文章标题：Re-analysis of single cell and spatial transcriptomics data reveals B cell landscape in gastric cancer microenvironment and its potential crosstalk with tumor cells for clinical prognosis
中文标题：单细胞和空间转录组学数据的再分析揭示了胃癌微环境中的 B 细胞景观及其与肿瘤细胞的潜在串扰对临床预后的影响
发表期刊：Journal of Translational Medicine
发表时间：2024年8月
影响因子：6.1/Q1
胃腺癌（GC）是一种全球发病率和死亡率都很高的恶性肿瘤，晚期胃腺癌（AGC）患者的治疗选择有限，预后较差。尽管免疫疗法已成为AGC的一种有力治疗手段，但并非所有患者都能从中获益。研究B细胞与肿瘤细胞之间的相互作用是否影响免疫疗法的有效性，对于改善AGC患者的治疗效果具有重要意义。本研究涉及对来自公开数据集的单细胞 RNA （scRNA） 和空间转录组学 （ST） 数据的重新分析。重点是研究胃癌 （GC） 肿瘤免疫微环境 （TIME） 中 B 细胞的亚群和分化轨迹。空间转录组学 （ST） 和多重免疫荧光 （mIF） 揭示了 B 细胞和肿瘤细胞之间明显的共定位模式。收集多个免疫治疗数据集以确定独特的免疫治疗生物标志物。靶向 CCL28 的独特免疫治疗潜力通过小鼠胃癌模型得到验证。此外，流式细胞术揭示了靶向 CCL28 的肿瘤免疫微环境的变化。通过二次分析ST和mIF数据，发现B细胞通常聚集在不同肿瘤微环境中，表明B细胞与肿瘤细胞之间存在串扰。此外，在胃癌TIME中识别出大量的IgA浆细胞，这些细胞可能通过特定的信号通路被肿瘤细胞招募。对10名胃癌患者的单细胞转录组数据进行二次分析，发现CCL28主要由肿瘤细胞表达，CCR10主要在浆细胞中表达；mIF验证了免疫治疗反应者（R）和非反应者（NR）之间的CCL28-CCR10轴差异。3. 胃癌浸润CD20+B细胞表现出两种独特的分化轨迹拟时序分析发现B细胞分化Lineage1轨迹和Lineage2 轨迹，C1细胞位于细胞轨迹的起点，C4和C5分别位于细胞轨迹的末端，一条走向免疫活性状态，另一条趋于免疫抑制状态，提示GC浸润的B细胞逐渐演化为不同免疫抑制状态下的B细胞。多个免疫治疗数据集分析发现，LAMA和CD44的串扰和胃癌患者免疫治疗效果和不良预后显著相关，提示其作为免疫治疗疗效的潜在预测标志物。本研究通过大量免疫治疗数据确定 LAMA/CD44 信号轴是免疫治疗的潜在预后标志物，还通过各种动物肿瘤模型验证了靶向 CCL28 可以通过调节 B 细胞和浆细胞功能显着促进 CD8T 细胞在 TME 中的浸润和功能，并具有协同免疫治疗的能力。今天为大家分享的文章纯公共数据挖掘+统计分析，就发到了一区！如果你也想在临床方向发高分文章，不妨试试这个省钱省事又省力的思路吧！![]()
