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文章标题:Integrative omics provide biological and clinical insights into acute respiratory distress syndrome
中文标题:大整合组学为急性呼吸窘迫综合征提供生物学和临床见解
发表期刊:Intensive Care Med
发表时间:20210525
影响因子:27.1/Q1
研究背景
急性呼吸窘迫综合征 (ARDS) 伴有肺损伤后功能失调的免疫炎症反应,包括在 2019 冠状病毒病 (COVID-19) 期间。ARDS 发展的致病生物标志物有限。我们试图确定 ARDS 的新遗传易感性靶点,以进一步研究其生物学机制和治疗潜力。
研究方法
对 ARDS 全基因组关联研究进行了荟萃分析,欧洲人中有 1250 例和 1583 例对照,非洲裔美国人有 387 例和 387 例对照。使用多种组学方法在计算机中确定新基因座的功能。使用孟德尔随机化分析评估 114 个可能涉及 ARDS 发展的因素的因果关系。
研究结果
1.欧洲和非裔美国人人群中 ARDS 的遗传结构
研究发现,欧洲人和非洲裔美国人ARDS遗传异质性显著,rs7967111位点与欧洲人ARDS风险增加相关,而非洲裔美国人中rs619652位点未验证。跨血统分析未见全基因组显著性位点,但rs7967111仍显著相关。
2.rs7967111 在 12p13.2 处的功能分析
rs7967111位点在BORCS5内含子和DUSP16下游,显示增强子活性和转录因子结合信号。此位点可能影响相关基因表达和多种表型,尤其在呼吸系统,成ARDS新功能位点。
3.全因 ARDS 结果的可转移性
研究评估了ARDS与COVID-19严重程度的关联,发现三个COVID-19相关SNP与ARDS风险一致,且ARDS患者PRS高,BORCS5和DUSP16在严重COVID-19中表达降低。
4.性状与 ARDS 之间的假定因果关系
通过MR分析,我们发现IBD和某些免疫标志物与ARDS风险增加有关,而维生素D补充和血管扩张剂使用则与风险降低相关。
文章小结
本研究通过跨种族GWAS和多组学分析,揭示了ARDS的遗传异质性,并鉴定出新的易感位点rs7967111,涉及BORCS5和DUSP16基因。研究还通过孟德尔随机化分析,推断出炎症性肠病、CRP和IL-10等与ARDS风险的因果关联,同时指出维生素D和血管扩张剂可能降低ARDS风险,为ARDS的病理机制和治疗提供了新见解。(对这种思路感兴趣的老师,欢迎联系小编!)