阔然基因每日速递精粹(总第1180-1187期)

文摘   科学   2024-10-10 09:05   上海  


产品简介:
阔然生物泛实体肿瘤基因检测产品,包含泛实体瘤治疗和发生发展高度相关的基因,包括7大泛瘤种分子标志物等,充分提示靶向/免疫治疗、预后、遗传等,同时匹配HER2、Trop2、Claudin18.2等重要泛靶点的蛋白表达检测,全方位助力临床精准诊疗!

9种泛实体瘤疗法,7大泛瘤种生物标志物!
研究背景:
肿瘤不可知治疗(是泛瘤种疗法),同一药物对所有携带该靶点的肿瘤都很有效,这改变了基于肿瘤特异性的传统治疗,自2017年FDA批准了第一个免疫检查点抑制剂的泛瘤种疗法以来,FDA继续又批准了8种针对晚期癌症患者的泛瘤种疗法(2种免疫疗法+6种靶向疗法),这些包括dMMR(16%)、MSI-H(14%)、TMB-H(16.5%, ≥10 mut/Mb)、NTRK融合(0.3%-0.4%)、BRAF V600E(10%-15%)、RET融合(1%-2%)、HER2阳性(1%-28%,IHC 3+)等7个泛癌种的分子标志物。
研究结论:
肿瘤不可知疗法,通过绕过传统根据肿瘤起源或位置进行的肿瘤分类,推动和扩大了特定治疗的潜在患者群体,这使得更多的患者可能受益于相同的靶向治疗。随着越来越多泛瘤种疗法的批准,超越组织学和位置界限,提供个性化的、生物标志物驱动的精准治疗,有望为肿瘤患者提供更有效、更少毒性的干预措施,获得更长的生存期和更高的生存质量。


产品简介:
阔然生物围绕脑肿瘤患者术后靶向/免疫治疗及遗传筛查临床需求,提供相应的基因检测,实现指南推荐的常见靶向基因全覆盖;指导患者的靶向、免疫及化疗精准治疗,旨在全方位助力临床精准诊疗!


颅咽管瘤新型CTNNB1突变的全基因组测序研究
研究背景:颅咽管瘤(CP)是一种罕见的组织学良性但临床上具有挑战性的肿瘤,因为它与中央脑的关键结构密切相关。CP可分为两个主要的组织学亚型:金刚瘤型CP (ACP)和乳头状型CP (PCP)。虽然在以前的研究中已经发现了这两种类型的一些遗传畸变,但这种肿瘤的完整遗传变化谱仍然未知。
研究结论:
研究组对16例ACPs和10例pcp的26例CPs进行全基因组测序,并对其血液样本进行匹配。鉴定了每个患者的体细胞变异(snv、InDels、SVs和cnv),并对突变特征进行了表征。结果显示与恶性肿瘤相比,CPs的复杂性较低,体细胞突变较少。此外,CTNNB1(占ACP的68.75%)和BRAF V600E(占PCP的70.00%)突变在ACP和PCP中是相互排斥的,巩固了这两个基因分别在ACP和PCP中的驱动作用。在ACP中发现了CTNNB1外显子3的一个新突变,该突变损害了翻转和帧内缺失。实验证实,该突变通过抑制β-连环蛋白的泛素化,从而激活wnt信号通路,促进细胞增殖,从而增加了β-连环蛋白的稳定性。



产品简介:
阔然生物推出的一站式NGP肿瘤微环境检测方案可对肺癌肿瘤微环境进行全面解析,检测方案可纳入CD3、CD8、CD56、IFNγ、MHC-I、PanCK、DAPI等指标更好地提示NSCLC患者的预后。


