10.5/Q1,机器学习+AUROC=首次经历精神病发作死亡风险模型

文摘   2024-10-09 21:57   美国  

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文章标题:Development and Validation of a Machine Learning–Based Model of Mortality Risk in First-Episode Psychosis

中文标题:基于机器学习的首发精神病死亡风险模型的开发和验证

发表期刊JAMA Netw Open

发表时间2024年3月

影响因子10.5/Q1

研究背景

首次经历精神病发作(FEP)的个体的死亡风险比一般人群高几倍。此外,流行病学研究强调,自杀行为、受伤和中毒导致的死亡率不成比例地高。与一般人群相比,精神分裂症患者在疾病持续时间内更有可能死于躯体死亡(例如,由于心血管事件或恶性肿瘤)。预后工具可以帮助开发个性化治疗,缩小FEP与普通人群之间的死亡率差距。在这里,研究使用大型、未经选择的全国性登记数据库开发了一个 FEP 死亡风险的ML模型

研究队列

瑞典队列:由首次发作非情感性精神病诊断(国际疾病统计分类,第十版[ICD-10],代码F20-F29)的个体组成,年龄在 15 至 45 岁之间,并于 2006 年7月1日至2021年12月31日期间在瑞典注册治疗接触。瑞典队列是从国家患者登记册(住院和专业门诊护理)和 MiDAS 登记册(残疾抚恤金和病假)中确定的。

芬兰队列:包括 1998 年至 2014 年在芬兰接受首发精神分裂症住院治疗的16至45岁个体(ICD-10 代码 F20 和 F25 的可用数据),并在 1998 年1月1日至2017年12月31日期间进行随访。芬兰队列是从芬兰健康与福利研究所维护的出院登记册中确定的。两个样本在诊断前都有1年的抗精神病药物清除期(即无抗精神病药物治疗),以确保真正的FEP病例的组成。

统计分析

ML分析:研究训练了一个ML模型来预测FEP诊断后的死亡风险。这里根据瑞典队列中 FEP 诊断前1或2年内可用的所有登记来源使用了大量临床、社会人口学和社会经济变量来预测FEP诊断后的2年死亡率(与生存率相比)。研究选择 XGBoost 而不是其他 ML 算法,因为它在分析表格数据方面表现出色。

药物流行病学分析:在发现样本中,研究调查了不同药物治疗(以抗精神病药为主要暴露)的关联是否在预测在FEP诊断后死亡的患者与预测在FEP后存活长达15年随访的患者之间有所不同。对所有可用的随访(≤15 年)进行了个体间Cox回归分析。

结果分析

1. 基线特征

研究收集了来自瑞典队列的24052名FEP患者(发现样本中20000名,验证样本中 4052 名)和1490名来自芬兰队列的FEP患者(在验证样本中)的数据。


2. 受试者工作特征 (ROC) 预测首发精神病 (FEP) 2 年死亡率

瑞典模型发现样本(n = 20 000)中2年内死亡率的训练外分类导致受试者工作特征曲线下面积(AUROC)为0.71(95% CI,0.68-0.74;P < .001),敏感性为 59.7%,特异性为 71.3%(图1A)。研究仅使用最重要的变量(物质使用合并症、因FEP首次住院、男性、既往躯体住院和年龄)在发现样本中重新训练了ML模型,并在瑞典验证样本中测试了其 2 年死亡率预测性能(图1B)。

3. 最终模型 Shapley 加法解释 (SHAP)

死亡预测与大量既往 SUD 合并症、因 FEP 首次住院时间长、男性、既往躯体住院率高以及两个样本中的年龄较大相关(图 2)。该模型在瑞典验证样本(Brier 评分,0.02;斜率,0.97)和芬兰验证样本中显示出良好的校准。该模型的在线版本,早期首发精神病的死亡率风险评估计算器(MIRACLE-FEP) 可用。

4. 生存分析

该模型在瑞典验证样本中15年和芬兰验证样本中20年以上的死亡率预测性能与上述2年死亡率预测一致。图3显示了瑞典和芬兰验证样本中总可用随访的模型预测的Kaplan-Meier曲线。在瑞典验证样本中,预测死亡患者的15年生存率为80.3%(95% CI,75.5%-85.3%),而预测存活的患者为93.9%(95% CI,92.4%-95.3%)(HR,3.77 [95% CI,2.92-4.88];P < .001)。在芬兰验证样本中,预测死亡患者的 20 年生存率为 73.7%(95% CI,68.2%-79.7%),而预测存活的患者为 92.2%(95% CI,89.7%-94.8%)(HR,3.72 [95% CI,2.67-5.18];P < .001)。

5. 药物流行病学结果

研究使用ML预测按患者的预测结果对患者进行分层。在检查与不同药物治疗相关的15年死亡风险时,这里发现最有效治疗的排名顺序因组而异(图 4)。

文章小结

这项研究开发并验证了一种机器学习(ML)模型来预测首发精神病(FEP)中的死亡风险。这项研究结果表明,如果进一步验证,该模型可以帮助开发个性化干预措施以降低死亡风险。今天为大家分享的文章纯公共数据挖掘+统计分析,就发到了一区!如果你也想在临床方向发高分文章,不妨试试这个省钱省事又省力的思路吧!

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