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中文标题:炎症性肠病与大脑皮层之间的因果关系:来自孟德尔随机化和综合生物信息学分析的见解
发表期刊:Frontiers in Immunology
发表时间:2023年07月
影响因子:5.7/Q1
研究背景
炎症性肠病(IBD)包括溃疡性结肠炎(UC)和克罗恩病(CD),是一种慢性、进展性、复发性的肠道疾病,全球健康负担重大,且与神经精神共病的高发病率密切相关,迫切需要针对性的管理策略。研究方法
本研究利用来自近150,000个个体的全基因组关联研究和Immunochip基因型分析的遗传数据,通过双样本孟德尔随机化研究,阐明IBD、UC和CD对大脑皮层重塑的影响。通过收集介导因果关系的遗传变异,揭示了将肠道炎症与大脑功能障碍联系起来的生物学途径。研究结果
1.精准预测IBD:孟德尔随机化与遗传变异分析
用超过300的平均F值稳健工具预测IBD、UC、CD,通过PhenoScanner排除混杂因素,采用115、69、98个SNPs进行遗传预测,排除异常SNP后,发现CD显著影响大脑皮层。2.CD对大脑皮层影响的遗传证据
FDR校正后发现,CD显著降低颞极回表面积,提示慢性结肠炎导致区域皮质变化,影响多个脑区的表面积和厚度,UC主要影响下顶叶。3.IBD与大脑皮层:基因数据库映射与功能分析
研究人员确定了IBD-皮层因果关系的关键位点,并将其与140个基因匹配。这些基因在单核细胞分化、T细胞活化等过程中富集,涉及Th17细胞分化等关键途径。4.关键基因网络分析
相互作用网络证明了变异相关基因之间的相互联系。计算度中心性值(图 5B),鉴定出的中心基因是 STAT3、FOS、NFKB1、JAK2、STAT4、TYK2、SMAD3、IL12B、MYC 和 CCL2。IBD 和大脑皮层之间共享的遗传结构与细胞因子调节和相互作用、免疫细胞分化和激活以及免疫反应调节有关。文章小结
本研究通过孟德尔随机化方法揭示了炎症性肠病与大脑皮层形态改变之间的因果联系,特别是克罗恩病对颞极回表面积的显著影响。关键基因如STAT3和FOS在免疫调节中起核心作用,强调了IBD与神经精神共病之间的遗传和生物学联系。对这种思路感兴趣的老师,欢迎联系小编!