中国科学院武汉植物园丁俊研究员和武汉纺织大学/武汉大学冯钰琦教授课题组于近期在Analytical Chemistry杂志上发表了题为“An 8-(Diazomethyl) Quinoline Derivatized Acyl-CoA in Silico Mass Spectral Library Reveals the Landscape of Acyl-CoA in Aging Mouse Organs” 的论文。此研究中,该团队开发了8-(二氮甲基)喹啉(8-DMQ)作为标记试剂对酰基辅酶A的化学衍生化策略,大大提高了检测灵敏度。通过应用从8-DMQ-酰基辅酶A真实标准的MS/MS谱图中学习到的MS/MS碎裂规则,创建了酰基辅酶A的MS/MS库,涵盖8,336种酰基辅酶A,以促进了酰基辅酶A的高通量和自动注释。
酰基辅酶A(acyl-CoA)作为羧酸的活化形式,深度参与脂质的合成。酰基辅酶A丰度低,极性差异大,色谱拖尾,质谱响应差,因此,作者们在此项工作中采用含有偶氮基和喹啉基的8-DMQ衍生化(图1)。8-DMQ-酰基辅酶A表现出显著改善的色谱行为和质谱检测灵敏度(三个数量级提升),由于8-DMQ标记后疏水性增强,8-DMQ-酰基辅酶A的保留力变得更强,有利于短链的酰基辅酶A。
图1 8-DMQ衍生化酰基辅酶A
接着,作者们探究8-DMQ-酰基辅酶A的碎片化模式规则以使用计算机模拟串联质谱库。8-DMQ-酰基辅酶A的结构由多个块组成,包括一个8-DMQ残基、一个腺苷3′,5′-二磷酸(3′,5′-ADP)残基、一个泛酸残基、一个β-巯基乙胺残基和一个酰基团。乙酰辅酶A的对应MS/MS光谱如图2所示,并对碎片离子进行了仔细注释,其中m/z 303.1373处的基峰源自于失去3-磷酸腺苷二磷酸-8-DMQ。对于8-DMQ-C18:0 (α–OH)-辅酶A(图2B)也获得了类似的碎片离子。在仔细研究所有8-DMQ-酰基辅酶A的MS/MS光谱后,证实碎片化模式规则是普遍存在的(图2C)。因此,作者们将该规则作为其他8-DMQ-酰基辅酶A串联质谱的计算机模拟预测的启发式信息。
图2 8-DMQ-酰基辅酶A的串联质谱分析
图3 in silico构建8-DMQ-酰基辅酶A数据库
图4 小鼠的酰基辅酶A分析
图5 8-DMQ-酰基辅酶A色谱R.T.预测评估
编辑:SHX
审核:QLP
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作者信息
丁俊研究员
中国科学院武汉植物园
致力于代谢组学分析、质谱数据库构建、代谢组图谱绘制、代谢组学与多学科交叉研究等方面的研究工作。
冯钰琦教授
武汉纺织大学、武汉大学
主要研究方向为分离分析技术、基于质谱技术的代谢组学分析新方法、亚代谢组数据库构建等。