2024-05-28
2024-11-20
2024-07-04
细胞毒性CD8+ T 细胞是抗肿瘤免疫反应的关键。在头颈鳞状细胞癌中,肿瘤免疫治疗响应率较低,与肿瘤微环境中 CD8+ T 细胞浸润减少密切相关,但其中机制尚不清楚。2024年1月,Cancer Research杂志发表题为Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal a Cancer-Associated Fibroblast Subset in HNSCC That Restricts Infiltration and Antitumor Activity of CD8+ T Cells的论文。该研究对10例HNSCC样本进行空间组和单细胞联合分析,鉴定到与CD8+ T 细胞浸润限制相关的 Gal9+CAF 亚群(鉴定到新的细胞类群)。
湿实验验证层面,mIHC结果显示 Gal9+ CAFs在肿瘤周围高浸润;这群细胞可诱导CD8+ T 细胞发生功能障碍,并限制TCF1+ CD8+ T 细胞浸润的数量,从而揭示MHC-I Galectin-9+ CAFs在肿瘤免疫逃逸中的作用。
首先,通过数据挖掘,找到互作的细胞类群。除了简单的多重免疫组化验证,最精彩的湿实验验证恰恰是表型实验中的CAF细胞与CD8 T 细胞共培养。
CAF表达的MHC-I类分子越高,CD8+ T 细胞的杀伤越弱(表型)。
对于生信论文,趋势是临床样本测序+生信验证+实验验证,因为高分论文都是这么做的。二代测序已经非常普及!TCGA数据库中存放了各种肿瘤临床标本的二代测序数据,样本信息全面,是肿瘤研究极为重要的资源!而单细胞和空转多组学也正逐步走进千家万户,其中多重免疫荧光则逐步成为更好的实验验证方法,值得关注!