文章标题:Exploring causal correlations between inflammatory cytokines and ankylosing spondylitis: a bidirectional mendelian-randomization study
中文标题:探索炎性细胞因子与强直性脊柱炎之间的因果关系:一项双向孟德尔随机化研究
发表期刊:Front Immunol .
发表时间:2023年11月
影响因子:5.7/Q1
强直性脊柱炎 (AS) 是一种慢性进行性炎症性关节病,主要影响脊柱和骨盆。其特征是脊髓和盆腔关节的炎症、僵硬、疼痛和功能障碍。目前,AS 的确切机制仍然有些难以捉摸,但研究揭示了 AS 和炎症因子之间错综复杂的相互作用。
研究方法
双向孟德尔随机化研究利用了来自 186 例 AS 病例和 456,162 例欧洲血统对照的全基因组关联研究 (GWAS) 的遗传数据。炎性细胞因子是从 8,293 名健康参与者的 GWAS 摘要中获得的。因果关系主要使用逆方差加权法进行研究,并辅以 MR Egger、加权中位数和加权模式分析。使用 Cochrane Q 检验评估结果的异质性。通过 MR-Egger 截距检验和 MR 多效性残差和异常值 (MR-PRESSO) 检验评估水平多向性。通过留一法分析进行敏感性分析。
结果分析
1. 41 种炎性细胞因子对 AS 的影响
在可接近的炎症因子中,当全基因组显著性临界值设置为 5 时,41 个中有 9 个表现出 3 个或更多有效的 SNP× 10-8。对于炎症因子,P<5×10 的阈值较高-6用于确保为后续 MR 分析提供足够数量的 SNP。
2. 正向分析中“留一法”分析结果中 3 种炎症因子
此外,“留一法”分析证明了我们的 MR 分析的稳健性,因为它不受任何单个 SNP 的影响。
3. AS 对 41 种炎性细胞因子的影响
最初,当全基因组显著性临界值设置为 5 × 10 时-8,可用于 MR 分析的 SNP 不足。因此,我们将阈值调整为 5 × 10-6以确保有足够数量的 SNP 用于分析。此外,所有 F 统计量值都超过 10,表明工具偏倚较弱的可能性最小。
4. AS 与 12 种炎症因子 IL-12p70
Cochran Q 检验未检测到任何异质性证据,也没有观察到显著的截距,表明不存在多效性。此外,MR-PRESSO 的结果表明,该 MR 分析中没有水平多效性。
文章小结
这些发现表明 βNGF 、 IL-1β 和 TRAIL 可能在 AS 的发病机制中起关键作用。此外,AS 可能影响细胞因子的表达,如 IL-12p70、IL-17、IL-6、IL-4、SDF-1α、MIP1β、MCP-3、PDGFbb、GCSF、bFGF、TRAIL 和 IFN-γ。需要进一步调查以确定这些生物标志物是否可用于预防或治疗 AS。如果您对生信分析和公共数据库挖掘感兴趣,但时间和精力有限或者缺乏相关经验,小骨非常乐意为您提供如下服务:免费思路评估、付费方案设计和生信分析等,有意向的老师欢迎联系小骨哦!