超分子化学|用于机械笼状分子可控拆装的可裂解大环的通用方法

文摘   2024-08-26 21:00   四川  

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文概述


    目前一些受互锁寡核苷酸、多肽和结蛋白启发的合成体系已经被报道,在这些合成体系中,一个大环通过打破机械键来打开一个生物活性物种。然而,到现在为止,每个例子都使用了定制的化学设计。University of SouthamptonStephen M. Goldup教授提出了一种机械笼状结构的通用方法,其中单个大环前体在后期具有多样化的结构,包括一系列触发单元,这些触发单元在响应酶、化学或光化学刺激时控制环的打开。作者还证明了他们的方法适用于其他类型的适合轮烷和索烃形成的大环。这篇文章于2024年以A Platform Approach to Cleavable Macrocycles for the Controlled Disassembly of Mechanically Caged Molecules为题,发表于Angewandte Chemie (IF=16.1)上。



图文解析



    合成机械互锁分子的方法已经在一系列原型应用中得到证明,包括催化,传感,材料和分子机器。这些应用背后的基本原理是,机械键产生了在单个共价子组分中找不到的特性,从普遍但实际上很重要的特性(例如,溶解度的变化)到基本的特性(例如,不寻常的立体化学)。虽然早在1912年就讨论了合成连锁分子,但与许多事物一样,这些概念已经在生物系统中得到应用;在1967年首次观察到链状DNA,与第一个合成链状烷被表征的时间大致相同。后来又鉴定出微霉素J25的螺纹结构,即套索肽。在这两种情况下,机械键的作用被认为是通过保护生物分子免受核酸酶和蛋白酶的作用来稳定生物分子。

将具有理想功能的分子笼化,通过在其结构中加入牺牲性单元,使其在酶、化学或光化学的键裂解反应中变得不稳定,这是药物化学、化学生物学和软材料中一个公认的概念。最近出现了用轮烷或索烃中的机械键来保持化学或生物活性的例子。2009年,PapotLeigh团队报道了一种机械笼化的肽前药,其中环绕轴的大环保护肽免受蛋白酶介导的降解并抑制其生物活性。当酯酶介导的堵塞单元裂解将轴从大环中移除时,这种活性可以恢复。第二代该系统通过裂解大环成分来响应β-半乳糖苷酶,释放基于紫杉醇的前药。最近,Lewis, Vilar团队报道了一种机械笼化的四重体结合Pt复合物,其活性可以通过酯介导或光切割轴来恢复。同样的概念也被证明在催化的背景下;Chiu团队报道了一种机械互锁的Cu配合物,其中机械键抑制金属离子的催化行为,可以通过裂解大环来恢复。Papot团队最近报道了一种具有类似功能的索烃。

尽管机械笼式方法取得了成功,但所报道的系统的缺点是它们通常是针对特定应用或目标定制的。在这里,作者提出了一种方法,用于制备机械笼状结构,其中刺激响应单元可以在合成的后期阶段变化。为了实现这一目标,作者采用Curtius重排[1]策略,将可切割单元整合到一个常见的高级中间体中,并将一个基于亚甲基烷氧基氨基甲酸酯牺牲单元的牺牲连接剂中,以确保机械键被快速切割,而不会产生副反应,导致无活性副产物。

[1]Curtius重排是一类亲核重排反应,反应中,羧酸与叠氮化物作用生成酰基叠氮化物再重排为异氰酸酯,异氰酸酯水解得到少一碳的伯胺,该反应可用于几乎所有羧酸,是制备伯胺的方法之一。

