14.7/Q1,14+高分!银屑病与癌症关联争议不断?重庆医科大学第一附属医院给出答案

文摘   2024-11-05 18:00   海南  

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文章标题:An observational and genetic investigation into the association between psoriasis and risk of malignancy

中文标题:银屑病与恶性肿瘤风险之间关联的观察和遗传学调查

发表期刊:Nat Commun

发表时间:2024年9月

影响因子:14.7/Q1

研究背景
银屑病与部位特异性癌症之间的关系尚不清楚。在这里,我们旨在研究银屑病是否与部位特异性癌症有因果关系。
研究方法
我们使用来自英国生物样本库的观察和遗传数据,从公共数据集获得 GWAS 摘要数据、eQTL 分析数据、TCGA 数据和 GTEx 数据。我们进行 PheWAS、多基因风险评分分析以及单样本和双样本孟德尔随机化分析,以研究银屑病与癌症之间的潜在因果关系。

结果分析

1. 基线特征

共包括 13,463 名银屑病患者和 463,136 名非银屑病参与者。

2. 观察性 PheWAS

观察性表型组范围关联研究显示,银屑病在总体人群中与乳腺癌、非黑色素瘤皮肤癌、独立原发性多部位恶性肿瘤、继发性和未指明的淋巴结恶性肿瘤及间皮瘤相关。男性中,银屑病与非黑色素瘤皮肤癌关联同总体人群一致,还与肺癌、癌、肝癌、膀胱癌和口腔癌风险升高显著相关。女性中,患乳腺癌风险显著升高,且与其他和定义不清的消化器官恶性肿瘤、继发性和未指明的淋巴结恶性肿瘤、肛管癌风险更高有关。总人群及各性别中未观察到银屑病与其他未提及的部位特异性癌症风险有关。排除多次诊断为癌症的患者后,银屑病仍与肺癌和乳腺癌风险较高显著相关。

3. 单样本 MR

在单样本 MR 分析中,遗传预测的银屑病与多种癌症相关。总体上,与肛管癌、肺癌、乳腺癌、肾癌、SOS 和滤泡性非霍奇金淋巴瘤有关。男性中,与肺癌、肾癌和 SRD 风险较高相关。女性中,与肛管癌、NMSC、乳腺癌、SOS 和滤泡性非霍奇金淋巴瘤有关。未观察到银屑病与口腔癌、肝癌、OIDO、间皮瘤、癌、膀胱癌、SLN 或 PMS 之间存在因果关系。

4. 双样品 MR 分析

进行了双样本 MR 分析,结果显示银屑病与乳腺癌和肺癌有因果关系。多效性稳健方法结果与 IVW 方法相似,MR-PRESSO 方法未鉴定出异常值,未观察到银屑病与部位特异性癌症之间关联的异质性证据,通过 MR-Egger 截距和 MR-PRESSO 未发现方向多效性的证据,且双样本 MR 分析中作为仪器变量的大多数银屑病易感基因位点与乳腺癌或肺癌结局没有显著相关性。

5. 银屑病与癌症之间分子关联的基因注释

研究对 74 个 SNP 进行基因注释后,对 50 个相关基因进行富集分析。GO 富集分析显示银屑病相关基因在“对 II 型干扰素的反应”等方面富集;KEGG 通路分析表明“IL - 17 信号通路”等与银屑病有关。cis - eQTL 分析揭示银屑病易感基因座与正常肺和乳腺组织中多个基因有关联。通过评估这些基因在 TCGA 和 GTEx 中的表达,发现肺癌和乳腺癌组织中部分基因表达水平与正常组织相比有显著变化。

文章小结

研究结果显示,银屑病与肺癌和乳腺癌有因果关系(如果你正寻求思路复现、实验设计或定制化的数据分析服务,那么请不要错过我们哟~)

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