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文章标题：Epigenome-Wide Study Identified Methylation Sites Associated with the Risk of Obesity
中文标题：表观基因组范围研究确定了与肥胖风险相关的甲基化位点
发表期刊：Nutrients.
发表时间：20210609
影响因子：4.8/Q2
研究背景
肥胖是一个受多种基因和环境因素影响的复杂性状，近年来，表观遗传学作为基因与环境交互作用的重要机制，其与肥胖的关系成为研究热点。
研究方法
本研究采用全基因组甲基化位点搜索，结合甲基化定量性状位点(mQTL)数据和BMI的GWAS信息，通过基于SNP的多组学方法识别与肥胖风险SNP共定位的甲基化位点，并通过门德尔随机化验证这些位点是否对BMI有因果贡献。
研究结果
1.CCNL1 位点
共定位分析发现CCNL1基因上游cg21178254甲基化位点与肥胖风险SNP共定位，相关SNP rs62274156-T与BMI增加和该位点甲基化降低相关。MR分析显示，该位点低甲基化与肥胖风险增加相关。进一步分析表明，cg21178254甲基化影响CCNL1表达，可能通过调节其表达影响BMI。
2.SLC5A11 轨迹
研究发现SLC5A11基因内cg06028605位点mQTL与肥胖风险SNP重叠，相关SNP rs34172679-T与低BMI和高甲基化相关。MR分析显示，该位点低甲基化与高BMI相关。进一步分析表明，该位点甲基化改变SLC5A11表达，影响BMI。
3.MAST3 基因座
共定位和MR分析揭示MAST3基因cg02814054甲基化位点与肥胖相关。该位点mQTLs、MAST3 eQTLs和BMI风险SNPs关联图重叠。甲基化增加与MAST3表达降低、BMI增高相关。MR分析显示，该位点甲基化导致MAST3表达下降，增加肥胖风险。
4.2p23.3 中的稀有变体
研究罕见肥胖SNP是否通过甲基化位点cg01884057影响肥胖。ClinVar数据库资料显示，2p23.3区域的罕见SNP与该位点mQTL重叠。MR分析表明，该位点高甲基化与高BMI相关，且与POMC、ADCY3和DNAJC27基因低表达相关，这些基因低表达与肥胖风险增加有关。
文章小结
本研究通过整合mQTL与GWAS数据，运用多组学方法和门德尔随机化技术，鉴定了与肥胖风险相关的甲基化位点。研究发现CCNL1、SLC5A11和MAST3基因的甲基化改变与肥胖发生有因果关联，揭示了通过调节基因表达影响体重的分子机制。此外，研究还探索了罕见变异对肥胖影响，为理解肥胖的遗传和表观遗传背景提供了新见解。对这种思路感兴趣的老师，欢迎联系小编！
