一、导航功能
三维电解剖标测系统，简称三维标测系统，一个重要的功能就是导航功能。传统的电生理是利用X光透视观察导管在心腔内的位置和移动，是二维的结构，仅能从一个体位观察导管与心脏。三维标测系统是利用导管在磁场或者电场中移动时产生的电或磁信号通过计算机进行处理，计算机会实时地把导管在心腔内的空间位置显示出来，给术者展示三维立体的图像，而且可以同时从两个体位（角度）展示。
二、建模功能
建立模型就是导管在心腔内移动，计算机采集导管移动的空间信息，呈现为一个立体的图形。假设一个人在黑暗的房间里，他也不知道这个房间的结构。这个人伸开双手在在房间内走动，当手触摸到墙壁时在人脑会产生一个信息，就是此处是墙壁。如果在这个房间走动的范围足够大，会采集到很多墙壁的信息。把这些信息提供给计算机进行拼接，计算机就可以呈现出房间的三维立体结构。例如导管在左心房内移动，会获得很多关于左心房壁的空间位置信息，三维标测系统整合后会呈现出左心房的立体结构，这就是建模过程。
三、特殊标记
在标测或者消融的过程中，遇到一些有特殊意义的结构或者电位，比如希氏束、瓣环或者特殊的电位，可以做个标识。标识可以展现在三维模型上。
四、激动顺序标测
导管在心腔内的每个区域都可以记到代表局部除极的电图，选定某一部位作为参考（如QRS起始或冠状窦某一通道的电图起始），把每个局部电图和参考电图进行比较，激动时间存在一定差值，即较参考领先的数值。领先的数值几个档次，分别用不同的颜色表示，并标识在三维标测系统建立的模型上，根据颜色分布规律就可以很直观的展示心腔内不同区域激动的先后顺序。
五、电压标测
基质标测也叫电压标测。导管放在心腔内会记录到局部电图，就是局部心肌除极的信号。如果某个区域有心肌有纤维化、坏死，局部电位振幅会很低，称为低电压。每个区域电信号大小也可以分成不同的档次，并用不同颜色表示，并展现在三维模型上。类似于激动标测，可以很直观的看到哪些区域电位是正常的，哪些区域电压低，后者提示瘢痕或者坏死区。