作者最初打算将邻苯乙氨基甲酸酯单元纳入到一个合适的含联吡啶的大环中,正如之前Papot团队所使用的那样对于活性模板,Cu介导的炔叠氮环加成反应(AT-CuAAC)使反应后期进行连接触发单元是可能的。因此,作者用简明Ni介导策略的方法合成了羧酸大环1a。随后与二苯基反应叠氮磷酰(DPPA,方案1a)将1a转化为相应的酰基叠氮化物在苯酚存在下重排生成活化氨基甲酸酯。然后与醇2a反应,得到大环3a。用氟源处理3a,预计会去除触发单元,得到苯胺5a,然后苯胺5a会开环,生成邻醌甲基化物。

Scheme 1. Synthesis by Curtius rearrangement and ring opening of a) first-generation macrocycles 3 based on an established self-immolative motif(carbamoyl aniline bearing an ortho leaving group); b) second-generation cleavable macrocycle 9 containing a carbamoyl hemiaminal ether selfimmolative motif. Reagents and conditions: i. DPPA, NEt3, PhMe, 80 ℃; ii. 2 a, DMAP, NEt3, THF, 50 ℃; iii. TBAF (3 equiv.), THF- H2O (3 :1),37 ℃; iv. 2a, DPPA, K2CO3, CH2Cl2, rt

方案1.通过Curtius重排和开环合成a)基于已建立的自牺牲单元(带有邻位离去基团的氨基甲酰基苯胺)的第一代大环3b) 含有氨基甲酰半缩醛胺醚自牺牲结构的第二代可裂解大环9试剂和条件:i. DPPANEt3PhMe80 ℃ii. 2aDMAPNEt3THF50 ℃iii. TBAF3当量)、THF-H2O3:1)、37 ℃iv. 2aDPPAK2CO3CH2Cl2、室温。

Scheme 2. Synthesis of macrocycles 9, their conversion to rotaxanes 14 and their subsequent axle-releasing reactions (Ar = 3, 5-di-tBu-C6H3). Reagents and conditions: i.2, DPPA, K2CO3, CH2Cl2, rt; ii. CuSO4, sodium ascorbate, THF-H2O (10:1), rt, 16 h.

方案2.大环化合物9的合成、其转化为轮烷14以及随后的轴释放反应(Ar=3, 5-di-tBu-C6H3)。试剂和条件:i. 2DPPAK2CO3, CH2Cl2,室温;ii. CuSO4、抗坏血酸钠、THF-H2O10:1),室温,16 h

然而,3a和相应的轮烷都没有发生明显的开环,LCMS分析仅观察到微量开环产物。相反,用TBAF处理导致快速转化为相应的苯胺(例如5a),该苯胺持续存在并通过对醌甲基4烷基化得到苯取代苯胺7a。这些结果表明,苯胺5a在开环方面具有动力学稳定性,这可能是由于苯胺单元的给电子作用较弱,或者是由于酚酸酯的离去基能力较差。因此,作者合成了大环3b,其中苯胺单元更富电子,并且增加了酚酸单元的离去基能力。令人高兴的是,用TBAF处理3b或相应的轮烷导致开环,使6b和其他开环产物成为主要物种。同时也观察到相应的烷基化副产物7b

尽管电子激活的大环3b进行了开环,但从应用(仍观察到烷基化苯胺7b)和合成(从商业材料出发的9个线性步骤,总收率为10 %)的角度来看,它都是低效的。因此,作者考虑了其他牺牲连接物,并确定了最近报道的亚甲基烷氧基氨基甲酸酯单元,该单元通过相应的半胺醚进行裂解。因此,作者合成了羧酸大环8,并成功地应用Curtius重排策略获得了大环9a。令人高兴的是,用TBAF处理9a导致大环迅速消失,出现开环产物(例如11)。

Table 1: Summary of the isolated yields for macrocycles 9 and rotaxanes 14, the stimuli they respond to and their observed reactivity.

[a] Indicates whether cleavage was observed under previously reported conditions (see ESI section S7) for the corresponding trigger.

