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文章标题:Using multi-omics to explore the genetic causal relationship between colorectal cancer and heart failure in gastrointestinal tumors
中文标题:利用多组学探讨胃肠道肿瘤结直肠癌与心力衰竭的遗传因果关系
发表期刊:Frontiers in Immunology
发表时间:20240913
影响因子:5.7/Q1
研究背景
心力衰竭(HF)和结直肠癌是全球重大健康挑战,既往研究表明两者间存在密切关联。本研究旨在通过双向孟德尔随机化(MR)方法,利用遗传变异作为工具变量,进一步探索HF与结直肠癌之间的潜在因果关系,为预防和治疗策略提供新见解。
研究方法
本研究采用了双向孟德尔随机化(MR)方法,结合大型基因组关联研究(GWAS)数据,使用逆方差加权(IVW)方法进行MR分析。通过发现和验证队列的IVW结果的元分析增强了检测因果效应的能力。进行敏感性分析,包括异质性分析和水平多效性测试,以测试结论的稳健性。
研究结果
1.HF 对结直肠癌的因果关系
研究发现心衰与结直肠癌风险增加30%相关,尽管验证队列中未达显著性,但荟萃分析支持心衰是潜在风险因素。MR分析显示心衰可能增加结直肠癌风险。
2.结直肠癌对 HF 的因果效应
本研究通过双向孟德尔随机化分析,提供了心力衰竭与结直肠癌之间因果关系的遗传证据。研究发现心力衰竭可能增加结直肠癌风险,但未发现反向关系。通过敏感性分析和荟萃分析,研究结果支持了心力衰竭作为结直肠癌潜在风险因素的稳健性,为未来的预防和治疗策略提供了新的科学依据。
3.结直肠癌中 SLC22A3 表达及其临床相关性的综合分析
研究分析了TCGA中结直肠癌样本的基因表达,发现SLC22A3与多种临床特征相关,其表达在肿瘤进展和转移中可能发挥作用,但与无进展生存期、治疗反应和总生存期的直接关联不明显。
4.SLC22A3 在结直肠癌中的预后价值:综合分析
分析确认SLC22A3在结直肠癌中具有预后价值,高表达与不良生存相关。通过结合临床特征,开发出预测患者生存的列线图和风险评分,为个性化管理提供依据。
5.结直肠癌中 SLC22A3 表达的综合功能富集分析
研究利用GO、KEGG、GSEA分析了SLC22A3基因在结直肠癌中的差异表达,揭示了其在免疫反应、细胞周期、凋亡和代谢中的重要作用,以及与癌症相关通路的关联,为理解其在CRC中的作用提供了基础。
6.结直肠癌免疫细胞浸润及SLC22A3表达的综合检查
本研究综合分析了结直肠癌中SLC22A3表达与免疫细胞浸润的关系。CIBERSORT分析显示免疫细胞异质性,ssGSEA揭示免疫通路活性。散点图表明SLC22A3与特定免疫细胞存在相关性,Pearson分析进一步探讨了其在免疫调节中的作用。
7.分析 CRC 和正常结肠上皮细胞系中的靶基因表达
定量PCR显示靶基因在CRC细胞系LoVo和SW480中显著上调,与正常结肠细胞NCM460相比,表达增加4倍和3倍,提示其在CRC中可能的关键作用,需进一步研究其临床应用潜力。
文章小结
本文通过双向孟德尔随机化研究,利用基因组关联研究数据,发现心力衰竭与结直肠癌风险增加相关,为这两种疾病的预防和治疗提供了新见解。研究还深入探讨了SLC22A3基因在结直肠癌中的表达差异及其对免疫细胞浸润和预后的影响,为癌症治疗提供了潜在靶点。(对这种思路感兴趣的老师,欢迎联系小编!)