6.4/Q1,震惊!SMR分析揭示他汀类药物或可降低COVID-19住院风险:福建医科大学团队新发现!

文摘   2025-01-15 18:04   陕西  
今天koi为大家分享一篇选题足够亮眼的孟德尔随机化,庞大的数据集和多种分析手段保证了可靠性,思路简单清晰,严谨可靠,想发孟德尔的老师千万不要错过!请速速联系小编哦!

文章标题:Association of lipid-lowering drugs with COVID-19 outcomes from a Mendelian randomization study

中文标题:孟德尔随机化研究的降脂药物与 COVID-19 结果的关联

发表期刊:Elife

发表时间:2021年12月

影响因子:6.4/Q1

研究背景

COVID-19大流行已造成数百万人感染和死亡。由于缺乏专门针对SARS-CoV-2感染的药物,确定可以重新用于减少疾病感染和死亡率的现有药物变得尤为重要。脂质代谢病毒感染中起重要作用,这意味着降脂药物可能对SARS-CoV-2具有保护作用。他汀类药物是最常用的一类降脂药物,具有多个主要优点,如经充分验证的安全性、低成本和多效性作用。

研究方法

本研究采用双样本孟德尔随机化(MR)方法,使用两种遗传工具来代理降脂药物的暴露:药物靶基因的表达数量性状位点(eQTLs)药物内部或附近的遗传变异靶基因与低密度脂蛋白(LDL胆固醇)相关基因。基于汇总数据的MR(SMR)逆方差加权MR(IVW-MR)用于计算效应估计值。研究使用eQTLGen Consortium和GTEx Consortium V8的数据作为遗传工具,COVID-19 Host Genetics Initiative V4的数据作为结果来源。通过多种敏感性分析,包括F统计量、HEIDI测试和MR-Egger回归,评估遗传工具的有效性和假设的合理性。

研究结果

1.遗传工具选择和 COVID-19结果

从eQTLGen或GTEx鉴定HMGCR、PCSK9和NPC1L1的cis-eQTL,选最显著SNP为遗传工具。从Global Lipids Genetics Consortium的GWAS数据中选HMGCR、PCSK9和NPC1L1附近SNP。所有工具变体F统计量超30,减少弱工具偏差。阳性对照研究验证工具有效性。COVID-19 GWAS数据用于分析易感性、住院和重症关联。

2.初级分析

SMR分析显示HMGCR表达增加与COVID-19易感性和住院风险升高相关(OR=1.30, p=0.017;OR=1.38, p=0.019),而PCSK9表达与易感性负相关(OR=0.84, p=0.02)。IVW-MR分析发现HMGCR介导的LDL胆固醇增加与住院风险相关(OR=1.32, p=0.049),NPC1L1介导的LDL胆固醇与易感性相关(OR=2.02, p=0.002)。

3.敏感性分析

SMR分析中,HEIDI检验显示HMGCR表达与COVID-19易感性关联可能由连锁引起(p=0.009),其他关联非连锁引起。水平多效性检查发现仅HMGCR表达与COVID-19结果显著相关。IVW-MR分析中,Cochran Q检验未发现异质性,MR-Egger和MR-PRESSO分析未显示显著水平多效性。多变量MR分析提示BMI和糖尿病可能影响HMGCR介导的LDL胆固醇与COVID-19住院关联。

文章小结

本研究通过德尔随机化方法,利用表达数量性状位点(eQTLs)和全基因组关联研究(GWAS)数据,探讨了降脂药物(HMGCR、PCSK9和NPC1L1抑制剂)对COVID-19结果的潜在影响。SMR分析发现HMGCR表达增加与COVID-19易感性和住院风险相关,而IVW-MR分析支持HMGCR介导的LDL胆固醇与住院风险的关联。研究结果为降脂药物在COVID-19治疗中的潜在应用提供了遗传学证据,尽管需要进一步的临床试验验证。对这种思路感兴趣的老师,欢迎联系小编!

多组学与孟德尔随机
多组学与孟德尔随机,专注与分享多组学与孟德尔随机化的最新生信文献和思路。提供专业的生信分析服务:思路设计,生信分析,文献复现,科室科研培训,数据库搭建,助力您的科研之路!
 最新文章