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文章标题:Identification of potential therapeutic targets for nonischemic cardiomyopathy in European ancestry: an integrated multiomics analysis
中文标题:确定欧洲血统中非缺血性心肌病的潜在治疗靶点:综合多组学分析
发表期刊:Cardiovasc Diabetol'
发表时间:20240912
影响因子:8.5/Q1
研究背景
非缺血性心肌病(NISCM)是一种缺乏有效治疗靶点的临床挑战。本研究旨在通过多组学分析,为NISCM识别有前景的药物靶点。
研究方法
研究者利用deCODE研究的顺式pQTL数据和FinnGen研究的SNP数据,通过孟德尔随机化分析评估血浆蛋白水平与NISCM风险的因果关系。对显著关联的蛋白质进行FDR校正,并进行贝叶斯共定位分析,进一步分析了LILRA5和NELL1的表达,并使用HPA数据库验证了蛋白质表达。通过CTD数据库评估了环境暴露对LILRA5的影响,分子对接鉴定了潜在的小分子相互作用。
研究结果
1.血浆蛋白对 NISCM 的因果效应估计
通过双样本MR分析,我们从deCODE和FinnGen研究中识别出与非缺血性心肌病(NISCM)显著相关的255种血浆蛋白,经FDR校正后,16种蛋白与NISCM风险显著关联。
2.NISCM 对 cis-pQTLs 进行遗传共定位分析
为消除SNP键不平衡偏倚,对16种血浆蛋白进行贝叶斯共定位分析,精确识别药物靶点。分析支持LILRA5和NELL1与NISCM显著相关(PP.H4 > 0.8),其他14种蛋白PP.H4值低于0.8。
3.差异表达分析和蛋白质分布
分析了多个NISCM数据集,发现LILRA5在糖尿病、肥厚、扩张和炎性心肌病中表达降低,而NELL1在肥厚型心肌病中表达升高。HPA数据库验证了LILRA5在心脏免疫细胞中的高表达,而NELL1在正常心脏组织中几乎无表达。
4.免疫细胞浸润分析
敏感性分析验证了CYP2E1、TP53INP1等基因与糖尿病的显著关联,未发现水平多效性,TP53INP1与T2D及SUOX、PRKD2与DR的异质性显著。
5.潜在药物靶点分析
敏感性分析验证了CYP2E1、TP53INP1等基因与糖尿病的显著关联,未发现水平多效性,TP53INP1与T2D及SUOX、PRKD2与DR的异质性显著。
文章小结
本研究通过多组学分析,识别出LILRA5和NELL1作为非缺血性心肌病的潜在治疗靶点。利用孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析,确认了这两种蛋白与疾病的显著关联。研究还发现多种小分子能稳定结合LILRA5,为药物开发提供新方向。创新点在于结合分子对接和环境暴露分析,揭示了LILRA5在心肌病中的免疫调节作用。对这种思路感兴趣的老师,欢迎联系小编!