6.7/Q1,可复现性超强,西北工业大学玩转双样本双向孟德尔探索肌肉减少症对帕金森病风险

文摘   2024-10-27 18:30   陕西  
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文章标题:Exploring causal effects of sarcopenia on risk and progression of Parkinson disease by Mendelian randomization

中文标题:通过孟德尔随机化探索肌肉减少症对帕金森病风险和进展的因果影响

发表期刊NPJ Parkinsons Dis . 

发表时间2024年8月

影响因子6.7/Q1

研究背景

先前的观察性研究表明,肌肉减少症与帕金森病 (PD) 有关,但尚不清楚这种关联是否是因果关系。本研究的目的是使用孟德尔随机化 (MR) 方法检查肌肉减少症相关特征与 PD 风险或进展之间的因果关系。

究方法

进行双样本双向 MR 分析以评估因果关系。从 IEU OpenGWAS 数据库中检索了肌肉减少症相关特征的全基因组关联研究 (GWAS) 汇总统计数据。PD 风险的 GWAS 数据来自 FinnGen 数据库(4235 例;373,042 例对照)使用来自帕金森病进展标志物倡议的基因型数据,通过基多基因评分 (PGS) 的方法和通路富集分析验证了 MR 分析中确定的重要因果关系。


结果分析

1. 孟德尔随机化分析结果

我们的 MR 结果表明,右侧 HGS 或阑尾瘦体重 (ALM) 对 LID 的发展有显著的因果影响(图 D)。1 和补充图在主要逆方差加权 (IVW) MR 分析中,右侧 HGS 较高的遗传易感性与 PD 患者发生 LID 的风险较低呈因果关系相关。


2. 反向孟德尔随机化分析结果

双向 MR 分析显示,遗传预测的肌肉减少症相关特征对 PD、进展为痴呆或进展为 HY3 的风险没有因果影响(图1 和补充图1). 我们还没有发现 PD 进展与肌肉减少症相关性状之间存在反向因果关系的遗传证据(表 1)。

3. Kaplan–Meier 分析

Kaplan-Meier (KM) 分析显示,与最低五分位数的患者相比,右侧 HGS 最高 PGS 五分位数的患者发生 LID 的风险显着降低与每个性状最低五分位数的患者相比,ALM (调整后 P = 1.000) 或左侧 HGS (调整后 P = 0.2693) 最高 PGS 五分位数的患者之间发生 LID 的风险没有显着差异。

4. 通路富集分析

京都基因与基因组百科全书 (KEGG) 对右 HGS 全基因组显著 SNP 的通路富集分析确定了几个显著富集的通路。其中,丝裂原活化蛋白激酶 (MAPK) 信号通路 (校正 P = 0.0036)16、环状 GMP 依赖性蛋白激酶 G (cGMP-PKG) 信号通路 (校正 P = 0.0087)17、长期抑郁 (LTD,调整后 P = 0.0157)18和长期增强 (LTP,调整后的 P = 0.0259)19,20 元已被提出通过控制突触可塑性成为 LID 发病机制的促成因素。

文章小结

目前的 MR 分析表明,增加右侧 HGS 或 ALM 显着降低了 LID 的风险。此外,右侧 HGS PGS 较高的患者发生 LID 的风险较低,这可能是通过控制突触可塑性。相比之下,我们发现遗传决定的肌肉减少症相关特征与 PD 的风险、运动进展或认知能力下降之间没有因果关系。如果您对生信分析和公共数据库挖掘感兴趣,但时间和精力有限或者缺乏相关经验,小骨非常乐意为您提供如下服务:免费思路评估、付费方案设计生信分析等,有意向的老师欢迎联系小骨哦!

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