1:大环化合物9和轮烷14的分离产量、它们所响应的刺激以及观察到的反应性汇总。

[a]表示在先前报告的条件下是否观察到相应触发条件的裂解。


Figure 1. a) 1H NMR (THF-d8-D2O [3:1], 500 MHz, 298 K) analysis of the cleavage of rotaxane 14 a: i. rotaxane 14 a (‘is used to signify signals arising from the minor diastereomer); ii. rotaxane 14 a+TBAF(3 equiv.) after 1 h; iii. axle 15 (labels and colors as in Scheme 2,. b)LCMS analysis of the cleavage of rotaxane 14 e: i. rotaxane 14 e; ii. rotaxane 14e+β-galactosidase after 24 h; iii. axle 15. c) Solid state structure of NO2-derivative of rotaxane 14 g (R = pNO2- C6H4) highlighting the steric crowding caused by the interlocked structure. Colors as in Scheme 2, except O (grey), N (dark blue), H (white).

1. a) 1 H NMRTHF-d8-D2O [3:1]500 MHz298 K)对轮烷14a裂解的分析:i.轮烷14a用于表示由较小非对映异构体产生的信号);ii.轮烷14a+TBAF3当量)1后;iii. 轮轴15(标签和颜色如方案2所示。b) LCMS对轮烷14e裂解的分析:i.轮烷14eii. 轮烷14e+β-半乳糖苷酶24小时后;iii. 15c) 轮烷14gNO2衍生物的固态结构(R=pNO2-C6H4),突显了互锁结构造成的空间拥挤。颜色与图2相同,但O(灰色)、N(深蓝色)、H(白色)除外。

Scheme 3. a) Synthesis and photochemical cleavage of catenane 17. b)Synthesis and enzymatic leavage of paclitaxel-derived rotaxane 20.Reagents and conditions: i. [Cu(MeCN)4]PF6, NiPr2Et, CHCl3-EtOH(1:1), 60 ℃, 4 h (pseudo high dilution); ii. Irradiation (UVA,λmax=365 nm), CH3CN-H2O (9:1), rt; iii. [Cu(MeCN)4]PF6, NiPr2Et,CH2Cl2, rt, 3 h; iv. β-Galactosidase, phosphate buffer-DMSO (9 :1),37 ℃, 24 h.

方案3. a) 索烃17的合成和光化学裂解。b)紫杉醇衍生的轮烷20的合成和酶促裂解。试剂和条件:i. [Cu(MeCN)4]PF6NiPr2EtCHCl3-EtOH1:1),60℃4 h(伪高稀释度);ii.辐射(UVAλmax=365nm),CH3CN-H2O9:1),室温;iii.[Cu(MeCN)4]PF6NiPr2EtCH2Cl2,室温,3 hiv. β-半乳糖苷酶,磷酸盐缓冲液-DMSO9:1),37 ℃24 h

羧酸大环8可通过5步合成,起始原料易得,产率合理(总产率为30 %),一步即可转化为氨基甲酸酯大环9,这使其成为开发可裂解大环化合物(用于机械笼状分子)的绝佳方案。为了证明这种方法的强大功能,作者合成了大环化合物9b-f家族,其中包含先前报道的触发单元,可对化学(9b)、光化学(9cd)和酶(9ef)刺激作出反应(如方案2所示),所有这些刺激均发生了预期的开环反应(如表1所示)。作者还合成了苄基氨基甲酸酯大环化合物9g,它在化学或光化学刺激下无法开环,在碱性(0.1 M NaOH24 h)或酸性(0.1 M HCl24 h)条件下处理后恢复不变,证实了氨基甲酰基半缩醛胺醚单元是稳健的,因此大环化合物9a–f的开环是通过去除触发物质而发生的。

