4.4/Q1,郑州大学通过多组学分析揭示新药靶揭秘:PRCP基因与脑动脉瘤破裂风险的因果关系

文摘   2024-11-21 18:19   四川  

今天koi为大家分享一篇选题足够亮眼的孟德尔随机化,庞大的数据集和多种分析手段保证了可靠性,思路简单清晰,严谨可靠,想发孟德尔的老师千万不要错过!请速速联系小编哦!


文章标题:PRCP is a promising drug target for intracranial aneurysm rupture supported via multi-omics analysis

中文标题:PRCP 是一种很有前途的颅内动脉瘤破裂药物靶点,由多组学分析支持

发表期刊:Stroke And Vascular Neurology

发表时间:20240824

影响因子:4.4/Q1

研究背景

脑动脉瘤是致命的脑血管病,目前缺乏有效治疗手段。本研究通过多组学分析,探索预防脑动脉瘤形成和破裂的有效药物靶点及其潜在机制。

研究方法

该研究综合运用了双样本孟德尔随机化分析共定位分析和基于汇总数据的孟德尔随机化(SMR)方法,评估血液和大脑中药物可作用的表达量位点(cis-eQTLs)对脑动脉瘤(IA)、未破裂脑动脉瘤(UIA)和脑动脉瘤破裂导致的蛛网膜下腔出血(SAH)的因果效应。药物靶点基因数据来源于Chris Finan等人的研究,cis-eQTLs数据来自eQTLGen和PsychENCODE联盟。研究结果通过蛋白质组学转录组学数据进行验证,并构建了药物-基因调控网络

研究结果

1.脑动脉瘤的候选成药基因

利用Finan等数据从血液和大脑的eQTLGen和PsychENCODE联盟数据中识别了4302个潜在药物靶点基因。通过双样本MR分析,我们确定了SAH的四个(PRCP、PSMA4、LTBP4、GPR160)、IA的两个(PSMA4、SLC22A4)和UIA的一个(KL)潜在药物靶点。

2.反向因果关系检测

Steiger 方向性测试证实了方向性,但 LTBP4 除外 (p=0.31)。此外,MR-Steiger 过滤方法未检测到无效的 SNP(因果方向相反的 SNP)。

3.共定位分析

通过共定位分析评估了与IA、SAH、UIA相关的eQTL SNPs的遗传变异共享性。在血液中,PSMA4和PRCP显示出与IA和SAH的强共定位证据,确定了两个潜在的可成药基因。

4.SMR 分析

对共定位分析中显著的药物靶点进行了SMR分析。结果显示,血液中PSMA4表达升高与IA和SAH风险增加相关,而PRCP表达升高与SAH风险降低相关。HEIDI检验显示无混杂(p>0.05)。

5.转录组学分析

本研究分析了 GSE15629 数据集中 PRCP 和 PSMA4 的表达谱。这项调查显示,当使用两种不同的分组方法时,疾病队列中 PRCP 基因表达显着下调。相比之下,PSMA4 基因表达表现出最小的变异性。

文章小结

本研究通过多组学分,首次确定了PRCP和PSMA4作为预防脑动脉瘤破裂的潜在药物靶点。研究发现,PRCP基因表达增加降低SAH风险相关,而PSMA4表达增加与增加IA破裂风险相关。这些发现为脑动脉瘤的药物治疗提供了新方向,并构建了药物-基因调控网络,为未来研究和治疗提供了重要基础。对这种思路感兴趣的老师,欢迎联系小编!

多组学与孟德尔随机
多组学与孟德尔随机,专注与分享多组学与孟德尔随机化的最新生信文献和思路。提供专业的生信分析服务:思路设计,生信分析,文献复现,科室科研培训,数据库搭建,助力您的科研之路!
 最新文章