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文章标题:PRCP is a promising drug target for intracranial aneurysm rupture supported via multi-omics analysis
中文标题:PRCP 是一种很有前途的颅内动脉瘤破裂药物靶点,由多组学分析支持
发表期刊:Stroke And Vascular Neurology
发表时间:20240824
影响因子:4.4/Q1
研究背景
脑动脉瘤是致命的脑血管病,目前缺乏有效治疗手段。本研究通过多组学分析,探索预防脑动脉瘤形成和破裂的有效药物靶点及其潜在机制。
研究方法
该研究综合运用了双样本孟德尔随机化分析、共定位分析和基于汇总数据的孟德尔随机化(SMR)方法,评估血液和大脑中药物可作用的表达量位点(cis-eQTLs)对脑动脉瘤(IA)、未破裂脑动脉瘤(UIA)和脑动脉瘤破裂导致的蛛网膜下腔出血(SAH)的因果效应。药物靶点基因数据来源于Chris Finan等人的研究,cis-eQTLs数据来自eQTLGen和PsychENCODE联盟。研究结果通过蛋白质组学和转录组学数据进行验证,并构建了药物-基因调控网络。
研究结果
1.脑动脉瘤的候选成药基因
利用Finan等数据从血液和大脑的eQTLGen和PsychENCODE联盟数据中识别了4302个潜在药物靶点基因。通过双样本MR分析,我们确定了SAH的四个(PRCP、PSMA4、LTBP4、GPR160)、IA的两个(PSMA4、SLC22A4)和UIA的一个(KL)潜在药物靶点。
2.反向因果关系检测
Steiger 方向性测试证实了方向性,但 LTBP4 除外 (p=0.31)。此外,MR-Steiger 过滤方法未检测到无效的 SNP(因果方向相反的 SNP)。
3.共定位分析
通过共定位分析评估了与IA、SAH、UIA相关的eQTL SNPs的遗传变异共享性。在血液中,PSMA4和PRCP显示出与IA和SAH的强共定位证据,确定了两个潜在的可成药基因。
4.SMR 分析
对共定位分析中显著的药物靶点进行了SMR分析。结果显示,血液中PSMA4表达升高与IA和SAH风险增加相关,而PRCP表达升高与SAH风险降低相关。HEIDI检验显示无混杂(p>0.05)。
5.转录组学分析
本研究分析了 GSE15629 数据集中 PRCP 和 PSMA4 的表达谱。这项调查显示,当使用两种不同的分组方法时,疾病队列中 PRCP 基因表达显着下调。相比之下,PSMA4 基因表达表现出最小的变异性。
文章小结
本研究通过多组学分析,首次确定了PRCP和PSMA4作为预防脑动脉瘤破裂的潜在药物靶点。研究发现,PRCP基因表达增加与降低SAH风险相关,而PSMA4表达增加与增加IA破裂风险相关。这些发现为脑动脉瘤的药物治疗提供了新方向,并构建了药物-基因调控网络,为未来研究和治疗提供了重要基础。对这种思路感兴趣的老师,欢迎联系小编!