令人高兴的是,在AT-CuAAC条件下,大环化合物9与炔烃12和叠氮化物13发生反应,以高产率合成了轮烷14(如方案2和表1所示),当受到相应的脱笼刺激时,作者能够通过1H NMR(例如图1a)或LCMS(例如图1b)分析观察到轮轴15的释放和大环开环无环产物的出现。同样,轮烷14g对化学或光化学刺激都很稳定。1H NMR分析(如图1ai所示)也突出了这些分子不寻常的立体化学;立体异构半缩醛胺醚中心使大环既具有手性(合成为外消旋体)又具有取向性,因此相应的轮烷同时表现出共价和机械立体化学。因此,轮烷14以一对外消旋的机械差向异构体的形式形成(比例约为2:1),这在一定程度上使其通过NMR表征变得复杂,因为在许多共振中观察到两组信号(例如三唑质子Hf),而由于对映体是纯的半乳糖单元,14e的情况进一步加剧了这种现象。

不幸的是,对于14f,作者无法观察到所需的开环行为;当14f在成功裂解9f的条件下暴露于青霉素G-酰胺酶时,LCMS未检测到任何开环产物。尽管已证实母体大环不稳定,但作者暂时将轮烷14f未能进行酶促裂解的原因归因于轮烷部分的空间体积阻止了底物进入酶活性位点。事实上,带有硝基的轮烷14g类似物的固态结构(R=pNO2-C6H4,如图1c所示)突显了这些分子互锁区域的球状性质。这表明先前报道的酶促触发单元可能需要重新优化才能应用于互锁结构。9形式的联吡啶大环是用于合成互锁分子的多功能中间体。因此,当在拟高稀释条件下用炔烃/叠氮化物前大环16代替半轴组分时(如方案3a所示),大环9c以良好的产率(74 %)生成了索烃17。与轮烷14c一样,17的辐射导致快速开环,释放出含三唑的大环18。此外,AT-CuAAC反应可耐受多种功能化底物。为了证明这一点,作者合成了轮烷20(如方案3b所示),它是Papot团队先前报道的笼状紫杉醇衍生物的直接类似物,使用大环9e和紫杉醇衍生的炔烃19,在温和条件下以合理的产率(51 %)生成。在体外用β-半乳糖苷酶处理20,导致环开裂,释放轮轴21

最后,鉴于许多用于合成互锁结构的大环在大环框架内含有sp3C-X键(X=ON),作者后期用于安装可裂解连接体的Curtius重排方法具有在广泛环境中应用的潜力。为了证明这一点,作者合成了含有羧酸部分的冠醚22,并将其转化为TBAF可裂解的大环23(如方案4所示)。大环23可以在有机催化活性模板条件下转化为轮烷26,产率合理,并且如预期的那样,在用TBAF处理后迅速开环以释放轮轴27

总之,作者展示了一种简单的可裂解大环化合物的方法,该方法可用作合成机械笼状分子的通用方法。作者方法的主要特点是后期Curtius重排,使作者能够同时安装触发部分并创建氨基甲酰半缩醛胺醚自毁单元。使用这种方法,作者能够利用以前报道的触发部分展示光裂解、酶裂解和化学裂解的大环化合物以及由它们衍生的轮烷和索烃。此外,作者展示了他们的方法概念可以扩展到不同类型的大环化合物,例如冠醚。大环化合物920代表了制备机械笼状分子的极好的新资源。此外,作者提出的Curtius重排方法可以扩展到许多其他大环,用于合成互锁结构。

解读感想

本文作者展示了一种简单的可裂解大环化合物的方法,该方法可用作合成机械笼状分子的通用方法。通过后期Curtius重排作者能够同时安装触发部分并创建氨基甲酰半缩醛胺醚自毁单元,形成自锁结构,并可以拓展到许多其他大环化合物,为合成新的笼状化合物提供了一种新的途径。

阅读人简介

金羽冲,20岁,江苏南通人;

邮箱1730075877@qq.com;

学习及工作经历2022.09~2026.06 本科生 西华大学化学专业

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审核|单飞狮

编辑|李蓓

研究碳点生
碳生万物,万物造寰宇。 点孕千粒,千粒化自然。
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