脱Boc:三氟乙酸/DCM条件的杂质谱

文摘   科学   2024-08-29 07:02   天津  
三氟乙酸/DCM是去除Boc的绝对搭配,工艺上用的不是很多。
  • 基于药明康德的经验,得出如下经验
  • 往往三氟乙酸的mol用量不小
  • 随着反应的进行,体系颜色也会变深
  • 后处理可以浓缩去除三氟乙酸和DCM
  • 三氟乙酸相比其他酸,去除Boc后不容易固化,需要反复带蒸去除三氟乙酸残留。即使不成盐的三氟乙酸没有残留,单纯三氟乙酸盐也不容易固化。
  • 价格有点小贵,相比常用的盐酸

主要杂质谱
  • 三氟乙酸衍生出三氟乙酰胺杂质很常见,三氟乙酰基碱性环境很容易掉。
衍生
  • 记得药明康德工作期间,氯化氢乙酸乙酯去除Boc,产生了乙酰胺类杂质,当时还觉得,酸性环境怎么会发生胺酯交换杂质呢
  • 还原胺化,采用催化量醋酸或者醋酸硼氢化钠,也会产生乙酰胺类杂质,往往后者是主要贡献源。
  • 甲酸类氢转移条件制备胺类(去除N-保护基,还原某基团获得胺),往往会产生甲酰胺类杂质。


说完三氟乙酸,简单说说二氯甲烷产生的杂质
  • 二氯甲烷和胺反应产生杂质很常见,可以得到卤代物杂质,也可能产生以亚甲基为中心的二聚杂质。
  • 二氯甲烷参与还原胺化反应,还可能产生甲基杂质,来源路径是胺和二氯甲烷先进行烷基化,再进行脱卤素,得到甲基。

分享案例
  • 化合物12最初采用三氟乙酸,在二氯甲烷中去除Boc保护基,制备化合物13
  • 主要杂质是化合物26和化合物27
  • 工艺研究后,采用了氯化氢异丙醇去除Boc保护基。

参考文献
https://doi.org/10.1021/acs.oprd.3c00423(三氟乙酸去除Boc案例)
https://doi.org/10.1021/acs.oprd.3c00445(还原胺化产生甲基杂质案例)

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