5.7/Q1,中国第二人民医院用多组学分析揭示心力衰竭与结直肠癌的遗传联系

文摘   2024-10-23 18:43   陕西  

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文章标题:Using multi-omics to explore the genetic causal relationship between colorectal cancer and heart failure in gastrointestinal tumors

中文标题:利用多组学探讨胃肠道肿瘤结直肠癌与心力衰竭的遗传因果关系

发表期刊:Frontiers in Immunology

发表时间:20240913

影响因子:5.7/Q1

研究背景

心力衰竭(HF)结直肠癌是全球重大健康挑战,既往研究表明两者间存在密切关联。本研究旨在通过双向孟德尔随机化(MR)方法,利用遗传变异作为工具变量,进一步探索HF与结直肠癌之间的潜在因果关系,为预防和治疗策略提供新见解。

研究方法

本研究采用了双向孟德尔随机化(MR)方法,结合大型基因组关联研究(GWAS)数据,使用逆方差加权(IVW)方法进行MR分析。通过发现和验证队列的IVW结果的元分析增强了检测因果效应的能力。进行敏感性分析,包括异质性分析和水平多效性测试,以测试结论的稳健性。

研究结果

1.HF 对结直肠癌的果关系

研究发现心衰与结直肠癌风险增加30%相关,尽管验证队列中未达显著性,但荟萃分析支持心衰是潜在风险因素。MR分析显示心衰可能增加结直肠癌风险。

2.结直肠癌对 HF 的因果效应

本研究通过双向孟德尔随机化分析,提供了心力衰竭与结直肠癌之间因果关系的遗传证据。研究发现心力衰竭可能增加结直肠癌风险,但未发现反向关系。通过敏感性分析和荟萃分析,研究结果支持了心力衰竭作为结直肠癌潜在风险因素的稳健性,为未来的预防和治疗策略提供了新的科学依据。

3.结直肠癌中 SLC22A3 表达及其临床相关性的综合分析

研究分析了TCGA中结直肠癌样本的基因表达,发现SLC22A3与多种临床特征相关,其表达在肿瘤进展和转移中可能发挥作用,但与无进展生存期、治疗反应和总生存期的直接关联不明显。

4.SLC22A3 在结直肠癌中的预后价值:综合分析

分析确认SLC22A3在结直肠癌中具有预后价值,高表达与不良生存相关。通过结合临床特征,开发出预测患者生存的列线图和风险评分,为个性化管理提供依据。

5.结直肠癌中 SLC22A3 表达的综合功能富集分析

研究利用GO、KEGG、GSEA分析了SLC22A3基因在结直肠癌中的差异表达,揭示了其在免疫反应、细胞周期、凋亡和代谢中的重要作用,以及与癌症相关通路的关联,为理解其在CRC中的作用提供了基础。

6.结直肠癌免疫细胞浸润及SLC22A3表达的综合检查

本研究综合分析了结直肠癌中SLC22A3表达与免疫细胞浸润的关系。CIBERSORT分析显示免疫细胞异质性,ssGSEA揭示免疫通路活性。散点图表明SLC22A3与特定免疫细胞存在相关性,Pearson分析进一步探讨了其在免疫调节中的作用。

7.分析 CRC 和正常结肠上皮细胞系中的靶基因表达

定量PCR显示靶基因在CRC细胞系LoVo和SW480中显著上调,与正常结肠细胞NCM460相比,表达增加4倍和3倍,提示其在CRC中可能的关键作用,需进一步研究其临床应用潜力。

文章小结

本文通过双向孟德尔随机化研究,利用基因组关联研究数据,发现心力衰竭结直肠癌风险增加相关,为这两种疾病的预防和治疗提供了新见解。研究还深入探讨了SLC22A3基因在结直肠癌中的表达差异及其对免疫细胞浸润和预后的影响,为癌症治疗提供了潜在靶点(对这种思路感兴趣的老师,欢迎联系小编!

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