文章精选 | 广东工业大学邓洁薇/五邑大学栾天罡–TCDD诱导的氧化应激对DNA损伤的影响

文摘   2024-05-21 20:27   新加坡  
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第一作者:王超,刘晓鑫

通讯作者:邓洁薇 副教授

通讯单位:广东工业大学

论文DOI:https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2024.134485


2、3、7、8-四氯二苯并-对二恶英(TCDD)是一种剧毒的持久性有机污染物,可引起细胞DNA损伤。尽管TCDD引起氧化应激和基因毒性受到了广泛的研究,但两者的关系及其对DNA的损伤机制仍有待进一步探讨。本研究发现TCDD诱导HeLa细胞中ROS生成和AP位点DNA损伤具有相同趋势。进一步研究发现,TCDD破坏了超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化氢酶(CAT)的活性,破坏了细胞的抗氧化防御系统,进而增加了O2.−和NO的产生,导致氧化应激过程中AP位点的DNA损伤。碱基切除修复(BER)通路中关键基因的表达以及阻断O2.−和NO后的表达导致AP位点DNA碱基损伤的缺失进一步验证了我们的研究结果。此外,转录组测序还显示,TCDD通过上调丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、环磷酸腺苷(cAMP)和乳腺癌通路中与氧化应激相关的基因来诱导DNA损伤(图1)。


                   

图1 图文摘要

高内涵荧光成像同时监测TCDD诱导HeLa细胞中ROS生成和AP位点DNA损伤,发现其诱导产生的APE1导致的AP位点的DNA碱基损伤与ROS的增加同时发生。进一步计算了每个HeLa细胞的荧光强度,并获得了12 h和24 h的一系列数据点。构建了典型的小提琴散点图,数据分布显示,随着TCDD浓度的增加,12 h和24 h的AP位点的DNA碱基损伤和ROS的增加与TCDD的浓度呈剂量依赖性(图2)。


 

图2 不同浓度和时间TCDD处理HeLa细胞后DNA损伤和ROS产生的变化。(A, C) 12 h和24 h不同浓度TCDD(0-300 nM)处理HeLa细胞后AP位点DNA碱基损伤(红色)与ROS(绿色)产生的荧光成像。(B-C, E-F)每个HeLa细胞AP位点DNA碱基损伤和ROS荧光强度的小提琴图分析。

选择高、中、低三种浓度(10、100、300 nM)TCDD暴露后检测了细胞抗氧化防御的超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化氢酶(CAT)的活性。随着TCDD浓度的增加,SOD和CAT酶活性呈剂量依赖性的增加(图3A-B),表明TCDD损伤了细胞内的抗氧化防御系统。随后,使用线粒体O2.−探针和NOS探针检测细胞中O2.−和NO水平的变化。如图3C-D所示,TCDD诱导了HeLa细胞中O2.−和NO水平的升高,且呈浓度依赖性。


图3 TCDD对HeLa细胞抗氧化防御和ROS产生的影响。(A-B)不同浓度TCDD处理24 h后CAT和SOD的变化。(C-D)不同浓度TCDD和Tempol、7-NI处理24 h后O2.−和NO的变化。

使用线粒体O2.−清除剂Tempol和NOS抑制剂7-NI,抑制O2.−并阻断线粒体NOS的活性(图3A-B)。同时,用ZnO2@DNA荧光探针检测TCDD暴露诱导的HeLa细胞的DNA损伤。荧光成像显示,当O2.−/ONOO−未被清除和NOS未被阻断时,细胞内DNA损伤呈浓度依赖性的增加(图 4A)。然而,当使用O2.−/ONOO−清除剂或NOS阻断剂时,没有观察到荧光信号(图 4B)。这些结果表明,TCDD暴露可诱导HeLa细胞氧化应激产生O2.−和NO,导致AP位点的DNA碱基损伤。



图4 不同浓度TCDD和Tempol、7-NI处理HeLa细胞AP位点的DNA碱基损伤的变化。(A)单独TCDD处理24 h后AP位点的DNA碱基损伤的荧光成像。(B)TCDD和Tempol、7-NI处理24 h后AP位点的DNA碱基损伤的荧光成像。(C)TCDD诱导的氧化应激引起的AP位点DNA碱基损伤示意图。

BER是一种主要的氧化应激引起DNA碱基损伤的修复途径。当细胞内DNA的氧化损伤程度较高时,相应的BER修复途径中的APE1酶的表达也会增加。细胞中的APE1可以特异性地识别DNA探针中的AP位点。通过Western blot检测BER通路中的APE1蛋白的表达,发现TCDD可以显著增加APE1蛋白的表达(图5B)。为了进一步探讨TCDD对BER通路的影响,使用q-PCR测定了BER通路中几个关键调控因子OGG1、APEX、FEN1、POLB和POLD、XRCC1、PARP1基因的表达(图3A)。结果显示,TCDD暴露后HeLa细胞中多个基因的表达显著增加,且呈TCDD浓度依赖性,其中OGG1和APE1是最常见的指示DNA氧化损伤基因。两者的显著性差异最大。



图5 BER通路中APE1蛋白和关键基因表达的变化。(A)BER通路关键基因的功能示意图。(B)Western blot分析不同浓度TCDD(10, 100, 300 nM)处理的HeLa细胞后APE1蛋白的表达。(C)q-PCR检测OGG1、APEX、FEN1、POLB、XRCC1和PARP1 mRNA的表达。

