今天koi为大家分享一篇选题足够亮眼的孟德尔随机化，庞大的数据集和多种分析手段保证了可靠性，思路简单清晰，严谨可靠，想发孟德尔的老师千万不要错过！请速速联系小编哦！
文章标题：Systematic integrated analysis of genetic and epigenetic variation in diabetic kidney disease
中文标题：糖尿病肾病遗传和表观遗传变异的系统综合分析
发表期刊：Natl Acad Sci USA.
发表时间：20201103
影响因子：9.4/Q1
研究背景
糖尿病肾病（DKD）是导致慢性肾功能衰竭的主要原因，研究通过整合基因组和表观基因组数据，探索了DKD的潜在病理机制。
研究方法
研究团队运用全基因组DNA甲基化关联分析，结合贝叶斯多性状共定位分析（moloc）和基于汇总数据的孟德尔随机化分析，系统地注释了与肾功能、甲基化和基因表达相关的基因组区域。
研究结果
1.DKD 表型的甲基化组范围关联分析
研究揭示DKD多样表型与甲基化水平关联，采用全基因组分析，发现关键CpG位点与血糖控制、白蛋白尿、eGFR及其下降速度相关。
2.胞嘧啶甲基化变化可以在外部队列中复制
探究了DKD不同表型间的甲基化变化重叠，发现血糖控制的甲基化与其它表型关联最大，凸显其在表观遗传变异中的潜在作用。此外，cg17944885位点的甲基化与eGFR的关联在多个研究中得到验证，表明其在DKD中的重要作用。
3.遗传驱动的甲基化和基因表达变化与 GWAS 信号相结合可以优先考虑肾功能障碍的基因
为探究遗传变异对甲基化的影响，进行了mQTL分析，发现遗传变异显著影响甲基化水平，其中22%的MWAS信号可能由遗传变异驱动，如MBNL1基因座所示，其甲基化变异与eGFR相关，表明遗传变异在DKD中的重要作用。
4.基于数据的孟德尔随机化，用于定义驱动甲基化和基因表达变化的遗传变异
通过SMR分析，从85个moloc筛选出40个高置信度的肾病致病基因，这些基因的表达变化通过甲基化影响肾功能。分析显示，补体系统和凋亡细胞清除在DKD中扮演关键角色，为疾病机理提供了新见解。
文章小结
本研究通过整合基因组与表观基因组数据，揭示了糖尿病肾病（DKD）中甲基化与肾功能、基因表达的关联，并突出了遗传变异在其中的关键作用。研究发现了与DKD不同表型相关的特定甲基化模式，并识别了可能通过影响甲基化和基因表达来介导疾病发展的遗传位点，为DKD的病理机制和治疗靶点提供了新见解。对这种思路感兴趣的老师，欢迎联系小编！
