Anal.Chem丨Taylor-Aris Dispersion-Assisted 质谱法用于非变性蛋白质的分析

学术   2024-07-12 11:39   北京  

近期德布勒森大学的Attila Gáspár的科研团队在Analytical Chemistry期刊上发表题为“Taylor–Aris Dispersion-Assisted Mass Spectrometry for the Analysis of Native Proteins”的文章。Taylor-Aris Dispersion-Assisted质谱法 (TADA-MS) 可以使分析基质中大分子直接注入质谱进行测定。研究了天然条件下存在的不同类型的蛋白质和蛋白质复合物的行为,表明了该方法的明显优势。

在物学相关的天然构象(三级或通常为四级结构)下研究蛋白质可以更好地理解和揭示蛋白质的生物学功能。目前的质谱分析方法分析蛋白质都有所局限,电喷雾电离 (ESI) MS 通常采用使蛋白质变性的苛刻条件,Native MS 则只是保持ESI 之前溶液中蛋白质/蛋白质复合物的状态,无法模拟生理环境。先前研究表明ESI-MS 可用于液体溶液中的蛋白质的天然分析,因为在测量过程中溶液相蛋白质的结构在动力学上被捕获在气相中。然而,当蛋白质在模拟生理条件的溶液中被引入 MS 时(通常使用非挥发性盐,如 pH 为 7 的磷酸盐或含有∼150 mM NaCl 的 Tris 缓冲液),就会产生严重的干扰。这些盐的存在会导致灵敏度急剧下降。因此想要高精度分析Native状态下的蛋白质,需要对现有技术进行革新。
作者发现Taylor-Aris Dispersion在避免 ESI-MS 测定大组分时可以避免信号干扰问题。该方法样品在进入ESI前加一个毛细管,利用样品中蛋白质和基质组分之间的巨大扩散常数差异(图 1),可以直接从其配方缓冲液中分析蛋白质。如图1所示,在毛细管层流下,这种效应导致前部和尾部区域的大分子(蛋白质)和小分子部分分离,因此分析前无需进行预分离或纯化。

图1 不同尺寸分子的Taylor–Aris Dispersion示意图
         

 

作者首先使用Native TADA-MS对单克隆抗体(mAb)药物进行分析。商业可得的mAb中不兼容 MS 的成分含量较高,无法用于直接输注实验。作者对单克隆抗体药物ramucirumab小样品塞进行了 Native TADA-MS 分析,得到了典型的强度分布数据图(图2)。样品塞前部的 ESI-MS 信号比中部高得多 (图 2a)。在前部获得的质谱清晰且易于评估,这表明该区域含有纯净形式的 mAb (图 2b)。解卷积光谱中的主要峰(图 2b,d) 可在 146595.0 146754.4、146916.7 和 147078.7 Da 处观察到,分别对应于 G0F/G1F、G1F/G1F 或 G0F/G2F、G2F/G1F、G2F/G2F 糖型。然而,由于样品基质(盐、缓冲化合物和去垢剂)造成的强烈干扰(离子抑制和许多不同加合物离子的形成),在样品塞的中部没有观察到抗体信号的痕迹 (图 2c)。样品塞的后部也显示出清晰的 mAb 光谱(图 2d),可能的原因是 TA 分散的前区和后区的纯度水平相似。在 TADA-MS 测量中,还可以检测到 mAb 二聚体(图 2b、d 的插图)。Ramucirumab的 TADA-MS 分析可以测定完整 mAb 的分子量,同时在天然条件下,也无需应用任何常见的初步基质去除程序,具有可辨别的糖基化模式。而在直接进样而不利用 TADA 的情况下,无法提供所研究 mAb 的完整分子量或糖基化模式。

图2 Ramucirumab的Native TADA-MS 分析


接下来作者对具有四级结构的刀豆凝集素 A(Con A)进行Native TADA-MS分析。Con A 是一种凝集素,能特异性识别甘露糖和葡萄糖。Con A 的不同寡聚体(二聚体、四聚体和六聚体)可以在溶液中共存,它们的相对量取决于蛋白质浓度和基质材料。四聚体具有球状结构。Con A 的碳水化合物结合亲和力取决于 Ca 2+和 Mn 2+离子,因为金属离子可以稳定蛋白质的结构。在用 TADA-MS 对 Con A 进行天然分析时,二聚体和四聚体成分提供强信号,而单体和六聚体形式的信号强度则小得多(图 3b)。在对蛋白质变性直接注入 MS 测量的情况下,无法检测到四聚体(图 3a)。在变性模式下,二聚体和单体是可检测到的,并且两个水解亚基中的一个产生最高强度的信号(图 3a 中的 7+、8+ 和 13+ 电荷状态)。这两个水解亚基是在蛋白质成熟过程中形成的。在Native TADA-MS 测量中,四聚体和二聚体的主要电荷数分别为 21+ 至 23+ 和 15+ 至 16+。需要指出的是,四聚体和二聚体的理论主电荷数分别为 25+ 和 18+。由于这些电荷数的计算是基于蛋白质的球形,TADA 测量可能表明 Con A 具有更球形的形状。由于二聚体和四聚体的峰较宽(由加合物形成引起),而单体的强度较低,因此无法在天然光谱中证实与蛋白质相关的金属离子的存在。施加源内碰撞诱导解离的能量,让低聚物解离,得到单体 Con A 的模拟光谱(图 3d),在加入金属离子Ca 2+和 Mn 2+离子后,模拟光谱发生变化(图 3f),证实其可以识别这些金属离子。

图3 Con A的 Native MS 分析和Native TADA-MS 分析

综上,作者证实了 TADA-MS 在天然蛋白质分析中的优良性能。TADA-MS 能够大大减少基质干扰,检测灵敏度显著提高,且在分析过程中可以使用更多“类似天然”的条件;允许将非质谱兼容基质直接注入质谱,使得工作流程简化和经济化。


编辑:苗腾元

审核:王祎纯

作者信息

Attila Gáspár professor
University of Debrecen, Faculty of Science and Technology, Institute of Chemistry, Department of Inorganic and Analytical Chemistry
Research Interest:
fundamental research on the fields of microfludics/lab-on-a-chips, electromigration separation methods, glycoenzyme research and special fields of environmental analysis, which are all emerging

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