文章标题：Tumor microenvironment characteristics of lipid metabolism reprogramming related to ferroptosis and EndMT influencing prognosis in gastric cancer
中文标题：胃癌中与铁死亡和 EndMT 相关的脂质代谢重编程的肿瘤微环境特征影响预后
发表期刊：Int Immunopharmacol
发表时间：20240820
影响因子：4.8/Q1
研究背景
胃癌是一种高度异质性的恶性肿瘤，具有较低的早期诊断率和较差的患者预后。由于缺乏明显的临床指标，许多患者在确诊时已经处于晚期，预后不佳。异常的脂质代谢是肿瘤细胞的关键代谢特征之一。癌细胞通过脂解作用获取脂肪酸，促进脂肪酸合成并增加脂质摄取，脂肪酸在肿瘤的发生和进展中发挥着多种作用。
研究方法
获得在肿瘤和肿瘤邻近组织中表达不同的脂质代谢相关基因 （LMAGs） 以鉴定脂质代谢相关亚型。然后利用两个簇之间的差异表达基因 （DEGs） 进行预后分析和特征构建。此外，采用通路富集分析和免疫细胞浸润分析来确定预后模型的特征。在单细胞水平进行了进一步分析，以更好地了解模型的预后机制。最后，免疫治疗反应的预测用于建议潜在的治疗方法。
研究结果
1.胃癌脂质代谢相关亚型的鉴定
探索胃癌中脂质代谢重编程的情况，发现差异表达的脂质代谢相关基因（DeLMAGs）在肿瘤中上调，主成分分析（PCA）也进一步确认了肿瘤和肿瘤邻近组织样本之间的明显差异。生存分析显示，亚群1的预后明显优于亚群2，且亚群2亚型有更高的免疫细胞浸润水平，炎症反应和EndMT相关的途径显著富集。
2.构建LMAS
根据两种脂质代谢亚型之间的差异表达基因（DEGs），并通过单变量Cox回归分析筛选出与预后显著相关的基因，进而利用LASSO-Cox回归分析鉴定关键预后因子，并据此构建了LMAS模型。低LMAS得分的患者可能具有更高的脂质氧化水平和ROS积累，这可能与铁死亡的敏感性增加有关。
3.低 LMAS 组预后良好可能与铁死亡有关
通过基因集富集分析（GSEA）和预后分析和相关性分析，发现低LMAS组在铁死亡相关基因集显著富集，且铁死亡得分高的患者预后更好。进一步的scRNA-seq分析提示不同细胞类型在肿瘤的不同层（如深层与浅层）中分布不均，且深层细胞的LMAS得分显著高于浅层细胞。
4.不同细胞亚群在胃癌中的特点
通过对胃癌基质细胞的亚群分析，发现肿瘤细胞和胃腺粘膜细胞（PMCs）显示出更高的铁死亡得分，而内皮细胞和肌成纤维细胞则显示出较低的铁死亡得分。对胃癌中的树突细胞和单核巨噬细胞亚群分析，发现特定DC亚群，特别是CD1C-CD141-DCs，在高LMAS组中可能通过分泌促肿瘤细胞因子TNF、IL-6来促进肿瘤的侵袭、转移和血管生成，从而在胃癌的发展中起到促进作用。
5.LMAS 组免疫治疗反应的预测
探索不同LMAS组之间细胞通讯的差异，发现在高LMAS组中，肿瘤细胞、肌成纤维细胞和内皮细胞与其他细胞类型的通讯增加，而在低LMAS组中，肿瘤细胞之间的通讯增强。通过TIDE评分发现低LMAS组的患者可能对PD1/PDL1/PDL2阻断剂治疗有更好的反应。免疫检查点（ICPs）的表达差异分析提示两组之间有42个ICPs的表达存在显著差异，这可能影响免疫疗法的效果和患者的预后。
文章小结
本文通过综合分析胃癌的基因表达数据，揭示了脂质代谢重编程与TME之间的关系，发现了两种基于脂质代谢的胃癌亚型，并通过构建LMAS模型，证明了低LMAS得分与更好的预后相关，这可能与肿瘤细胞对铁死亡的敏感性增加有关。（对这种思路感兴趣的老师，欢迎联系小编！）
