今天koi为大家分享一篇选题足够亮眼的孟德尔随机化，庞大的数据集和多种分析手段保证了可靠性，思路简单清晰，严谨可靠，想发孟德尔的老师千万不要错过！请速速联系小编哦！
文章标题：Macular structural integrity estimates are associated with Parkinson’s disease genetic risk
中文标题：黄斑结构完整性估计与帕金森病遗传风险相关
发表期刊：Acta Neuropathologica Communications
发表时间：20240813
影响因子：6.2/Q1
研究背景
帕金森病(PD)患者视网膜神经纤维层和神经节细胞内丛状层厚度减少，但视网膜结构完整性与PD遗传风险之间的联系尚不明确，尤其是年轻成人。
研究方法
西澳年轻成人接受OCT成像，记录视网膜厚度及其在20至28岁间的纵向变化。基于迄今为止最大的PD全基因组关联研究数据，估算每位参与者的多基因风险评分(PRS)，并评估PD PRS与视网膜厚度变化的关联。通过mBAT-combo注释和优先级排序基因，使用GWAS配对方法和HyPrColoc进行共定位分析，并利用孟德尔随机化框架结合视网膜和大脑的单细胞表达数据评估最可能的因果基因。
研究结果
1.多基因风险评分与视网膜完整性估计之间的关联
通过多组学MR框架，结合转录物-代谢物和代谢物-表型关联，确定了216个因果三元组。应用MVMR方法，发现77%的转录本对表型影响直接，非代谢物介导。
2.连锁不平衡评分回归和共定位
连锁不平衡评分回归未发现PD与GCIPL或黄斑RNFL有显著关联。GWAS-PW分析揭示GCIPL和PD间有三个共享区域，黄斑RNFL和PD间有两个共享区域。17号染色体一区域与GCIPL、黄斑RNFL及PD均相关，HyPrColoc分析显示此区域可能在视网膜完整性和PD间共享。
3.变体的注释和优先级
mBAT-combo分析发现PD和视网膜完整性共有27个基因，其中7个位于17号染色体。NSF通过LRRK2途径与PD相关。SMR分析显示NSF与GCIPL关联一致，单细胞表达数据突出CRHR1和KANSL1在PD、GCIPL和黄斑RNFL中的关联。错义变异分析确定25,173个变异，其中10,737个可能是病理性的，但未与eQTL和mQTL变异重叠。
4.组织特异性基因表达
关注NSF、KANSL1-AS1、CRHR1和WNT3基因，它们在共定位和SMR分析中被认为与视网膜神经节细胞完整性和PD共享。基于基因探针匹配度，这些基因在视觉皮层表达一致，52个视觉区域中表达水平平均7至9.6。需在大样本研究中验证这些发现。
文章小结
本研究首次发现帕金森病(PD)的多基因风险评分与年轻成人黄斑区视网膜厚度变化显著相关，揭示了视网膜结构完整性与PD遗传风险之间的联系。通过基因共定位分析，确定了27个与PD和视网膜完整性共有的基因，其中NSF、KANSL1-AS1、CRHR1和WNT3为潜在致病基因。研究结果为视网膜测量作为PD风险的早期标志物提供了科学依据，并强调了进一步纵向研究的重要性。对这种思路感兴趣的老师，欢迎联系小编！