J Immunother Cancer:NSCLC中NK细胞和CD8+T细胞空间共定位可提高生存获益
研究背景:
肿瘤细胞主要组织相容性复合体I类(MHC-I)丢失以逃避细胞毒性T细胞的识别在非小细胞肺癌(NSCLC)中很常见,发生在>30%的人肺癌细胞中。
研究结论:
该研究同时使用传统IHC和mIHC原位检测NK细胞和CD8 T细胞,发现患者肿瘤CD56+细胞数量高与无病生存和总生存(OS)呈正相关,随着CD56+和CD8+细胞的高计数,OS相关性增强。使用mIHC的空间分析发现NK细胞和CD8+T细胞在IFNγ染色区域共定位。该研究表明在MHC-1高表达的NSCLC中NK细胞和CD8+T细胞共同浸润肿瘤巢,对患者的生存产生积极影响,可基于此研究开发利用NK细胞和CD8+T细胞增强NSCLC免疫控制的新型免疫疗法。


产品简介:
阔然生物胶质瘤产品,包含指南共识推荐检测的IDH突变等胶质瘤相关基因,连续多年满分通过NCCL、CAP等权威机构组织的室间质评,提供分子分型、预后评估、靶向和免疫治疗及遗传筛查等检测信息,全方位助力临床精准诊疗!

HOXD12 定义与年龄相关的侵袭性少突胶质细胞瘤亚型
研究背景:
与其他成人弥漫性胶质瘤相比,诊断为IDH突变和1p/19q共缺失、少突胶质细胞瘤的患者通常预后良好,但个别老年患者预后不良,仍需相关研究探究侵袭性少突胶质细胞瘤的新的年龄相关的改变。
研究结论:
研究者通过TCGA和CGGA数据库分析发现,HOXD12 表达升高与少突胶质细胞瘤患者年龄较大和生存期较短有关。在TCGA中,HOXD12 基因高甲基化也与WHO 分级较高有关。HOXD12基因高甲基化和表达升高是 NOTCH1和PIK3CA突变、15q缺失、MYC 激活外独立的预后因素。RNA-seq测序数据显示,HOXD12 活性在肿瘤组织中升高,特别是在循环和 OPC 样细胞中,并与干细胞样表型相关。该研究表明,HOXD12 基因高表达和高甲基化与少突胶质细胞瘤患者年龄较大、非典型侵袭性亚型有关。


产品简介:
阔然生物推出的一站式NGP检测方案可对胃肠道间质瘤(GIST)的肿瘤微环境进行全面解析,检测方案可纳入CD3、CD20、CD68、CD56、CD31、MECA79等指标深入LIGHT-VTP治疗对肿瘤微环境的重塑。

LIGHT-VTP疗法诱导GIST中三级淋巴结构的形成
研究背景:
胃肠道间质瘤(GIST)含有多种免疫细胞群,但免疫治疗效果不佳,因此需要寻找新的治疗方案。
研究结论:
该研究建立了脐带血人源化小鼠模型以研究局部和转移性GIST的肿瘤微环境重塑,以期改善免疫疗法的效果。研究发现评估了一种癌症血管靶向肽(VTP)对小鼠和患者GIST血管生成性血管的结合能力,以及将肿瘤坏死因子超家族成员LIGHT(TNFS14)递送到肿瘤的能力。LIGHT-VTP治疗GIST的人源化小鼠改善了血管功能和肿瘤氧合,并与效应T细胞的增加相关。伴随LIGHT介导的血管重塑,肿瘤内高内皮小静脉(HEVs)和三级淋巴结构(TLS)的出现,这些结构与GIST患者中发现的自发性TLS相似。该研究证实了在GIST中进行血管靶向和免疫激活的治疗可行性,在GIST中进行血管LIGHT靶向是一种高度可转化的方法,有望改善免疫治疗结果。


产品简介:
阔然生物推出的一站式NGP检测方案可三阴性乳腺癌(TNBC)的肿瘤微环境进行全面解析,检测方案可纳入CD20、CD3、CD68、CXCL13、Ki67、MHC等指标深入研究抗 PD-1治疗和三阴性乳腺癌放疗后肿瘤免疫微环境中发生的表型和空间变化的关系。