转录组差异表达基因(DEGs)分析结果发现,CYP1A1、CYP1B1、IL1A、ALDH3A1、NR1D1、TIPARP等基因的表达均显著上调。这些基因在氧化应激引起的DNA损伤中起着至关重要的作用。此外,SGK1、HSPA8、HSPA1A、TM4SF1、NPR3等基因的异常表达与肿瘤的发病机制密切相关,证实了TCDD的致癌性。通过构建差异基因簇热图可视化了TCDD暴露组和对照组中的DEGs。两组在氧化应激后,DNA损伤基因CYP1A1、CYP1B1、IL1A、ALDH3A1、NR1D1、TIPARP以及基因SGK1、HSPA8、HSPA1A、TM4SF1、NPR3的表达均有显著性差异(图6C)。利用GO富集分析进一步探索了这些DEGs的功能,在TCDD处理HeLa细胞后,富集最大的三种生物功能是蛋白结合、膜成分和质膜成分(图6D)。富集的三大功能的生物过程中,信号转导、RNA聚合酶II对转录的正调控、转录调控和DNA模板最为丰富。在细胞组分中,细胞膜、细胞质和质膜组分最丰富。分子功能方面蛋白质结合最为丰富,其次是金属离子结合和核苷酸结合(图6E)。


图6 TCDD处理的HeLa细胞的基因表达差异分析(A)TCDD处理的HeLa细胞后DEGs的数量。(B)DEGs的火山图;(C)前100个DEGs的热图分析,橙色和蓝色分别表示DEG的上调和下调。(D)前20个DEGs的GO富集分析的可视化气泡图。(E)DEGs在分子功能、细胞结构、生物过程富集分析的前10、10和7个功能。

随后,对暴露于TCDD后的HeLa细胞中的DEGs进行了KEGG富集分析,主要富集在MAPK、昼夜节律、雌激素、乳腺癌、cAMP和基底细胞癌等相关的信号通路(图7A)。这些通路主要分布在环境信息处理和人类疾病这两个模块中(图7B)。我们进一步对与氧化应激诱导的DNA损伤相关的与氧化应激相关的DEGs,如CYP1A1、NR1D1、IL1A、GADD45和NFκB进行了q-PCR验证,实验结果与转录组结果一致(图7D)。此外,在乳腺癌和MAPK通路中富集的IL1A、GADD45、FOS、JUN、NFκB等基因在DNA损伤修复、细胞周期和凋亡中也发挥重要作用(图5C)。



图7 TCDD处理的HeLa细胞后DEGs的KEGG通路富集分析。(A) KEGG通路富集分析的可视化气泡图。(B) DEGs的KEGG在细胞过程、环境信息处理、遗传信息处理、人类疾病、代谢和生物系统的富集分析。(C)q-PCR检测DEGs中与氧化应激相关基因CYP1A1、NR1D1、GADD45、IL1A和NFκB的mRNA表达情况。

本研究发现TCDD升高了超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化氢酶(CAT)的活性,破坏了HeLa细胞的抗氧化防御系统,增加了O2.−和NO的产生,导致氧化应激过程中AP位点的DNA碱基损伤。通过分子生物学手段检测BER通路中关键基因表达和阻断O2.−和NO后AP位点DNA碱基损伤的缺失,进一步验证了TCDD通过氧化应激水平诱导细胞AP位点的DNA碱基损伤。转录组测序显示,TCDD通过上调丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、环磷酸腺苷(cAMP)和乳腺癌通路中与氧化应激相关的基因来诱导DNA损伤。本研究有助于评价TCDD诱导的氧化应激和DNA损伤的基因毒性机制,对评价TCDD对生物体的潜在毒性具有重要意义。



作者简介

王超,广东工业大学在读博士研究生,主要从事有机污染物分析和毒理研究。以第一作者在J. Hazard. Mater.期刊上发表SCI论文2篇。

通讯邮箱:cwang8@163.com

邓洁薇,博士,硕士生导师,广东工业大学生物医药学院副教授。主要从事有机污染物分析和毒理研究,研究成果在Anal. Chem.、J. Hazard. Mater.、Environ. Sci. Technol.、Sci. Total Environ.、Trends Anal. Chem.等期刊上发表SCI论文50余篇,论文他引1000多次。主持国家自然科学基金面上、青年项目等纵向项目8项,参与国家自然科学基金重大科研仪器研制项目的核心研究工作,担任《J. Anal. Testing》、《分析试验室》、《分析测试学报》期刊青年编委、中国分析测试协会青年学术委员、广东省药学会生物医药分析专委会委员、广东省精准医学应用学会医工结合分会委员

通讯邮箱:jwdeng@126.com

栾天罡,教授,博士生导师,五邑大学党委书记。国家杰出青年基金获得者,中组部“万人计划”科技创新领军人才、珠江学者特聘教授。兼任中国质谱学会理事,广东省分析测试学会常务理事,广东省质谱学会副理事长,广州市科学技术学会常委等职。长期从事环境水体中有机污染物生态毒理学、湿地微生物对有机污染物降解机理、环境污染物新的样品预处理及分析方法等方面研究。在Nat. Commun.、Environ. Sci. Technol.、Anal. Chem.、Water Res.、J. Hazard. Mater.、等国际知名期刊上发表SCI论文200多篇,论文他引6000多次。


JHM家族期刊包括Journal of Hazardous Materials (JHM),Journal of Hazardous Materials Letters (JHM Letters), 和Journal of Hazardous Materials Advances (JHMA)。三本期刊拥有相同的scope,侧重在环境危险物质的迁移,影响,检测,和去除。旗舰期刊JHM发表高水平科研和综述文章,JHM Letters完全开放获取,发表Letter-type科研和前沿综述文章(3000字限制,4副图/表),JHMA定位为中档开放获取期刊。






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