似曾相识!上海九院这篇鉴定头颈肿瘤中新类群的研究,共培养实验做得真棒!

学术   健康   2024-12-27 23:00   上海  

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头颈肿瘤通常是指头颈部鳞状细胞癌,起源于头颈部粘膜表面的鳞状细胞,如口腔、喉咙和声带内鳞状细胞。此外,头颈肿瘤也发生在唾液腺、鼻窦、头颈部的肌肉或神经,但是这些类型的肿瘤较少见。脑肿瘤、眼肿瘤、食管癌、甲状腺肿瘤和头颈皮肤癌通常不归类为头颈肿瘤。

细胞毒性CD8+ T 细胞是抗肿瘤免疫反应的关键。在头颈鳞状细胞癌中,肿瘤免疫治疗响应率较低,与肿瘤微环境中 CD8+ T 细胞浸润减少密切相关,但其中机制尚不清楚。2024年1月,Cancer Research杂志发表题为Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal a Cancer-Associated Fibroblast Subset in HNSCC That Restricts Infiltration and Antitumor Activity of CD8+ T Cells的论文。该研究对10例HNSCC样本进行空间组和单细胞联合分析,鉴定到与CD8T 细胞浸润限制相关的 Gal9+CAF 亚群(鉴定到新的细胞类群)。

湿实验验证层面,mIHC结果显示 Gal9+ CAFs在肿瘤周围高浸润;这群细胞可诱导CD8+ T 细胞发生功能障碍,并限制TCF1CD8T 细胞浸润的数量,从而揭示MHC-I Galectin-9+ CAFs在肿瘤免疫逃逸中的作用。

首先,通过数据挖掘,找到互作的细胞类群。除了简单的多重免疫组化验证,最精彩的湿实验验证恰恰是表型实验中的CAF细胞与CD8 T 细胞共培养。

CAF表达的MHC-I类分子越高,CD8+ T 细胞的杀伤越弱(表型)。

LGALS9+ CAF与 CD8+ T 细胞概念异常负相关(机制)。这里巧妙地使用LGALS9基因敲除肿瘤细胞和抗体处理 CD8+ T 细胞,而且动物模型和临床样本两种体系来验证。

对于生信论文,趋势是临床样本测序+生信验证+实验验证,因为高分论文都是这么做的。二代测序已经非常普及!TCGA数据库中存放了各种肿瘤临床标本的二代测序数据,样本信息全面,是肿瘤研究极为重要的资源!而单细胞和空转多组学也正逐步走进千家万户,其中多重免疫荧光则逐步成为更好的实验验证方法,值得关注!

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芒果师兄
1.生信技能和基因编辑。2.论文发表和基金写作。3. 健康管理和医学科研资讯。4.幸福之路,读书,音乐和娱乐。
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