中表达也增强(P<0.0001)。MS脑病变中表达升高,但需更多参与者增加统计功效(P=0.09)。
文章小结
本研究通过大规模基因组关联研究数据,深入探究肥胖与多发性硬化症(MS)的共享遗传架构。研究发现,体重指数(BMI)与MS之间存在显著的正遗传相关性,并识别了39个共享风险SNPs及一个潜在功能基因GGNBP2。这些发现不仅揭示了两者的遗传联系,还为未来针对这两种疾病的治疗策略提供了新的靶点,强调了早期检测和预防的重要性。对这种思路感兴趣的老师,欢迎联系小编!