研究目的
研究方法
本研究从TCGA数据库获取了转录组测序数据和临床病理信息，同时从GEO数据库下载了10X单细胞测序数据集（GSE176078）。外泌体相关基因（ERGs）则通过ExoCarta和Gene Set Enrichment Analysis数据库进行筛选。为了鉴定外泌体相关预后基因（EPGs），研究采用了Kaplan-Meier生存分析、Lasso Cox回归分析以及随机森林Cox回归分析。在聚类分析中，使用R包的ConsensusClusterPlus来确定外泌体相关亚型，利用Seurat包进行单细胞数据的对象化和质量控制，通过SingleR包对标准细胞类型进行注释。此外，本研究还使用AUCell包对EPGs进行评分，并借助CellChat包定量推断和分析细胞间的通讯情况。
研究结果
此外，本研究表明FGF9的表达与树突状细胞浸润正相关，EPCAM的表达与巨噬细胞浸润正相关，SF3B4的表达则与巨噬细胞、中性粒细胞及CD4+ T细胞的浸润正相关。EPGs的表达特征与对外源刺激反应的生物学过程密切相关。在细胞通讯方面，恶性上皮细胞与成纤维细胞、内皮细胞、单核细胞及巨噬细胞的相互作用强度较高，其中恶性上皮细胞与成纤维细胞和内皮细胞的相互作用尤为显著。恶性上皮细胞间通讯的主要信号通路为MIF通路和CCL通路，且巨噬细胞在其中占据主导地位。
研究结论
本研究揭示了外泌体相关预后基因在HER2+ BC肿瘤微环境中的作用，并评估了其作为临床标志物的潜力。这些发现为深入研究相关基因的功能和分子机制提供了宝贵的生物信息学基础。
*本文不构成任何诊疗相关意见和建议，仅供医疗人员参考学习
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