WXRedian | 芒果师兄聊生信

热点！氨基酸代谢驱动胰腺癌治疗抵抗的机制！

学术 2024-10-21 00:06 上海

本期给大家分享密歇根大学Costas A. Lyssiotis团队和加州大学尔湾分校Christopher J. Halbrook团队于2022年发表在Nature Can ...

乳腺癌患者中三级淋巴结构重要分子：LGALS2

学术 2024-10-20 00:06 四川

三级淋巴结构（TLS）是一种复杂的结构，主要由 B 细胞、T 细胞和树突状细胞 (DC) 组成，它们在癌症部位的 TME 中渗透并聚集。TME 内TLS等多细胞结构的形成显 ...

癌症-免疫周期是啥？

学术 2024-10-19 00:07 四川

Ira Mellman等学者分享了一篇《癌症-免疫周期：适应症、基因型和免疫型》，这篇文章极具研究意义，深入探讨了T细胞功能及其调控机制，提出了肿瘤免疫表型（Immunot ...

番外篇！肿瘤相关成纤维细胞与肿瘤异质性

学术 2024-10-18 00:08 上海

肿瘤研究领域的经典教材是《癌生物学》。外周免疫是肿瘤免疫的基础，肿瘤免疫是外周免疫的升华。为了方便大家学习，我们多年前制作了《肿瘤免疫12讲》。但是，随着前沿研究的不断推进 ...

产品升级！德运康瑞DynaSpatial HD捕获面积提升到6mm x 6mm，速来围观实测数据表现！

学术 2024-10-18 00:08 上海

自德运康瑞发布DynaSpatial HD空间转录组产品以来，这项技术凭借达到单细胞的空间分辨率、卓越的基因检测性能以及全面的产品方案，在小鼠卵巢、脑等器官组织和人多种肿瘤 ...

卵巢癌治疗新靶点：B7-H3如何成为免疫治疗的突破口？

学术 2024-10-17 00:06 四川

卵巢癌是女性癌症死亡的第八大原因，全球每年估计有超过200,000人死亡。尽管手术和化疗是常规治疗方法，但大多数情况下疾病仍不可避免地进展。PD-1/PD-L1抑制疗法在卵 ...

一页搞定，掌握Linux的常用命令！

学术 2024-10-16 08:00 上海

废话就不说了，直接看图吧！这些是Linux操作的常用命令，动手敲代码就是了！谈谈个人对生信报班的看法。生信报班，前提一定是自己先做过一段时间的基础练习了，而不是真的零基础， ...

大制作，欢迎珍藏！王福俤/闵军霞和吴钰祥合作绘制铁死亡全景图！

学术 2024-10-16 00:08 上海

近年来，陆续有多种细胞死亡的方式被发现，其中铁死亡（Ferroptosis）受到极大关注。查询PubMed发现，铁死亡相关论文共14587篇；2024年至今已经发表了铁死亡 ...

另辟蹊径！单细胞分析不验证发论文的办法

学术 2024-10-15 00:06 上海

我们曾经总结过生信论文的新形势，提出单细胞+新表型或新算法可以发表纯生信。如果能从并发症角度设计分组，那将是很大的亮点。此外，基于公共数据的二次挖掘，用别人的数据，发自己的 ...

中科院生物药国重室高薪诚聘核酸化学、核酸生物、AI生信方向博后！

学术 2024-10-15 00:06 上海

导师简介：袁野，中国科学院过程工程研究所生物药制备与递送重点实验室副主任。获得上海市浦江人才计划、东方英才、青年五四奖章。主持多项省部级以上科研项目，包括国家自然科学基金、 ...

再回首，数年前真是生信利好的时代！

学术 2024-10-14 20:00 上海

40个科研网站，总有你需要的！2024-08-09 现在发生信论文基本都是要做实验验证的！相比而言，前几年真是生信论文利好的时代！随便在线数据库做做分析，就能发论文！Sir ...

一篇顶百篇！万事开头难，从基因出发展开肿瘤免疫研究，这篇顶刊是典范！

学术 2024-10-14 00:07 上海

文献精读第六篇！本次分享探究从特定基因出发，做肿瘤免疫研究的策略。在抗肿瘤免疫的条件下，肿瘤细胞衍化出多种逃逸机制以获得生存，表达抑制性膜蛋白分子PD-L1，分泌可溶性成分 ...

快来学！解析癌症进化的高级工具-肿瘤系统发育学

学术 2024-10-13 00:06 四川

肿瘤系统发育学（tumor phylogenetics）是研究肿瘤进化的一种方法，它通过构建肿瘤细胞的系统发育树来揭示肿瘤的进化历史。这种方法可以帮助我们理解肿瘤如何在时间 ...

重磅！ IL-34还能和p53失活有关系？

学术 2024-10-12 00:06 四川

免疫领域又出一文，Nian等人撰写的《由p53失活驱动的肿瘤免疫逃逸需要白介素-34调控的肿瘤相关巨噬细胞重编程》。该研究发现p53失活导致癌症干细胞（CSCs）分泌IL ...

肿瘤异质性！内皮细胞的免疫调节！

学术 2024-10-11 00:06 上海

无与伦比！从单细胞层面鉴定内皮细胞！2023-10-06 越来越多证据表明，肿瘤内皮细胞（TEC）在肿瘤微环境（TME）中对促进肿瘤生长和逃避免疫反应的重要性。免疫 ...

轻松搞定！两行代码获取MD5码！

学术 2024-10-10 20:00 上海

上传测序原始数据，我们在准备元文件的时候，必须提供数据的MD5码！怎么获取呢？首先，把需要获取MD5码的文件放置到命名好的文件夹中，获取文件路径。使用 cd 切换到目标路径 ...

实操！测序数据存到GSA，而非NCBI！

学术 2024-10-10 00:06 上海

发表文章时，我们需要将测序原始数据上传到公共数据库。以前，我们只能上传到国外的NCBI或EBI等，现在需要上传到我们自己的国家基因组科学数据中心（NGDC）。该网站涵盖多个 ...

肿瘤遗传学！常规测序下的肿瘤异质性！

学术 2024-10-09 08:00 上海

在谈到肿瘤病因时，我们简单粗暴地分为遗传因素和环境因素。如果对病因所针对的人群分类，在成人肿瘤中，环境因素可能比遗传因素重要，如辐射、制剂和病原微生物感染等，因为环境因素的 ...

复现/实战 | 基于python和R的单细胞数据整合

学术 2024-10-09 00:06 四川

基于对图谱类⽂章的整理，我们发现⼤量单细胞数据的整合主要是基于 Python 的 BBKNN ⽅法以及基于 R的 harmony ⽅法和 RPCA ⽅法，下⾯本⽂依次对三种 ...

肿瘤相关巨噬细胞（TAM）和成纤维细胞（CAF）重要互作和靶点分析

学术 2024-10-08 00:06 四川

肿瘤相关巨噬细胞 (TAM)构成了各种实体癌中重要的免疫细胞群，在疾病进展中发挥着关键作用。数量和频率的增加往往与治疗耐药性密切相关，并降低了总生存率。癌症相关成纤维细胞（ ...