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今天为大家分享一篇1图2表，利用孟德尔确定了蛋白质组和转录组的关联的选题巧妙的文章~如果你对孟德尔随机化研究中的研究思路、研究方法有疑问，或者想复现相关研究，老师可以随时联系我们。小科会让你知道纯生信分析也能发高分文章！![]()
文章标题：Brain Proteome-Wide and Transcriptome-Wide Asso-ciation Studies, Bayesian Colocalization, and Mendelian Randomization Analyses Reveal Causal Genes of Parkinson's Disease
中文标题：全脑蛋白质组和全转录组关联研究、贝叶斯共定位和孟德尔随机化分析揭示了帕金森病的致病基因
发表期刊：J Gerontol A Biol Sci Med Sci
发表时间：2023年3月
影响因子：4.3/Q1
全基因组相关位点如何赋予帕金森病风险尚不清楚。我们的目标是通过对脑蛋白的影响来揭示致病基因，为帕金森病提供新的发病机制见解。数据来源
利用来自全基因组关联汇总（56 306 名欧洲人，140 万对照）、脑蛋白质组（来自 2 个独立数据集的 528 例）和转录组（452 例）的数据，通过基于功能摘要的插补确定蛋白质组范围和转录组范围的关联，然后进行孟德尔随机化、贝叶斯共定位、细胞类型特异性和大脑区域表达以及药物-基因相互作用分析。![]()
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1. PWAS 鉴定出 11 个与帕金森病相关的基因在ROS/MAP数据集（n = 376）中，PWAS鉴定了9个基因（p < 3.39×10−5），其大脑中遗传调节的蛋白质丰度水平与帕金森病风险有关。![]()
我们检验了ROS/MAP pQTL和GWAS数据之间共享变异的后验概率，揭示了5个共定位基因。![]()
ROS/MAP pQTL和GWAS数据的孟德尔随机化分析显示4个基因（p < 8.10 × 10−5），具有因果关系的有力证据。![]()
药物-基因相互作用数据库优先筛选CD38、GPNMB、STX4、HLA-DRB5、VKORC1和GAK等6个潜在治疗靶点。![]()
利用多维数据，GPNMB和CD38被优先考虑作为帕金森病的致病基因，对机制和治疗研究至关重要。对这篇文章的思路感兴趣的老师，欢迎扫码咨询！![]()