空间蛋白分析助力TNBC免疫联合放疗响应轨迹分析
研究背景:
早期三阴性乳腺癌(TNBC)通过帕博利珠(pembrolizumab)与放化疗相结合以提高生存率,但单一的PD-L1状态并不能准确预测疗效,需要深入了解肿瘤微环境以找到更好的预测标记物。
研究结论:
该研究通过多组学技术检查在基线、一个周期 pembrolizuma治疗和第二个周期 pembrolizumab 治疗及放疗的TNBC肿瘤微环境差异。无应答者在治疗前后缺乏免疫浸润,未表现出治疗引起的明显免疫变化。有反应的肿瘤分成两组,R1组显示主要组织相容性复合体高表达、三级淋巴结构的形成、在治疗前显示抗肿瘤免疫活性;R2组类似于基线时的无应答者,只有在联合治疗之后,才能获得最大的免疫应答、拥有属性细胞毒性T细胞和呈递髓样细胞相互作用的抗原。该研究揭示了不同应答者群体在免疫治疗过程中的独特免疫轨迹,为个性化治疗策略提供了重要线索。


产品简介:
阔然生物MRD微小残留病灶检测产品,结合两种经典检测策略的优势,超高深度测序,可通过术后、治疗中血浆ctDNA检测,预测早期复发和指导治疗及随访决策,全方位助力临床精准诊疗!

2024 CSCO:实体瘤MRD专家共识解读
研究背景:
本次CSCO大会上报告的《实体瘤MRD专家共识》内容,相较于今年3月底在第十三届病理年会上的呈现有了进一步的更新和进展。共形成13条专家共识及新增了对应的共识推荐级别,最高推荐级别是2A类,无1级别推荐。
研究结论:
主要推家类容如下:①MRD概念定义形成了普遍共识(2A类);②优先推荐临床价值较明确的结直肠癌/非小细胞肺癌乳腺癌患者检测(2A类),其次是胰腺癌/肝癌/食管癌/胃癌等(2B类);③适用接受了根治性手术切除/放化疗患者(2A类)及晚期经系统性治疗完全缓解患者(2B类);④常用的检测方法是NGS-ctDNA突变检测(2A类);质控需重点关注MRD追踪突变的测序深度(2A类)。此外,其它重要2B类推荐意见,如测序深度推荐3w-10w×(个性化定制时),个性化定制策略具有更好的灵敏度和特异性,推荐优先考虑。


产品简介:
阔然生物围绕胃肠肿瘤患者术后靶向/免疫治疗及遗传筛查临床需求,提供相应的基因检测,实现指南推荐的常见靶向基因全覆盖;指导患者的靶向、免疫及化疗精准治疗,旨在全方位助力临床精准诊疗!


3 期 BEACON CRC 试验中 BRAF-V600E 突变转移性结直肠癌的分子分析
研究背景:BEACON CRC研究表明,与Cetux+化疗相比,encorafenib(Enco)+西妥昔单抗(Cetux)±binimetinib(Bini) 显著提高了既往接受过治疗的BRAF-V600E突变型转移性结直肠癌患者的总生存期(OS),这为在美国和欧盟批准Enco+Cetux方案提供了基础。
研究结论:为了更好地了解预测对 Enco+Cetux±Bini 治疗反应的生物标志物具有临床意义。在这项预先指定的探索性生物标志物分析中,研究组通过综合临床和分子分析,表征临床结果和获得性耐药机制的基因组和转录组相关性。结果显示具有较高免疫特征的肿瘤显示出 Enco + Bini + Cetux 增加 OS 获益的趋势。RAS 、 MAP2K1 和 MET 改变最常见于 Enco+Cetux±Bini 获得,在具有高基线细胞周期基因特征的患者中更常见;基线 TP53 突变与获得性 MET 扩增相关。获得性突变为亚克隆和多克隆突变,有证据表明 Enco+Cetux±Bini 和突变特征 (SBS17a/b) 的肿瘤突变率增加。这些发现支持 Enco+Cetux±Bini 治疗 BRAF-V600E 突变型 mCRC 患者,并为 MAPK 通路靶向治疗的反应和耐药生物学提供了见解。
Nat Med. 2024 Sep 23. 


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阔然生物
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