空间组学，定位真的很重要！
学术
健康
2024-12-27 23:00
上海
蛋白在细胞中的定位对于其功能有着至关重要的作用。通俗点说，场合很重要！某种蛋白或表达产物在亚细胞水平上的空间位置，称为蛋白亚细胞定位（Protein Subcellular Localization，PSL）。什么是亚细胞呢？从亚显微结构上，细胞可以分成多个细胞器或者细胞区域，如细胞膜、细胞质、细胞核、线粒体、高尔基体和内质网等，这些细胞器统称为“亚细胞”。对于蛋白功能研究而言，亚细胞定位是非常重要的分析内容。![]()
蛋白在细胞中是流动的，所以一个蛋白可以具有一个到多个的亚细胞定位信息。比如转录因子等蛋白，其亚细胞定位是动态变化的，在不同亚细胞中产生不同的功能。了解蛋白的亚细胞定位信息，可以大致了解其生物学功能。![]()
至于实验操作，通过免疫组化（IHC，如THPA提供的数据），或通过普通荧光显微镜拍照（通过转染基因/荧光基因观察定位，比较粗略），更精确点则是免疫荧光染色（通过抗体染色来观察）以及多重免疫荧光技术来探究蛋白的亚细胞定位。![]()
上述手段都属于蛋白定位分析，只要有钱，基本上都能做到，还可以为研究蛋白功能以及蛋白互作等做好铺垫。但是，单纯地亚定位分析也存在创新性不足的问题。
![]()
因此，我们要牢记，蛋白定位分析是为探究蛋白功能服务的。在生信分析和数据挖掘中，我们为什么要关心蛋白定位呢？因为在做互作分析和富集分析的时候，我们通常会将兴趣基因的功能归结到某条信号通路或者表型上来，而这些功能或表型又是通过定位在细胞中特定空间位置的蛋白来完成的。这种分析也为干湿结合提供了可能，值得关注。
